{
"MLE":{
"content":{
"0":{
"by-branch":{
"AVERAGED": [
[275.4214568830522, 720.9549836182974, 0, 1, 0.2764230924051833, 0, 0.001387049153861513, 0.02261041542599665, 0.7235769075948166, 1, 0.001004434828376813],
[274.6499534203776, 718.269494006321, 1, 0, 0.2766084944072499, 0.003640998250851351, 0, -0.05935224630496098, 1, 0.2766084944072499, 0.00100550541364666],
[274.6499534203776, 718.269494006321, 0, 0, 0.2766084944072499, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004566886220238122],
[275.6499534203776, 720.4979905436466, 0, 1, 0.2767158784903668, 0, 0.001387928922945999, 0.02262475662250278, 0.7232841215096332, 1, 0.0005477249601821842],
[275.6499534203776, 720.4979905436464, 0, 1, 0.2767158784903668, 0, 0.001387928922945999, 0.02262475662250278, 0.7232841215096332, 1, 0.001004819268983264],
[274.8409499451802, 718.0784974815185, 0, 0, 0.2768008529367333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003873173355608749],
[275.7454516827789, 720.4024922812451, 0, 1, 0.2768117460399411, 0, 0.001388112910094709, 0.0226277558138824, 0.7231882539600589, 1, 0.0006170985588191439],
[275.4214568830522, 720.9549836182973, 0, 1, 0.2764230924051834, 0, 0.001387049153861513, 0.02261041542599666, 0.7235769075948166, 1, 0.0005441610380259495],
[275.5357978170846, 720.840642684265, 1, 0, 0.2765378491671706, 0.00362929248367159, 0, -0.05916142952094323, 1, 0.2765378491671706, 0.0006161267853720985],
[275.6499534203776, 720.6252589305642, 0, 1, 0.2766805296399152, 0, 0.001387683803207285, 0.02262076090316868, 0.7233194703600847, 1, 0.000619632310092375],
[275.6265356466767, 720.7499048546729, 1, 0, 0.2766289169864242, 0.00362809769985968, 0, -0.05914195324048387, 1, 0.2766289169864242, 0.0006171241326402909],
[275.7641090236708, 720.6123314776788, 1, 0, 0.2767669906816682, 0.003626287712133572, 0, -0.05911244846461538, 1, 0.2767669906816682, 0.0006171241326402909],
[275.8784499577031, 720.4979905436466, 0, 1, 0.2768817474436555, 0, 0.001387928922945999, 0.02262475662250278, 0.7231182525563445, 1, 0.0006171241326402909],
[275.6499534203776, 720.7264870809719, 0, 1, 0.2766524199244194, 0, 0.00138748889894434, 0.022617583750909, 0.7233475800755806, 1, 0.0006163625438484129],
[275.4214568830522, 720.9549836182973, 0, 1, 0.2764230924051834, 0, 0.001387049153861513, 0.02261041542599666, 0.7235769075948166, 1, 0.0006163625438484129],
[275.5357978170845, 720.8406426842649, 1, 0, 0.2765378491671706, 0.003629292483671591, 0, -0.05916142952094325, 1, 0.2765378491671706, 0.0006163497727401007],
[275.7454516827789, 720.5168332152775, 0, 1, 0.2767799763804116, 0, 0.001387892626377013, 0.02262416494880396, 0.7232200236195885, 1, 0.0006163497727401007],
[275.7454516827789, 720.5168332152775, 0, 1, 0.2767799763804116, 0, 0.001387892626377013, 0.02262416494880396, 0.7232200236195885, 1, 0.0006163497727401007],
[275.6499534203776, 720.7264870809719, 1, 0, 0.2766524199244194, 0.003627789475715813, 0, -0.05913692885045575, 1, 0.2766524199244194, 0.0006163497727401007],
[275.5357978170846, 720.8406426842649, 1, 0, 0.2765378491671707, 0.00362929248367159, 0, -0.05916142952094323, 1, 0.2765378491671706, 0.0006163497727401007],
[275.4214568830522, 720.9549836182973, 0, 1, 0.2764230924051834, 0, 0.001387049153861513, 0.02261041542599666, 0.7235769075948166, 1, 0.000616337001631797],
[275.4214568830522, 720.9549836182974, 0, 1, 0.2764230924051833, 0, 0.001387049153861513, 0.02261041542599665, 0.7235769075948166, 1, 0.0006168497364113509],
[275.6499534203776, 720.7264870809719, 1, 0, 0.2766524199244194, 0.003627789475715813, 0, -0.05913692885045575, 1, 0.2766524199244194, 0.000616337001631797],
[275.7641090236707, 720.6123314776788, 1, 0, 0.2767669906816682, 0.003626287712133573, 0, -0.05911244846461539, 1, 0.2767669906816681, 0.0006169414170013331],
[274.4214568830522, 718.8865207721179, 0, 1, 0.2762702636606815, 0, 0.001391040130959686, 0.02267547270957894, 0.7237297363393185, 1, 0.0005492718900688927],
[275.6499534203776, 720.7264870809719, 0, 0, 0.2766524199244194, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004550735492048128],
[275.6639535743498, 720.7124869269998, 0, 1, 0.2766664709932756, 0, 0.001387515851520537, 0.02261802310732467, 0.7233335290067244, 1, 0.0006169286330862046],
[275.9899197292316, 720.3865207721179, 0, 1, 0.2769936226014748, 0, 0.001388143685598378, 0.0226282574881893, 0.7230063773985251, 1, 0.0006128667969845651],
[275.3259586206509, 721.0504818806986, 0, 1, 0.2763272468406764, 0, 0.00138686544857681, 0.02260742082930806, 0.7236727531593237, 1, 0.001004390712565516],
[274.4216422137915, 718.9547982875581, 0, 0, 0.2762514098636092, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004793951075923874],
[275.5357978170846, 720.840642684265, 1, 0, 0.2765378491671706, 0.00362929248367159, 0, -0.05916142952094323, 1, 0.2765378491671706, 0.0005251031100924453],
[275.3259586206509, 721.0504818806986, 0, 1, 0.2763272468406764, 0, 0.00138686544857681, 0.02260742082930806, 0.7236727531593237, 1, 0.001004616192013418],
[275.6499534203776, 720.6252589305642, 0, 1, 0.2766805296399152, 0, 0.001387683803207285, 0.02262076090316868, 0.7233194703600847, 1, 0.001004279553384626],
[275.6499534203776, 720.7264870809719, 0, 1, 0.2766524199244194, 0, 0.00138748889894434, 0.022617583750909, 0.7233475800755806, 1, 0.001004800817988144],
[275.8099871115236, 720.5664533898258, 0, 1, 0.2768130356160806, 0, 0.001387797052299076, 0.02262260698699699, 0.7231869643839194, 1, 0.001004126560580577],
[275.6499534203776, 720.4979905436466, 0, 1, 0.2767158784903668, 0, 0.001387928922945999, 0.02262475662250278, 0.7232841215096332, 1, 0.001004770337377411],
[275.6499534203776, 720.7264870809719, 1, 0, 0.2766524199244194, 0.003627789475715813, 0, -0.05913692885045575, 1, 0.2766524199244194, 0.0006056463308385659],
[275.5633280430579, 721.1167969095146, 0, 1, 0.2764812111169275, 0, 0.001386737910260437, 0.02260534181551975, 0.7235187888830725, 1, 0.0006474113957901971],
[275.6499534203776, 720.8277152313796, 0, 1, 0.276624315920029, 0, 0.001387294049423458, 0.0226144074910047, 0.723375684079971, 1, 0.001004630736213152],
[275.6499534203776, 720.8408280150043, 0, 1, 0.2766206758313622, 0, 0.001387268813218755, 0.02261399611331811, 0.7233793241686377, 1, 0.001004216375274441],
[275.4214568830522, 720.8865207721179, 0, 1, 0.2764420872462167, 0, 0.00138718088240703, 0.0226125627450944, 0.7235579127537833, 1, 0.000616337001631797],
[274.8784499577031, 718.4295276974671, 0, 1, 0.2767303355466737, 0, 0.001391924971687833, 0.02268989657941336, 0.7232696644533263, 1, 0.001004038821195032],
[275.8784499577031, 720.4979905436466, 0, 1, 0.2768817474436555, 0, 0.001387928922945999, 0.02262475662250278, 0.7231182525563445, 1, 0.001004264246622898],
[275.6499534203776, 720.4979905436466, 0, 1, 0.2767158784903668, 0, 0.001387928922945999, 0.02262475662250278, 0.7232841215096332, 1, 0.0006163497727401007],
[275.4214568830522, 720.9549836182973, 0, 1, 0.2764230924051834, 0, 0.001387049153861513, 0.02261041542599666, 0.7235769075948166, 1, 0.0006163497727401007],
[275.7116176866186, 720.8526763424583, 0, 1, 0.2766621474786394, 0, 0.001387246011312478, 0.02261362441735333, 0.7233378525213606, 1, 0.0005454773867296346],
[274.6499534203776, 718.7264870809719, 0, 0, 0.2764812433862071, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003223817284668782],
[275.6499534203776, 720.7264870809719, 0, 0, 0.2766524199244194, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003012033688440114],
[275.6499534203776, 720.7264870809719, 0, 1, 0.2766524199244194, 0, 0.00138748889894434, 0.022617583750909, 0.7233475800755806, 1, 0.001004577226040169],
[275.6499534203776, 720.7264870809719, 0, 0, 0.2766524199244194, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003219219001916975],
[275.9899197292316, 720.3865207721179, 0, 1, 0.2769936226014748, 0, 0.001388143685598378, 0.0226282574881893, 0.7230063773985251, 1, 0.0006158370095825345],
[275.6499534203776, 720.7264870809719, 1, 0, 0.2766524199244194, 0.003627789475715813, 0, -0.05913692885045575, 1, 0.2766524199244194, 0.0005477987677802357],
[275.6499534203776, 720.7264870809719, 1, 0, 0.2766524199244194, 0.003627789475715813, 0, -0.05913692885045575, 1, 0.2766524199244194, 0.001004438127396842],
[275.6499534203776, 720.7264870809719, 0, 1, 0.2766524199244194, 0, 0.00138748889894434, 0.022617583750909, 0.7233475800755806, 1, 0.001003812002132455],
[275.6499534203776, 720.7264870809719, 0, 1, 0.2766524199244194, 0, 0.00138748889894434, 0.022617583750909, 0.7233475800755806, 1, 0.0006158370095825345],
[274.7184162665571, 718.6580242347925, 0, 1, 0.2765501627237191, 0, 0.001391482410656686, 0.02268268235146929, 0.723449837276281, 1, 0.0005568355894909545],
[275.6499534203776, 720.7264870809719, 0, 0, 0.2766524199244194, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004474942418899171],
[275.7454516827789, 720.4024922812451, 0, 1, 0.2768117460399411, 0, 0.001388112910094709, 0.0226277558138824, 0.7231882539600589, 1, 0.0010044803874823],
[275.6499534203776, 720.7264870809719, 1, 0, 0.2766524199244194, 0.003627789475715813, 0, -0.05913692885045575, 1, 0.2766524199244194, 0.0006138101951632642],
[274.6031178729757, 718.7733226283739, 0, 0, 0.2764340955523221, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004561192374193119],
[275.6265356466767, 720.7499048546729, 1, 0, 0.2766289169864242, 0.00362809769985968, 0, -0.05914195324048387, 1, 0.2766289169864242, 0.0005477840062417546],
[275.6499534203776, 720.7264870809719, 1, 0, 0.2766524199244194, 0.003627789475715813, 0, -0.05913692885045575, 1, 0.2766524199244194, 0.001004774310601284],
[274.7941143977782, 718.4454004112124, 0, 0, 0.2766645006573503, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000474009279983953],
[275.7220339090779, 720.5859437460922, 0, 1, 0.2767437781216959, 0, 0.001387759515265209, 0.02262199509236641, 0.7232562218783041, 1, 0.0005303451887401117],
[275.6208798570265, 720.8421860216428, 0, 1, 0.2765991929806121, 0, 0.001387266199719859, 0.02261395351043298, 0.7234008070193878, 1, 0.001004943522147653],
[274.8782646269638, 718.4981758743858, 0, 0, 0.2767110769088049, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004733064393845424],
[275.7641090236708, 720.6123314776788, 1, 0, 0.2767669906816682, 0.003626287712133572, 0, -0.05911244846461538, 1, 0.2767669906816682, 0.0005305474462791071],
[275.7184162665571, 720.6580242347925, 0, 1, 0.2767211317519943, 0, 0.001387620711032556, 0.02261973243184395, 0.7232788682480057, 1, 0.001004609398263929],
[275.5357978170846, 720.8406426842649, 1, 0, 0.2765378491671707, 0.00362929248367159, 0, -0.05916142952094323, 1, 0.2765378491671706, 0.00100441977318833],
[275.6499534203776, 720.7264870809719, 1, 0, 0.2766524199244194, 0.003627789475715813, 0, -0.05913692885045575, 1, 0.2766524199244194, 0.0005303451887401117],
[275.6499534203776, 720.7264870809719, 1, 0, 0.2766524199244194, 0.003627789475715813, 0, -0.05913692885045575, 1, 0.2766524199244194, 0.001004594966834612],
[275.8784499577031, 720.4979905436466, 0, 1, 0.2768817474436555, 0, 0.001387928922945999, 0.02262475662250278, 0.7231182525563445, 1, 0.001003977230672051],
[275.6499534203776, 720.7264870809719, 0, 1, 0.2766524199244194, 0, 0.00138748889894434, 0.022617583750909, 0.7233475800755806, 1, 0.001004663840888954],
[276.1499534203776, 720.2264870809719, 0, 1, 0.277154238293136, 0, 0.001388452129902818, 0.0226332854670751, 0.722845761706864, 1, 0.001004295878166635],
[275.6208798570265, 720.8421860216428, 0, 1, 0.2765991929806121, 0, 0.001387266199719859, 0.02261395351043298, 0.7234008070193878, 1, 0.001004768625691012],
[275.6265356466767, 720.9099385458189, 1, 0, 0.2765844931767499, 0.00362809769985968, 0, -0.05914195324048387, 1, 0.2765844931767498, 0.001003852509688325],
[275.6499534203776, 720.7264870809719, 0, 1, 0.2766524199244194, 0, 0.00138748889894434, 0.022617583750909, 0.7233475800755806, 1, 0.001004392434673258],
[275.7641090236708, 720.6123314776788, 1, 0, 0.2767669906816682, 0.003626287712133572, 0, -0.05911244846461538, 1, 0.2767669906816682, 0.001003846873324286],
[275.6499534203776, 720.4979905436466, 0, 1, 0.2767158784903668, 0, 0.001387928922945999, 0.02262475662250278, 0.7232841215096332, 1, 0.001004680367458974],
[275.5357978170846, 720.840642684265, 1, 0, 0.2765378491671706, 0.00362929248367159, 0, -0.05916142952094323, 1, 0.2765378491671706, 0.001004822721973722],
[275.9899197292316, 720.3865207721179, 0, 1, 0.2769936226014748, 0, 0.001388143685598378, 0.0226282574881893, 0.7230063773985251, 1, 0.00100496722351498],
[275.6265356466767, 720.9099385458189, 1, 0, 0.2765844931767499, 0.00362809769985968, 0, -0.05914195324048387, 1, 0.2765844931767498, 0.001004106276560494],
[275.6499534203776, 720.6121461469396, 0, 1, 0.2766841713040114, 0, 0.001387709054512787, 0.02262117252701479, 0.7233158286959886, 1, 0.001004818644283623]
],
"NAMES": [
["Node1007"],
["Node257"],
["Node256"],
["Node255"],
["Node165"],
["Node282"],
["Node281"],
["Node305"],
["Node651"],
["Node648"],
["Node645"],
["Node642"],
["Node639"],
["Node636"],
["Node633"],
["Node630"],
["Node627"],
["Node609"],
["Node606"],
["Node592"],
["Node334"],
["Node328"],
["Node589"],
["Node347"],
["Node342"],
["Node341"],
["Node586"],
["Node583"],
["Node42"],
["Node466"],
["Node465"],
["Node459"],
["Node456"],
["Node446"],
["Node524"],
["Node521"],
["Node518"],
["Node510"],
["Node509"],
["Node528"],
["Node603"],
["Node598"],
["Node597"],
["Node624"],
["Node621"],
["Node615"],
["Node665"],
["Node664"],
["Node673"],
["Node689"],
["Node695"],
["Node709"],
["Node713"],
["Node716"],
["Node720"],
["Node728"],
["Node727"],
["Node733"],
["Node784"],
["Node751"],
["Node750"],
["Node756"],
["Node762"],
["Node761"],
["Node780"],
["Node796"],
["Node795"],
["Node808"],
["Node812"],
["Node820"],
["Node823"],
["Node830"],
["Node833"],
["Node851"],
["Node870"],
["Node863"],
["Node866"],
["Node915"],
["Node925"],
["Node986"],
["Node983"],
["Node947"],
["Node978"]
],
"RESOLVED": [
[275.4214568830522, 720.9549836182974, 0, 1, 0.2764230924051833, 0, 0.001387049153861513, 0.02261041542599665, 0.7235769075948166, 1, 0.001004434828376813],
[274.6499534203776, 718.269494006321, 1, 0, 0.2766084944072499, 0.003640998250851351, 0, -0.05935224630496098, 1, 0.2766084944072499, 0.00100550541364666],
[274.6499534203776, 718.269494006321, 0, 0, 0.2766084944072499, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004566886220238122],
[275.6499534203776, 720.4979905436466, 0, 1, 0.2767158784903668, 0, 0.001387928922945999, 0.02262475662250278, 0.7232841215096332, 1, 0.0005477249601821842],
[275.6499534203776, 720.4979905436464, 0, 1, 0.2767158784903668, 0, 0.001387928922945999, 0.02262475662250278, 0.7232841215096332, 1, 0.001004819268983264],
[274.8409499451802, 718.0784974815185, 0, 0, 0.2768008529367333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003873173355608749],
[275.7454516827789, 720.4024922812451, 0, 1, 0.2768117460399411, 0, 0.001388112910094709, 0.0226277558138824, 0.7231882539600589, 1, 0.0006170985588191439],
[275.4214568830522, 720.9549836182973, 0, 1, 0.2764230924051834, 0, 0.001387049153861513, 0.02261041542599666, 0.7235769075948166, 1, 0.0005441610380259495],
[275.5357978170846, 720.840642684265, 1, 0, 0.2765378491671706, 0.00362929248367159, 0, -0.05916142952094323, 1, 0.2765378491671706, 0.0006161267853720985],
[275.6499534203776, 720.6252589305642, 0, 1, 0.2766805296399152, 0, 0.001387683803207285, 0.02262076090316868, 0.7233194703600847, 1, 0.000619632310092375],
[275.6265356466767, 720.7499048546729, 1, 0, 0.2766289169864242, 0.00362809769985968, 0, -0.05914195324048387, 1, 0.2766289169864242, 0.0006171241326402909],
[275.7641090236708, 720.6123314776788, 1, 0, 0.2767669906816682, 0.003626287712133572, 0, -0.05911244846461538, 1, 0.2767669906816682, 0.0006171241326402909],
[275.8784499577031, 720.4979905436466, 0, 1, 0.2768817474436555, 0, 0.001387928922945999, 0.02262475662250278, 0.7231182525563445, 1, 0.0006171241326402909],
[275.6499534203776, 720.7264870809719, 0, 1, 0.2766524199244194, 0, 0.00138748889894434, 0.022617583750909, 0.7233475800755806, 1, 0.0006163625438484129],
[275.4214568830522, 720.9549836182973, 0, 1, 0.2764230924051834, 0, 0.001387049153861513, 0.02261041542599666, 0.7235769075948166, 1, 0.0006163625438484129],
[275.5357978170845, 720.8406426842649, 1, 0, 0.2765378491671706, 0.003629292483671591, 0, -0.05916142952094325, 1, 0.2765378491671706, 0.0006163497727401007],
[275.7454516827789, 720.5168332152775, 0, 1, 0.2767799763804116, 0, 0.001387892626377013, 0.02262416494880396, 0.7232200236195885, 1, 0.0006163497727401007],
[275.7454516827789, 720.5168332152775, 0, 1, 0.2767799763804116, 0, 0.001387892626377013, 0.02262416494880396, 0.7232200236195885, 1, 0.0006163497727401007],
[275.6499534203776, 720.7264870809719, 1, 0, 0.2766524199244194, 0.003627789475715813, 0, -0.05913692885045575, 1, 0.2766524199244194, 0.0006163497727401007],
[275.5357978170846, 720.8406426842649, 1, 0, 0.2765378491671707, 0.00362929248367159, 0, -0.05916142952094323, 1, 0.2765378491671706, 0.0006163497727401007],
[275.4214568830522, 720.9549836182973, 0, 1, 0.2764230924051834, 0, 0.001387049153861513, 0.02261041542599666, 0.7235769075948166, 1, 0.000616337001631797],
[275.4214568830522, 720.9549836182974, 0, 1, 0.2764230924051833, 0, 0.001387049153861513, 0.02261041542599665, 0.7235769075948166, 1, 0.0006168497364113509],
[275.6499534203776, 720.7264870809719, 1, 0, 0.2766524199244194, 0.003627789475715813, 0, -0.05913692885045575, 1, 0.2766524199244194, 0.000616337001631797],
[275.7641090236707, 720.6123314776788, 1, 0, 0.2767669906816682, 0.003626287712133573, 0, -0.05911244846461539, 1, 0.2767669906816681, 0.0006169414170013331],
[274.4214568830522, 718.8865207721179, 0, 1, 0.2762702636606815, 0, 0.001391040130959686, 0.02267547270957894, 0.7237297363393185, 1, 0.0005492718900688927],
[275.6499534203776, 720.7264870809719, 0, 0, 0.2766524199244194, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004550735492048128],
[275.6639535743498, 720.7124869269998, 0, 1, 0.2766664709932756, 0, 0.001387515851520537, 0.02261802310732467, 0.7233335290067244, 1, 0.0006169286330862046],
[275.9899197292316, 720.3865207721179, 0, 1, 0.2769936226014748, 0, 0.001388143685598378, 0.0226282574881893, 0.7230063773985251, 1, 0.0006128667969845651],
[275.3259586206509, 721.0504818806986, 0, 1, 0.2763272468406764, 0, 0.00138686544857681, 0.02260742082930806, 0.7236727531593237, 1, 0.001004390712565516],
[274.4216422137915, 718.9547982875581, 0, 0, 0.2762514098636092, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004793951075923874],
[275.5357978170846, 720.840642684265, 1, 0, 0.2765378491671706, 0.00362929248367159, 0, -0.05916142952094323, 1, 0.2765378491671706, 0.0005251031100924453],
[275.3259586206509, 721.0504818806986, 0, 1, 0.2763272468406764, 0, 0.00138686544857681, 0.02260742082930806, 0.7236727531593237, 1, 0.001004616192013418],
[275.6499534203776, 720.6252589305642, 0, 1, 0.2766805296399152, 0, 0.001387683803207285, 0.02262076090316868, 0.7233194703600847, 1, 0.001004279553384626],
[275.6499534203776, 720.7264870809719, 0, 1, 0.2766524199244194, 0, 0.00138748889894434, 0.022617583750909, 0.7233475800755806, 1, 0.001004800817988144],
[275.8099871115236, 720.5664533898258, 0, 1, 0.2768130356160806, 0, 0.001387797052299076, 0.02262260698699699, 0.7231869643839194, 1, 0.001004126560580577],
[275.6499534203776, 720.4979905436466, 0, 1, 0.2767158784903668, 0, 0.001387928922945999, 0.02262475662250278, 0.7232841215096332, 1, 0.001004770337377411],
[275.6499534203776, 720.7264870809719, 1, 0, 0.2766524199244194, 0.003627789475715813, 0, -0.05913692885045575, 1, 0.2766524199244194, 0.0006056463308385659],
[275.5633280430579, 721.1167969095146, 0, 1, 0.2764812111169275, 0, 0.001386737910260437, 0.02260534181551975, 0.7235187888830725, 1, 0.0006474113957901971],
[275.6499534203776, 720.8277152313796, 0, 1, 0.276624315920029, 0, 0.001387294049423458, 0.0226144074910047, 0.723375684079971, 1, 0.001004630736213152],
[275.6499534203776, 720.8408280150043, 0, 1, 0.2766206758313622, 0, 0.001387268813218755, 0.02261399611331811, 0.7233793241686377, 1, 0.001004216375274441],
[275.4214568830522, 720.8865207721179, 0, 1, 0.2764420872462167, 0, 0.00138718088240703, 0.0226125627450944, 0.7235579127537833, 1, 0.000616337001631797],
[274.8784499577031, 718.4295276974671, 0, 1, 0.2767303355466737, 0, 0.001391924971687833, 0.02268989657941336, 0.7232696644533263, 1, 0.001004038821195032],
[275.8784499577031, 720.4979905436466, 0, 1, 0.2768817474436555, 0, 0.001387928922945999, 0.02262475662250278, 0.7231182525563445, 1, 0.001004264246622898],
[275.6499534203776, 720.4979905436466, 0, 1, 0.2767158784903668, 0, 0.001387928922945999, 0.02262475662250278, 0.7232841215096332, 1, 0.0006163497727401007],
[275.4214568830522, 720.9549836182973, 0, 1, 0.2764230924051834, 0, 0.001387049153861513, 0.02261041542599666, 0.7235769075948166, 1, 0.0006163497727401007],
[275.7116176866186, 720.8526763424583, 0, 1, 0.2766621474786394, 0, 0.001387246011312478, 0.02261362441735333, 0.7233378525213606, 1, 0.0005454773867296346],
[274.6499534203776, 718.7264870809719, 0, 0, 0.2764812433862071, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003223817284668782],
[275.6499534203776, 720.7264870809719, 0, 0, 0.2766524199244194, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003012033688440114],
[275.6499534203776, 720.7264870809719, 0, 1, 0.2766524199244194, 0, 0.00138748889894434, 0.022617583750909, 0.7233475800755806, 1, 0.001004577226040169],
[275.6499534203776, 720.7264870809719, 0, 0, 0.2766524199244194, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003219219001916975],
[275.9899197292316, 720.3865207721179, 0, 1, 0.2769936226014748, 0, 0.001388143685598378, 0.0226282574881893, 0.7230063773985251, 1, 0.0006158370095825345],
[275.6499534203776, 720.7264870809719, 1, 0, 0.2766524199244194, 0.003627789475715813, 0, -0.05913692885045575, 1, 0.2766524199244194, 0.0005477987677802357],
[275.6499534203776, 720.7264870809719, 1, 0, 0.2766524199244194, 0.003627789475715813, 0, -0.05913692885045575, 1, 0.2766524199244194, 0.001004438127396842],
[275.6499534203776, 720.7264870809719, 0, 1, 0.2766524199244194, 0, 0.00138748889894434, 0.022617583750909, 0.7233475800755806, 1, 0.001003812002132455],
[275.6499534203776, 720.7264870809719, 0, 1, 0.2766524199244194, 0, 0.00138748889894434, 0.022617583750909, 0.7233475800755806, 1, 0.0006158370095825345],
[274.7184162665571, 718.6580242347925, 0, 1, 0.2765501627237191, 0, 0.001391482410656686, 0.02268268235146929, 0.723449837276281, 1, 0.0005568355894909545],
[275.6499534203776, 720.7264870809719, 0, 0, 0.2766524199244194, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004474942418899171],
[275.7454516827789, 720.4024922812451, 0, 1, 0.2768117460399411, 0, 0.001388112910094709, 0.0226277558138824, 0.7231882539600589, 1, 0.0010044803874823],
[275.6499534203776, 720.7264870809719, 1, 0, 0.2766524199244194, 0.003627789475715813, 0, -0.05913692885045575, 1, 0.2766524199244194, 0.0006138101951632642],
[274.6031178729757, 718.7733226283739, 0, 0, 0.2764340955523221, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004561192374193119],
[275.6265356466767, 720.7499048546729, 1, 0, 0.2766289169864242, 0.00362809769985968, 0, -0.05914195324048387, 1, 0.2766289169864242, 0.0005477840062417546],
[275.6499534203776, 720.7264870809719, 1, 0, 0.2766524199244194, 0.003627789475715813, 0, -0.05913692885045575, 1, 0.2766524199244194, 0.001004774310601284],
[274.7941143977782, 718.4454004112124, 0, 0, 0.2766645006573503, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000474009279983953],
[275.7220339090779, 720.5859437460922, 0, 1, 0.2767437781216959, 0, 0.001387759515265209, 0.02262199509236641, 0.7232562218783041, 1, 0.0005303451887401117],
[275.6208798570265, 720.8421860216428, 0, 1, 0.2765991929806121, 0, 0.001387266199719859, 0.02261395351043298, 0.7234008070193878, 1, 0.001004943522147653],
[274.8782646269638, 718.4981758743858, 0, 0, 0.2767110769088049, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004733064393845424],
[275.7641090236708, 720.6123314776788, 1, 0, 0.2767669906816682, 0.003626287712133572, 0, -0.05911244846461538, 1, 0.2767669906816682, 0.0005305474462791071],
[275.7184162665571, 720.6580242347925, 0, 1, 0.2767211317519943, 0, 0.001387620711032556, 0.02261973243184395, 0.7232788682480057, 1, 0.001004609398263929],
[275.5357978170846, 720.8406426842649, 1, 0, 0.2765378491671707, 0.00362929248367159, 0, -0.05916142952094323, 1, 0.2765378491671706, 0.00100441977318833],
[275.6499534203776, 720.7264870809719, 1, 0, 0.2766524199244194, 0.003627789475715813, 0, -0.05913692885045575, 1, 0.2766524199244194, 0.0005303451887401117],
[275.6499534203776, 720.7264870809719, 1, 0, 0.2766524199244194, 0.003627789475715813, 0, -0.05913692885045575, 1, 0.2766524199244194, 0.001004594966834612],
[275.8784499577031, 720.4979905436466, 0, 1, 0.2768817474436555, 0, 0.001387928922945999, 0.02262475662250278, 0.7231182525563445, 1, 0.001003977230672051],
[275.6499534203776, 720.7264870809719, 0, 1, 0.2766524199244194, 0, 0.00138748889894434, 0.022617583750909, 0.7233475800755806, 1, 0.001004663840888954],
[276.1499534203776, 720.2264870809719, 0, 1, 0.277154238293136, 0, 0.001388452129902818, 0.0226332854670751, 0.722845761706864, 1, 0.001004295878166635],
[275.6208798570265, 720.8421860216428, 0, 1, 0.2765991929806121, 0, 0.001387266199719859, 0.02261395351043298, 0.7234008070193878, 1, 0.001004768625691012],
[275.6265356466767, 720.9099385458189, 1, 0, 0.2765844931767499, 0.00362809769985968, 0, -0.05914195324048387, 1, 0.2765844931767498, 0.001003852509688325],
[275.6499534203776, 720.7264870809719, 0, 1, 0.2766524199244194, 0, 0.00138748889894434, 0.022617583750909, 0.7233475800755806, 1, 0.001004392434673258],
[275.7641090236708, 720.6123314776788, 1, 0, 0.2767669906816682, 0.003626287712133572, 0, -0.05911244846461538, 1, 0.2767669906816682, 0.001003846873324286],
[275.6499534203776, 720.4979905436466, 0, 1, 0.2767158784903668, 0, 0.001387928922945999, 0.02262475662250278, 0.7232841215096332, 1, 0.001004680367458974],
[275.5357978170846, 720.840642684265, 1, 0, 0.2765378491671706, 0.00362929248367159, 0, -0.05916142952094323, 1, 0.2765378491671706, 0.001004822721973722],
[275.9899197292316, 720.3865207721179, 0, 1, 0.2769936226014748, 0, 0.001388143685598378, 0.0226282574881893, 0.7230063773985251, 1, 0.00100496722351498],
[275.6265356466767, 720.9099385458189, 1, 0, 0.2765844931767499, 0.00362809769985968, 0, -0.05914195324048387, 1, 0.2765844931767498, 0.001004106276560494],
[275.6499534203776, 720.6121461469396, 0, 1, 0.2766841713040114, 0, 0.001387709054512787, 0.02262117252701479, 0.7233158286959886, 1, 0.001004818644283623]
]
},
"by-site":{
"AVERAGED": [
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1.190996524802546, 1.352010400546581, 0, 0, 0.4683418330207792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 1.976303345091921, 0, 0, 0.2469196896635653, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5448749448009105, 2.455125055199089, 1, 0, 0.1816249816003035, 1.835283507787986, 0, -29.91712472484581, 1, 0.1816249816003035, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.9962587383998268, 2.003741261600174, 0, 1, 0.3320862461332755, 0, 0.4990664309629513, 8.135327647060768, 0.6679137538667245, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5441549675438022, 2.455845032456197, 1, 0, 0.1813849891812674, 1.837711791024869, 0, -29.95670839252266, 1, 0.1813849891812674, 0.06134558466655737],
[0.6011540520514875, 2.225595193309174, 0, 0, 0.2126662112099678, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 1.62429294454534, 0, 0, 0.3810550198210629, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.7694490463965041, 2.230550953603495, 1, 0, 0.2564830154655014, 1.299631216236105, 0, -21.18540761002154, 1, 0.2564830154655013, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 1.62429294454534, 0, 0, 0.3810550198210629, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 1.580692268611304, 0, 0, 0.2907501553894282, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6011540520514875, 1.627527816013236, 0, 0, 0.2697352460508416, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 1.976303345091921, 0, 0, 0.2469196896635653, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1.002166547208049, 1.992649604180013, 0, 1, 0.3346337459625215, 0, 0.5018443774069881, 8.18061120673562, 0.6653662540374785, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.9721404861470407, 2.027859513852959, 0, 1, 0.3240468287156802, 0, 0.4931308077155637, 8.038570508309045, 0.6759531712843198, 1, 0.06134558466655737],
[0.6799326177079694, 2.320067382292031, 0, 0, 0.2266442059026565, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.7713181319352767, 2.228681868064723, 0, 0, 0.2571060439784256, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.7713181319352767, 2, 0, 0, 0.2783217570898823, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.9946941507901051, 2.005305849209895, 0, 1, 0.331564716930035, 0, 0.4986770473910537, 8.12898026975539, 0.668435283069965, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 2.17710245472985, 0, 1, 0.2293693752364301, 0, 0.4593261092639238, 7.487517019530928, 0.7706306247635699, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.444060345926909, 0, 1, 0.1817859713340707, 0, 0.4091552001432887, 6.669676430133369, 0.8182140286659293, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6485379105174761, 1.977425404470164, 0, 1, 0.2469714282815594, 0, 0.5057080776546118, 8.243593738707967, 0.7530285717184406, 1, 0.06134558466655737],
[1.144160977400614, 1.718913330240544, 0, 0, 0.3996267139651259, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 1.976303345091921, 0, 0, 0.2469196896635653, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 2.178759645907242, 0, 0, 0.2292349066748378, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1.190996524802546, 1.352010400546581, 0, 0, 0.4683418330207792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6011540520514875, 2.023138892493852, 0, 0, 0.2290727692199918, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0, 1.797691895897025, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6011540520514875, 2.225595193309174, 0, 0, 0.2126662112099678, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.7713181319352767, 2.228681868064723, 0, 0, 0.2571060439784256, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6799326177079694, 2.320067382292031, 0, 0, 0.2266442059026565, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 2.178759645907242, 0, 0, 0.2292349066748378, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 1.998127136566633, 0, 1, 0.3335415592632842, 0, 0.500468654721487, 8.158185425108814, 0.6664584407367158, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6011540520514875, 2.023138892493852, 0, 0, 0.2290727692199918, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 2.178759645907242, 0, 0, 0.2292349066748378, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.3520104005465807, 2.647989599453419, 0, 0, 0.1173368001821936, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5457557153228959, 2.454244284677103, 1, 0, 0.1819185717742987, 1.832321626551086, 0, -29.86884282724879, 1, 0.1819185717742987, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1.144160977400614, 1.718913330240544, 0, 0, 0.3996267139651259, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.9977023932596581, 2.002297606740342, 0, 1, 0.332567464419886, 0, 0.4994262574323098, 8.141193211327769, 0.6674325355801141, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.7713181319352767, 2.228681868064723, 0, 0, 0.2571060439784256, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6799326177079694, 2.320067382292031, 0, 0, 0.2266442059026565, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 8.150545841526155, 0.6666666666666667, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -16.30109168305231, 1, 0.3333333333333333, 0.06134558466655737],
[0.9719996920556649, 2.028000307944335, 0, 0, 0.3239998973518883, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0, 1.797691895897025, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.7713181319352767, 2.228681868064723, 0, 0, 0.2571060439784256, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.7713181319352767, 2, 0, 0, 0.2783217570898823, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 2.178759645907242, 0, 0, 0.2292349066748378, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.8267492453606603, 2, 0, 0, 0.2924734999814873, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 8.150545841526155, 0.6666666666666667, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.453250898480722, 0, 1, 0.1812283712804959, 0, 0.4076223922385158, 6.644689987945158, 0.8187716287195042, 1, 0.06134558466655737],
[0.3520104005465807, 2.647989599453419, 0, 0, 0.1173368001821936, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6799326177079694, 2.320067382292031, 0, 0, 0.2266442059026565, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.320067382292031, 0, 0, 0.1896586909742141, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0, 3.000000000000002, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.7713181319352767, 2.228681868064723, 0, 0, 0.2571060439784256, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.3520104005465807, 2.647989599453419, 0, 0, 0.1173368001821936, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6006777783422331, 2.227490535925575, 0, 1, 0.2123910996781478, 0, 0.4489356896793622, 7.318141837257606, 0.7876089003218523, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 2.178759645907242, 0, 0, 0.2292349066748378, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 1.976303345091921, 0, 0, 0.2469196896635653, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 2, 0, 0.3333333333333333, 2, 0, -32.60218336610462, 1, 0.1111111111111109, 0.06134558466655737],
[0.6799326177079694, 2.320067382292031, 0, 0, 0.2266442059026565, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.320067382292031, 0, 0, 0.1896586909742141, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -16.30109168305231, 1, 0.3333333333333333, 0.06134558466655737],
[0.54674648251545, 2.45325351748455, 0, 1, 0.18224882750515, 0, 0.4076219570757419, 6.644682894316885, 0.81775117249485, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.8267492453606603, 2, 0, 0, 0.2924734999814873, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 1.580692268611304, 0, 0, 0.2907501553894282, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.7685568127842679, 2.231443187215732, 1, 0, 0.2561856042614226, 1.301139985185061, 0, -21.21000219098701, 1, 0.2561856042614226, 0.06134558466655737],
[1.190996524802546, 1.352010400546581, 0, 0, 0.4683418330207792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.8267492453606603, 2, 0, 0, 0.2924734999814873, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -16.30109168305231, 1, 0.3333333333333333, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6799326177079694, 2.320067382292031, 0, 0, 0.2266442059026565, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6474322573684738, 1.976860687176866, 1, 0, 0.2467073116643392, 1.544563139415633, 0, -25.17806534587735, 1, 0.2467073116643392, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5516085014604035, 2.447270972005416, 0, 3, 0.183938203032517, 0, 1.225855262583224, 19.9827790255213, 0.5434619489935592, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 8.150545841526155, 0.6666666666666667, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 2.178759645907242, 0, 0, 0.2292349066748378, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1.190996524802546, 1.352010400546581, 0, 0, 0.4683418330207792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 1.580692268611304, 0, 0, 0.2907501553894282, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -16.30109168305231, 1, 0.3333333333333333, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 2.178759645907242, 0, 0, 0.2292349066748378, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 1.580692268611304, 0, 0, 0.2907501553894282, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5436283645206291, 2.45637163547937, 0, 1, 0.1812094548402097, 0, 0.4071045217898578, 6.636248134281641, 0.8187905451597903, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[7.059145356595169, 14.11829071319034, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.007816911596836605],
[1, 1.62429294454534, 0, 0, 0.3810550198210629, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1.190996524802546, 1.352010400546581, 0, 0, 0.4683418330207792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6799326177079694, 2.320067382292031, 0, 0, 0.2266442059026565, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.9990857979959565, 1.626275459102029, 0, 1, 0.3805517413250484, 0, 0.6149019801062262, 10.023573553802, 0.6194482586749517, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 1.980097740871701, 0, 1, 0.2465631904658301, 0, 0.5050255749293309, 8.232468199209229, 0.7534368095341699, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0.4999999999999999, -8.150545841526155, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.06134558466655737],
[1.00156370066635, 1.994694868037518, 0, 1, 0.3342714514453972, 0, 0.5013298104004503, 8.172223202784975, 0.6657285485546028, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 2.17773717243952, 0, 1, 0.22931785404692, 0, 0.4591922352502215, 7.485334726959587, 0.7706821459530799, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6011540520514875, 1.627527816013236, 0, 0, 0.2697352460508416, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.7701716056567925, 2.229828394343207, 1, 0, 0.2567238685522642, 1.298411928789835, 0, -21.16553189357189, 1, 0.2567238685522641, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2, 0, 0, 0.2135294717196169, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2, 0, 0, 0.2135294717196169, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6011540520514875, 2.225595193309174, 0, 0, 0.2126662112099678, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 2.178759645907242, 0, 0, 0.2292349066748378, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.453250563365897, 0, 1, 0.1812283915498866, 0, 0.4076224479198671, 6.64469089561197, 0.8187716084501133, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -16.30109168305231, 1, 0.3333333333333333, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 1.580692268611304, 0, 0, 0.2907501553894282, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 1.580692268611304, 0, 0, 0.2907501553894282, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1.190996524802546, 1.352010400546581, 0, 0, 0.4683418330207792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 1.976303345091921, 0, 0, 0.2469196896635653, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.7713181319352767, 2, 0, 0, 0.2783217570898823, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6011540520514875, 1.627527816013236, 0, 0, 0.2697352460508416, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.8267492453606603, 2, 0, 0, 0.2924734999814873, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1.190996524802546, 1.352010400546581, 0, 0, 0.4683418330207792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 1.580692268611304, 0, 0, 0.2907501553894282, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 1.976303345091921, 0, 0, 0.2469196896635653, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 2.178759645907242, 0, 0, 0.2292349066748378, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0.4999999999999999, -8.150545841526155, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.06134558466655737],
[0.7799136979587284, 2.220086302041271, 0, 0, 0.2599712326529095, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6477540214022502, 1.580927846662473, 1, 0, 0.2906444525277749, 1.543795896218771, 0, -25.16555844418211, 1, 0.2906444525277749, 0.06134558466655737],
[0, 3.000000000000002, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 1.976303345091921, 0, 0, 0.2469196896635653, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6799326177079694, 2.320067382292031, 0, 0, 0.2266442059026565, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5464539363479768, 2.453546063652023, 1, 1, 0.1821513121159923, 1.829980412773913, 0.4075733546699885, -23.18678786477279, 0.9668208994944224, 0.3311235237264069, 0.06134558466655737],
[0.7694482965648424, 2.230551703435157, 1, 0, 0.2564827655216141, 1.299632482733983, 0, -21.18542825531956, 1, 0.2564827655216142, 0.06134558466655737],
[1.190996524802546, 1.352010400546581, 0, 0, 0.4683418330207792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 1.976303345091921, 0, 0, 0.2469196896635653, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1.190613222015817, 1.355013139346745, 1, 0, 0.4677093386865045, 0.839903321673943, 0, -13.69134105150713, 1, 0.4677093386865045, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 8.150545841526155, 0.6666666666666667, 1, 0.06134558466655737],
[0.01159841866295961, 2.988401581337042, 0, 2, 0.003866139554319868, 0, 0.6692540964006515, 10.90957238468535, 0.9922826679264136, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 1.976303345091921, 0, 0, 0.2469196896635653, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.7713181319352767, 2.228681868064723, 0, 0, 0.2571060439784256, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6825521066368125, 2.317447893363187, 0, 1, 0.2275173688789375, 0, 0.4315091626715084, 7.034070422785393, 0.7724826311210625, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 1.976303345091921, 0, 0, 0.2469196896635653, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1.200681560120389, 1.799318439879612, 0, 0, 0.4002271867067962, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2, 0, 0, 0.2135294717196169, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 2.178759645907242, 0, 0, 0.2292349066748378, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1.190996524802546, 1.352010400546581, 0, 0, 0.4683418330207792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 1.976303345091921, 0, 0, 0.2469196896635653, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2, 0, 0, 0.2135294717196169, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.7713181319352767, 2.228681868064723, 0, 0, 0.2571060439784256, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 1.976303345091921, 0, 0, 0.2469196896635653, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.454697330146718, 0, 1, 0.1811409262116515, 0, 0.4073822005339573, 6.640774600947641, 0.8188590737883485, 1, 0.06134558466655737],
[0.9719996920556649, 2.028000307944335, 0, 0, 0.3239998973518883, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2, 0, 0, 0.2135294717196169, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 1.62429294454534, 0, 0, 0.3810550198210629, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6011540520514875, 1.627527816013236, 0, 0, 0.2697352460508416, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1.190613318887584, 1.355012380467281, 1, 0, 0.4677094983717833, 0.8399032533369626, 0, -13.69133993753974, 1, 0.4677094983717833, 0.06134558466655737],
[0.9979541033700613, 2.001432898691704, 0, 1, 0.3327193532158645, 0, 0.4996420317931617, 8.14471056896687, 0.6672806467841355, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1.190996524802546, 1.352010400546581, 0, 0, 0.4683418330207792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1.771318131935276, 1.228681868064724, 0, 0, 0.5904393773117587, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1.771318131935276, 1.228681868064724, 0, 0, 0.5904393773117587, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6799326177079694, 2.320067382292031, 0, 0, 0.2266442059026565, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 1.62429294454534, 0, 0, 0.3810550198210629, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1.771318131935276, 1.228681868064724, 0, 0, 0.5904393773117587, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 2.178759645907242, 0, 0, 0.2292349066748378, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.9977043030649412, 2.001607853049199, 0, 1, 0.3326443701537057, 0, 0.4995983596270493, 8.143998664983073, 0.6673556298462944, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6011540520514875, 2.225595193309174, 0, 0, 0.2126662112099678, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 1.976303345091921, 0, 0, 0.2469196896635653, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1.000959487673776, 1.771083443909502, 0, 2, 0.3610909038490498, 0, 1.129252270342037, 18.40804479214053, 0.4082048331444242, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 1.976303345091921, 0, 0, 0.2469196896635653, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1.190996524802546, 1.352010400546581, 0, 0, 0.4683418330207792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 1.976303345091921, 0, 0, 0.2469196896635653, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6799326177079694, 2.320067382292031, 0, 0, 0.2266442059026565, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.003396398680076343, 2.996603601319926, 0, 1, 0.00113213289335878, 0, 0.3337111386903246, 5.439855867446768, 0.9988678671066412, 1, 0.06134558466655737],
[0.7713181319352767, 2.228681868064723, 0, 0, 0.2571060439784256, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 2.178759645907242, 0, 0, 0.2292349066748378, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.7713181319352767, 2.228681868064723, 0, 0, 0.2571060439784256, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2, 0, 0, 0.2135294717196169, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.7701711907083059, 2.229828809291694, 1, 0, 0.256723730236102, 1.298412628340885, 0, -21.16554329701769, 1, 0.2567237302361021, 0.06134558466655737],
[0.3520104005465807, 2.647989599453419, 0, 0, 0.1173368001821936, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 1.580692268611304, 0, 0, 0.2907501553894282, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 8.150545841526155, 0.6666666666666667, 1, 0.06134558466655737],
[1.000959487673776, 1.76921170303453, 0, 1, 0.3613348846566555, 0, 0.5652234824610375, 9.213759809011483, 0.6386651153433445, 1, 0.06134558466655737],
[0.9977042079267485, 2.002295792073252, 0, 1, 0.3325680693089161, 0, 0.4994267100589382, 8.141200589635938, 0.6674319306910839, 1, 0.06134558466655737],
[0.6006778612310546, 2.227490206067527, 0, 1, 0.2123911475334675, 0, 0.4489357561600362, 7.318142920965167, 0.7876088524665326, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.320067382292031, 0, 0, 0.1896586909742141, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.320067382292031, 0, 0, 0.1896586909742141, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6799326177079694, 2.320067382292031, 0, 0, 0.2266442059026565, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1.190996524802546, 1.352010400546581, 0, 0, 0.4683418330207792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1.190996524802546, 1.352010400546581, 0, 0, 0.4683418330207792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 1.976303345091921, 0, 0, 0.2469196896635653, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.3520104005465807, 2.647989599453419, 0, 0, 0.1173368001821936, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.3520104005465807, 2.647989599453419, 0, 0, 0.1173368001821936, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 2.178759645907242, 0, 0, 0.2292349066748378, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 1.580692268611304, 0, 0, 0.2907501553894282, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1.190996524802546, 1.352010400546581, 0, 0, 0.4683418330207792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.997704255495845, 2.002295744504155, 0, 1, 0.3325680851652816, 0, 0.4994267219239574, 8.141200783048703, 0.6674319148347184, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6011540520514875, 2.225595193309174, 0, 0, 0.2126662112099678, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.9979731399804536, 2.002026860019547, 0, 1, 0.3326577133268178, 0, 0.4994937979954157, 8.142294196239284, 0.6673422866731822, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 2.178759645907242, 0, 0, 0.2292349066748378, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1.00173706358922, 1.996613054182496, 0, 1, 0.3340960942658961, 0, 0.5008481728120551, 8.164371984298539, 0.6659039057341039, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6799326177079694, 2.320067382292031, 0, 0, 0.2266442059026565, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.770171190708306, 2.229828809291694, 1, 0, 0.256723730236102, 1.298412628340884, 0, -21.16554329701768, 1, 0.2567237302361021, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2, 0, 0, 0.2135294717196169, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.9946953416528047, 2.005304658347196, 0, 1, 0.3315651138842682, 0, 0.4986773435335338, 8.12898509720111, 0.6684348861157319, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 1.976303345091921, 0, 0, 0.2469196896635653, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6799326177079694, 2.320067382292031, 0, 0, 0.2266442059026565, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 1.771318131935276, 0, 0, 0.360839121455059, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.005569349438181798, 2.99443065056182, 0, 1, 0.001856449812727265, 0, 0.3339533008762045, 5.443803375440964, 0.9981435501872727, 1, 0.06134558466655737],
[0.9977043030649412, 2.002295696935059, 0, 1, 0.332568101021647, 0, 0.499426733788977, 8.141200976461475, 0.667431898978353, 1, 0.06134558466655737],
[0, 1.797691895897025, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.320067382292031, 0, 0, 0.1896586909742141, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 2.178759645907242, 0, 0, 0.2292349066748378, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -16.30109168305231, 1, 0.3333333333333333, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.453250381108241, 0, 1, 0.1812284025737269, 0, 0.4076224782030834, 6.644691389261457, 0.818771597426273, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 1.976303345091921, 0, 0, 0.2469196896635653, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.7713181319352767, 2, 0, 0, 0.2783217570898823, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 2.178759645907242, 0, 0, 0.2292349066748378, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1.190996524802546, 1.352010400546581, 0, 0, 0.4683418330207792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 1.580692268611304, 0, 0, 0.2907501553894282, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737]
],
"RESOLVED": [
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1.190996524802546, 1.352010400546581, 0, 0, 0.4683418330207792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 1.976303345091921, 0, 0, 0.2469196896635653, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5448749448009105, 2.455125055199089, 1, 0, 0.1816249816003035, 1.835283507787986, 0, -29.91712472484581, 1, 0.1816249816003035, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.9962587383998268, 2.003741261600174, 0, 1, 0.3320862461332755, 0, 0.4990664309629513, 8.135327647060768, 0.6679137538667245, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5441549675438022, 2.455845032456197, 1, 0, 0.1813849891812674, 1.837711791024869, 0, -29.95670839252266, 1, 0.1813849891812674, 0.06134558466655737],
[0.6011540520514875, 2.225595193309174, 0, 0, 0.2126662112099678, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 1.62429294454534, 0, 0, 0.3810550198210629, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.7694490463965041, 2.230550953603495, 1, 0, 0.2564830154655014, 1.299631216236105, 0, -21.18540761002154, 1, 0.2564830154655013, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 1.62429294454534, 0, 0, 0.3810550198210629, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 1.580692268611304, 0, 0, 0.2907501553894282, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6011540520514875, 1.627527816013236, 0, 0, 0.2697352460508416, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 1.976303345091921, 0, 0, 0.2469196896635653, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1.002166547208049, 1.992649604180013, 0, 1, 0.3346337459625215, 0, 0.5018443774069881, 8.18061120673562, 0.6653662540374785, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.9721404861470407, 2.027859513852959, 0, 1, 0.3240468287156802, 0, 0.4931308077155637, 8.038570508309045, 0.6759531712843198, 1, 0.06134558466655737],
[0.6799326177079694, 2.320067382292031, 0, 0, 0.2266442059026565, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.7713181319352767, 2.228681868064723, 0, 0, 0.2571060439784256, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.7713181319352767, 2, 0, 0, 0.2783217570898823, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.9946941507901051, 2.005305849209895, 0, 1, 0.331564716930035, 0, 0.4986770473910537, 8.12898026975539, 0.668435283069965, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 2.17710245472985, 0, 1, 0.2293693752364301, 0, 0.4593261092639238, 7.487517019530928, 0.7706306247635699, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.444060345926909, 0, 1, 0.1817859713340707, 0, 0.4091552001432887, 6.669676430133369, 0.8182140286659293, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6485379105174761, 1.977425404470164, 0, 1, 0.2469714282815594, 0, 0.5057080776546118, 8.243593738707967, 0.7530285717184406, 1, 0.06134558466655737],
[1.144160977400614, 1.718913330240544, 0, 0, 0.3996267139651259, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 1.976303345091921, 0, 0, 0.2469196896635653, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 2.178759645907242, 0, 0, 0.2292349066748378, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1.190996524802546, 1.352010400546581, 0, 0, 0.4683418330207792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6011540520514875, 2.023138892493852, 0, 0, 0.2290727692199918, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0, 1.797691895897025, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6011540520514875, 2.225595193309174, 0, 0, 0.2126662112099678, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.7713181319352767, 2.228681868064723, 0, 0, 0.2571060439784256, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6799326177079694, 2.320067382292031, 0, 0, 0.2266442059026565, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 2.178759645907242, 0, 0, 0.2292349066748378, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 1.998127136566633, 0, 1, 0.3335415592632842, 0, 0.500468654721487, 8.158185425108814, 0.6664584407367158, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6011540520514875, 2.023138892493852, 0, 0, 0.2290727692199918, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 2.178759645907242, 0, 0, 0.2292349066748378, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.3520104005465807, 2.647989599453419, 0, 0, 0.1173368001821936, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5457557153228959, 2.454244284677103, 1, 0, 0.1819185717742987, 1.832321626551086, 0, -29.86884282724879, 1, 0.1819185717742987, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1.144160977400614, 1.718913330240544, 0, 0, 0.3996267139651259, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.9977023932596581, 2.002297606740342, 0, 1, 0.332567464419886, 0, 0.4994262574323098, 8.141193211327769, 0.6674325355801141, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.7713181319352767, 2.228681868064723, 0, 0, 0.2571060439784256, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6799326177079694, 2.320067382292031, 0, 0, 0.2266442059026565, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 8.150545841526155, 0.6666666666666667, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -16.30109168305231, 1, 0.3333333333333333, 0.06134558466655737],
[0.9719996920556649, 2.028000307944335, 0, 0, 0.3239998973518883, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0, 1.797691895897025, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.7713181319352767, 2.228681868064723, 0, 0, 0.2571060439784256, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.7713181319352767, 2, 0, 0, 0.2783217570898823, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 2.178759645907242, 0, 0, 0.2292349066748378, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.8267492453606603, 2, 0, 0, 0.2924734999814873, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 8.150545841526155, 0.6666666666666667, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.453250898480722, 0, 1, 0.1812283712804959, 0, 0.4076223922385158, 6.644689987945158, 0.8187716287195042, 1, 0.06134558466655737],
[0.3520104005465807, 2.647989599453419, 0, 0, 0.1173368001821936, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6799326177079694, 2.320067382292031, 0, 0, 0.2266442059026565, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.320067382292031, 0, 0, 0.1896586909742141, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0, 3.000000000000002, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.7713181319352767, 2.228681868064723, 0, 0, 0.2571060439784256, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.3520104005465807, 2.647989599453419, 0, 0, 0.1173368001821936, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6006777783422331, 2.227490535925575, 0, 1, 0.2123910996781478, 0, 0.4489356896793622, 7.318141837257606, 0.7876089003218523, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 2.178759645907242, 0, 0, 0.2292349066748378, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 1.976303345091921, 0, 0, 0.2469196896635653, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 2, 0, 0.3333333333333333, 2, 0, -32.60218336610462, 1, 0.1111111111111109, 0.06134558466655737],
[0.6799326177079694, 2.320067382292031, 0, 0, 0.2266442059026565, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.320067382292031, 0, 0, 0.1896586909742141, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -16.30109168305231, 1, 0.3333333333333333, 0.06134558466655737],
[0.54674648251545, 2.45325351748455, 0, 1, 0.18224882750515, 0, 0.4076219570757419, 6.644682894316885, 0.81775117249485, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.8267492453606603, 2, 0, 0, 0.2924734999814873, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 1.580692268611304, 0, 0, 0.2907501553894282, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.7685568127842679, 2.231443187215732, 1, 0, 0.2561856042614226, 1.301139985185061, 0, -21.21000219098701, 1, 0.2561856042614226, 0.06134558466655737],
[1.190996524802546, 1.352010400546581, 0, 0, 0.4683418330207792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.8267492453606603, 2, 0, 0, 0.2924734999814873, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -16.30109168305231, 1, 0.3333333333333333, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6799326177079694, 2.320067382292031, 0, 0, 0.2266442059026565, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6474322573684738, 1.976860687176866, 1, 0, 0.2467073116643392, 1.544563139415633, 0, -25.17806534587735, 1, 0.2467073116643392, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5516085014604035, 2.447270972005416, 0, 3, 0.183938203032517, 0, 1.225855262583224, 19.9827790255213, 0.5434619489935592, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 8.150545841526155, 0.6666666666666667, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 2.178759645907242, 0, 0, 0.2292349066748378, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1.190996524802546, 1.352010400546581, 0, 0, 0.4683418330207792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 1.580692268611304, 0, 0, 0.2907501553894282, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -16.30109168305231, 1, 0.3333333333333333, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 2.178759645907242, 0, 0, 0.2292349066748378, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 1.580692268611304, 0, 0, 0.2907501553894282, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5436283645206291, 2.45637163547937, 0, 1, 0.1812094548402097, 0, 0.4071045217898578, 6.636248134281641, 0.8187905451597903, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[7.059145356595169, 14.11829071319034, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.007816911596836605],
[1, 1.62429294454534, 0, 0, 0.3810550198210629, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1.190996524802546, 1.352010400546581, 0, 0, 0.4683418330207792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6799326177079694, 2.320067382292031, 0, 0, 0.2266442059026565, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.9990857979959565, 1.626275459102029, 0, 1, 0.3805517413250484, 0, 0.6149019801062262, 10.023573553802, 0.6194482586749517, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 1.980097740871701, 0, 1, 0.2465631904658301, 0, 0.5050255749293309, 8.232468199209229, 0.7534368095341699, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0.4999999999999999, -8.150545841526155, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.06134558466655737],
[1.00156370066635, 1.994694868037518, 0, 1, 0.3342714514453972, 0, 0.5013298104004503, 8.172223202784975, 0.6657285485546028, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 2.17773717243952, 0, 1, 0.22931785404692, 0, 0.4591922352502215, 7.485334726959587, 0.7706821459530799, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6011540520514875, 1.627527816013236, 0, 0, 0.2697352460508416, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.7701716056567925, 2.229828394343207, 1, 0, 0.2567238685522642, 1.298411928789835, 0, -21.16553189357189, 1, 0.2567238685522641, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2, 0, 0, 0.2135294717196169, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2, 0, 0, 0.2135294717196169, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6011540520514875, 2.225595193309174, 0, 0, 0.2126662112099678, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 2.178759645907242, 0, 0, 0.2292349066748378, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.453250563365897, 0, 1, 0.1812283915498866, 0, 0.4076224479198671, 6.64469089561197, 0.8187716084501133, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -16.30109168305231, 1, 0.3333333333333333, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 1.580692268611304, 0, 0, 0.2907501553894282, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 1.580692268611304, 0, 0, 0.2907501553894282, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1.190996524802546, 1.352010400546581, 0, 0, 0.4683418330207792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 1.976303345091921, 0, 0, 0.2469196896635653, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.7713181319352767, 2, 0, 0, 0.2783217570898823, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6011540520514875, 1.627527816013236, 0, 0, 0.2697352460508416, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.8267492453606603, 2, 0, 0, 0.2924734999814873, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1.190996524802546, 1.352010400546581, 0, 0, 0.4683418330207792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 1.580692268611304, 0, 0, 0.2907501553894282, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 1.976303345091921, 0, 0, 0.2469196896635653, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 2.178759645907242, 0, 0, 0.2292349066748378, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0.4999999999999999, -8.150545841526155, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.06134558466655737],
[0.7799136979587284, 2.220086302041271, 0, 0, 0.2599712326529095, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6477540214022502, 1.580927846662473, 1, 0, 0.2906444525277749, 1.543795896218771, 0, -25.16555844418211, 1, 0.2906444525277749, 0.06134558466655737],
[0, 3.000000000000002, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 1.976303345091921, 0, 0, 0.2469196896635653, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6799326177079694, 2.320067382292031, 0, 0, 0.2266442059026565, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5464539363479768, 2.453546063652023, 1, 1, 0.1821513121159923, 1.829980412773913, 0.4075733546699885, -23.18678786477279, 0.9668208994944224, 0.3311235237264069, 0.06134558466655737],
[0.7694482965648424, 2.230551703435157, 1, 0, 0.2564827655216141, 1.299632482733983, 0, -21.18542825531956, 1, 0.2564827655216142, 0.06134558466655737],
[1.190996524802546, 1.352010400546581, 0, 0, 0.4683418330207792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 1.976303345091921, 0, 0, 0.2469196896635653, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1.190613222015817, 1.355013139346745, 1, 0, 0.4677093386865045, 0.839903321673943, 0, -13.69134105150713, 1, 0.4677093386865045, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 8.150545841526155, 0.6666666666666667, 1, 0.06134558466655737],
[0.01159841866295961, 2.988401581337042, 0, 2, 0.003866139554319868, 0, 0.6692540964006515, 10.90957238468535, 0.9922826679264136, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 1.976303345091921, 0, 0, 0.2469196896635653, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.7713181319352767, 2.228681868064723, 0, 0, 0.2571060439784256, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6825521066368125, 2.317447893363187, 0, 1, 0.2275173688789375, 0, 0.4315091626715084, 7.034070422785393, 0.7724826311210625, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 1.976303345091921, 0, 0, 0.2469196896635653, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1.200681560120389, 1.799318439879612, 0, 0, 0.4002271867067962, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2, 0, 0, 0.2135294717196169, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 2.178759645907242, 0, 0, 0.2292349066748378, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1.190996524802546, 1.352010400546581, 0, 0, 0.4683418330207792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 1.976303345091921, 0, 0, 0.2469196896635653, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2, 0, 0, 0.2135294717196169, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.7713181319352767, 2.228681868064723, 0, 0, 0.2571060439784256, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 1.976303345091921, 0, 0, 0.2469196896635653, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.454697330146718, 0, 1, 0.1811409262116515, 0, 0.4073822005339573, 6.640774600947641, 0.8188590737883485, 1, 0.06134558466655737],
[0.9719996920556649, 2.028000307944335, 0, 0, 0.3239998973518883, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2, 0, 0, 0.2135294717196169, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 1.62429294454534, 0, 0, 0.3810550198210629, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6011540520514875, 1.627527816013236, 0, 0, 0.2697352460508416, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1.190613318887584, 1.355012380467281, 1, 0, 0.4677094983717833, 0.8399032533369626, 0, -13.69133993753974, 1, 0.4677094983717833, 0.06134558466655737],
[0.9979541033700613, 2.001432898691704, 0, 1, 0.3327193532158645, 0, 0.4996420317931617, 8.14471056896687, 0.6672806467841355, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1.190996524802546, 1.352010400546581, 0, 0, 0.4683418330207792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1.771318131935276, 1.228681868064724, 0, 0, 0.5904393773117587, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1.771318131935276, 1.228681868064724, 0, 0, 0.5904393773117587, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6799326177079694, 2.320067382292031, 0, 0, 0.2266442059026565, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 1.62429294454534, 0, 0, 0.3810550198210629, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1.771318131935276, 1.228681868064724, 0, 0, 0.5904393773117587, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 2.178759645907242, 0, 0, 0.2292349066748378, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.9977043030649412, 2.001607853049199, 0, 1, 0.3326443701537057, 0, 0.4995983596270493, 8.143998664983073, 0.6673556298462944, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6011540520514875, 2.225595193309174, 0, 0, 0.2126662112099678, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 1.976303345091921, 0, 0, 0.2469196896635653, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1.000959487673776, 1.771083443909502, 0, 2, 0.3610909038490498, 0, 1.129252270342037, 18.40804479214053, 0.4082048331444242, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 1.976303345091921, 0, 0, 0.2469196896635653, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1.190996524802546, 1.352010400546581, 0, 0, 0.4683418330207792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 1.976303345091921, 0, 0, 0.2469196896635653, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6799326177079694, 2.320067382292031, 0, 0, 0.2266442059026565, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.003396398680076343, 2.996603601319926, 0, 1, 0.00113213289335878, 0, 0.3337111386903246, 5.439855867446768, 0.9988678671066412, 1, 0.06134558466655737],
[0.7713181319352767, 2.228681868064723, 0, 0, 0.2571060439784256, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 2.178759645907242, 0, 0, 0.2292349066748378, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.7713181319352767, 2.228681868064723, 0, 0, 0.2571060439784256, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2, 0, 0, 0.2135294717196169, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.7701711907083059, 2.229828809291694, 1, 0, 0.256723730236102, 1.298412628340885, 0, -21.16554329701769, 1, 0.2567237302361021, 0.06134558466655737],
[0.3520104005465807, 2.647989599453419, 0, 0, 0.1173368001821936, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 1.580692268611304, 0, 0, 0.2907501553894282, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 8.150545841526155, 0.6666666666666667, 1, 0.06134558466655737],
[1.000959487673776, 1.76921170303453, 0, 1, 0.3613348846566555, 0, 0.5652234824610375, 9.213759809011483, 0.6386651153433445, 1, 0.06134558466655737],
[0.9977042079267485, 2.002295792073252, 0, 1, 0.3325680693089161, 0, 0.4994267100589382, 8.141200589635938, 0.6674319306910839, 1, 0.06134558466655737],
[0.6006778612310546, 2.227490206067527, 0, 1, 0.2123911475334675, 0, 0.4489357561600362, 7.318142920965167, 0.7876088524665326, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.320067382292031, 0, 0, 0.1896586909742141, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.320067382292031, 0, 0, 0.1896586909742141, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6799326177079694, 2.320067382292031, 0, 0, 0.2266442059026565, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1.190996524802546, 1.352010400546581, 0, 0, 0.4683418330207792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1.190996524802546, 1.352010400546581, 0, 0, 0.4683418330207792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 1.976303345091921, 0, 0, 0.2469196896635653, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.3520104005465807, 2.647989599453419, 0, 0, 0.1173368001821936, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.3520104005465807, 2.647989599453419, 0, 0, 0.1173368001821936, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 2.178759645907242, 0, 0, 0.2292349066748378, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 1.580692268611304, 0, 0, 0.2907501553894282, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1.190996524802546, 1.352010400546581, 0, 0, 0.4683418330207792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.997704255495845, 2.002295744504155, 0, 1, 0.3325680851652816, 0, 0.4994267219239574, 8.141200783048703, 0.6674319148347184, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6011540520514875, 2.225595193309174, 0, 0, 0.2126662112099678, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.9979731399804536, 2.002026860019547, 0, 1, 0.3326577133268178, 0, 0.4994937979954157, 8.142294196239284, 0.6673422866731822, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 2.178759645907242, 0, 0, 0.2292349066748378, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1.00173706358922, 1.996613054182496, 0, 1, 0.3340960942658961, 0, 0.5008481728120551, 8.164371984298539, 0.6659039057341039, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6799326177079694, 2.320067382292031, 0, 0, 0.2266442059026565, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.770171190708306, 2.229828809291694, 1, 0, 0.256723730236102, 1.298412628340884, 0, -21.16554329701768, 1, 0.2567237302361021, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2, 0, 0, 0.2135294717196169, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.9946953416528047, 2.005304658347196, 0, 1, 0.3315651138842682, 0, 0.4986773435335338, 8.12898509720111, 0.6684348861157319, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 1.976303345091921, 0, 0, 0.2469196896635653, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6799326177079694, 2.320067382292031, 0, 0, 0.2266442059026565, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 1.771318131935276, 0, 0, 0.360839121455059, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.005569349438181798, 2.99443065056182, 0, 1, 0.001856449812727265, 0, 0.3339533008762045, 5.443803375440964, 0.9981435501872727, 1, 0.06134558466655737],
[0.9977043030649412, 2.002295696935059, 0, 1, 0.332568101021647, 0, 0.499426733788977, 8.141200976461475, 0.667431898978353, 1, 0.06134558466655737],
[0, 1.797691895897025, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.320067382292031, 0, 0, 0.1896586909742141, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 2.178759645907242, 0, 0, 0.2292349066748378, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -16.30109168305231, 1, 0.3333333333333333, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.453250381108241, 0, 1, 0.1812284025737269, 0, 0.4076224782030834, 6.644691389261457, 0.818771597426273, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 1.976303345091921, 0, 0, 0.2469196896635653, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.5430069253491263, 2.456993074650873, 0, 0, 0.1810023084497088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.7713181319352767, 2, 0, 0, 0.2783217570898823, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 2.178759645907242, 0, 0, 0.2292349066748378, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[1.190996524802546, 1.352010400546581, 0, 0, 0.4683418330207792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737],
[0.6479895994534194, 1.580692268611304, 0, 0, 0.2907501553894282, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06134558466655737]
]
}
}
},
"headers": [
["ES", "Expected synonymous sites"],
["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
]
},
"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
},
"branch attributes":{
"0":{
"Node1007":{
"Global MG94xREV":0.001004434828376813,
"Nucleotide GTR":0.0009637885385443544,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "F", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "TTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node165":{
"Global MG94xREV":0.001004819268983264,
"Nucleotide GTR":0.0009641574220595217,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "Y", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "TAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node255":{
"Global MG94xREV":0.0005477249601821842,
"Nucleotide GTR":0.0005255602693022255,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "Y", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "TAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node256":{
"Global MG94xREV":0.0004566886220238122,
"Nucleotide GTR":0.0004382078828364196,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "Y", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "TAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node257":{
"Global MG94xREV":0.00100550541364666,
"Nucleotide GTR":0.000964815800625939,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "Y", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "TAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCA", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node281":{
"Global MG94xREV":0.0006170985588191439,
"Nucleotide GTR":0.0005921265385662338,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "L", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "TTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node282":{
"Global MG94xREV":0.0003873173355608749,
"Nucleotide GTR":0.00037164383218009,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "L", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "TTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node305":{
"Global MG94xREV":0.0005441610380259495,
"Nucleotide GTR":0.0005221405677651995,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "F", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "TTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node328":{
"Global MG94xREV":0.0006168497364113509,
"Nucleotide GTR":0.0005918877852116213,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "S", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "AGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node334":{
"Global MG94xREV":0.000616337001631797,
"Nucleotide GTR":0.0005913957991813825,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "F", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "TTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node341":{
"Global MG94xREV":0.0004550735492048128,
"Nucleotide GTR":0.0004366581668888136,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node342":{
"Global MG94xREV":0.0005492718900688927,
"Nucleotide GTR":0.0005270445998457516,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "C", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "TGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node347":{
"Global MG94xREV":0.0006169414170013331,
"Nucleotide GTR":0.0005919757557790845,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAC", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node42":{
"Global MG94xREV":0.001004390712565516,
"Nucleotide GTR":0.0009637462079599355,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "I", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ATA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node446":{
"Global MG94xREV":0.001004800817988144,
"Nucleotide GTR":0.0009641397177176205,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "V", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GTT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node456":{
"Global MG94xREV":0.001004279553384626,
"Nucleotide GTR":0.0009636395470383228,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "E", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "GAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node459":{
"Global MG94xREV":0.001004616192013418,
"Nucleotide GTR":0.0009639625629701626,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "I", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ATA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node465":{
"Global MG94xREV":0.0005251031100924453,
"Nucleotide GTR":0.0005038538536929695,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAT", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node466":{
"Global MG94xREV":0.0004793951075923874,
"Nucleotide GTR":0.000459995508995283,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAT", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node509":{
"Global MG94xREV":0.001004630736213152,
"Nucleotide GTR":0.0009639765186122908,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "A", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "K", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GCT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "AAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node510":{
"Global MG94xREV":0.0006474113957901971,
"Nucleotide GTR":0.0006212127112258145,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "A", "G", "V", "T", "L", "I", "R", "K", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GCT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "AGA", "AAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node518":{
"Global MG94xREV":0.0006056463308385659,
"Nucleotide GTR":0.0005811377459072663,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCT", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node521":{
"Global MG94xREV":0.001004770337377411,
"Nucleotide GTR":0.0009641104705604695,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "Y", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "TAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node524":{
"Global MG94xREV":0.001004126560580577,
"Nucleotide GTR":0.0009634927453675151,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "V", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "GTT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node528":{
"Global MG94xREV":0.001004216375274441,
"Nucleotide GTR":0.0009635789255457532,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "A", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "GCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node583":{
"Global MG94xREV":0.0006128667969845651,
"Nucleotide GTR":0.0005880660227031905,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "I", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATT", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node586":{
"Global MG94xREV":0.0006169286330862046,
"Nucleotide GTR":0.0005919634891884303,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "T", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ACC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node589":{
"Global MG94xREV":0.000616337001631797,
"Nucleotide GTR":0.0005913957991813825,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTT", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node592":{
"Global MG94xREV":0.0006163497727401007,
"Nucleotide GTR":0.000591408053483463,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTT", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node592_1":{
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "A", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GCT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node597":{
"Global MG94xREV":0.001004264246622898,
"Nucleotide GTR":0.0009636248596926641,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "G", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "GGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node598":{
"Global MG94xREV":0.001004038821195032,
"Nucleotide GTR":0.000963408556516454,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "C", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "TGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node603":{
"Global MG94xREV":0.000616337001631797,
"Nucleotide GTR":0.0005913957991813825,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "C", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "TGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node606":{
"Global MG94xREV":0.0006163497727401007,
"Nucleotide GTR":0.000591408053483463,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCT", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node609":{
"Global MG94xREV":0.0006163497727401007,
"Nucleotide GTR":0.000591408053483463,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "L", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TTA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node615":{
"Global MG94xREV":0.0005454773867296346,
"Nucleotide GTR":0.000523403648014408,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "D", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAC", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node621":{
"Global MG94xREV":0.0006163497727401007,
"Nucleotide GTR":0.000591408053483463,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "F", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TTT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node624":{
"Global MG94xREV":0.0006163497727401007,
"Nucleotide GTR":0.000591408053483463,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "Y", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "TAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node627":{
"Global MG94xREV":0.0006163497727401007,
"Nucleotide GTR":0.000591408053483463,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "L", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TTA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node630":{
"Global MG94xREV":0.0006163497727401007,
"Nucleotide GTR":0.000591408053483463,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAT", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node633":{
"Global MG94xREV":0.0006163625438484129,
"Nucleotide GTR":0.0005914203077855515,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "F", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TTT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node636":{
"Global MG94xREV":0.0006163625438484129,
"Nucleotide GTR":0.0005914203077855515,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "V", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GTT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node639":{
"Global MG94xREV":0.0006171241326402909,
"Nucleotide GTR":0.0005921510774959992,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "G", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GGT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node642":{
"Global MG94xREV":0.0006171241326402909,
"Nucleotide GTR":0.0005921510774959992,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAC", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node645":{
"Global MG94xREV":0.0006171241326402909,
"Nucleotide GTR":0.0005921510774959992,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAG", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node648":{
"Global MG94xREV":0.000619632310092375,
"Nucleotide GTR":0.0005945577569665435,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "E", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "GAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node651":{
"Global MG94xREV":0.0006161267853720985,
"Nucleotide GTR":0.0005911940897065719,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTT", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node664":{
"Global MG94xREV":0.0003012033688440114,
"Nucleotide GTR":0.0002890146244051804,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node665":{
"Global MG94xREV":0.0003223817284668782,
"Nucleotide GTR":0.0003093359630257007,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node673":{
"Global MG94xREV":0.001004577226040169,
"Nucleotide GTR":0.0009639251738261885,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "V", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GTT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node689":{
"Global MG94xREV":0.0003219219001916975,
"Nucleotide GTR":0.0003088947425415065,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node695":{
"Global MG94xREV":0.0006158370095825345,
"Nucleotide GTR":0.0005909160402235801,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "I", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATT", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node709":{
"Global MG94xREV":0.0005477987677802357,
"Nucleotide GTR":0.0005256310901410199,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node713":{
"Global MG94xREV":0.001004438127396842,
"Nucleotide GTR":0.000963791704063514,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTT", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node716":{
"Global MG94xREV":0.001003812002132455,
"Nucleotide GTR":0.0009631909161015097,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "A", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GCT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node720":{
"Global MG94xREV":0.0006158370095825345,
"Nucleotide GTR":0.0005909160402235801,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "V", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GTT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node727":{
"Global MG94xREV":0.0004474942418899171,
"Nucleotide GTR":0.0004293855700872806,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node728":{
"Global MG94xREV":0.0005568355894909545,
"Nucleotide GTR":0.0005343022203563413,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "I", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "ATT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node733":{
"Global MG94xREV":0.0010044803874823,
"Nucleotide GTR":0.0009638322540174311,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "L", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "TTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node750":{
"Global MG94xREV":0.0005477840062417546,
"Nucleotide GTR":0.0005256169259551534,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAG", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node751":{
"Global MG94xREV":0.0004561192374193119,
"Nucleotide GTR":0.0004376615394198655,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAG", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node756":{
"Global MG94xREV":0.001004774310601284,
"Nucleotide GTR":0.0009641142830005826,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCT", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node761":{
"Global MG94xREV":0.0005303451887401117,
"Nucleotide GTR":0.0005088838020540132,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "L", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "TTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node762":{
"Global MG94xREV":0.000474009279983953,
"Nucleotide GTR":0.000454827628737712,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "L", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "TTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node780":{
"Global MG94xREV":0.001004943522147653,
"Nucleotide GTR":0.0009642766470926795,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "N", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAT", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node784":{
"Global MG94xREV":0.0006138101951632642,
"Nucleotide GTR":0.0005889712445515639,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGT", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node795":{
"Global MG94xREV":0.0005305474462791071,
"Nucleotide GTR":0.0005090778748722889,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAC", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node796":{
"Global MG94xREV":0.0004733064393845424,
"Nucleotide GTR":0.0004541532298668256,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAC", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node808":{
"Global MG94xREV":0.001004609398263929,
"Nucleotide GTR":0.0009639560441421526,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "I", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "ATT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node812":{
"Global MG94xREV":0.00100441977318833,
"Nucleotide GTR":0.0009637740925915711,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAT", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node820":{
"Global MG94xREV":0.0005303451887401117,
"Nucleotide GTR":0.0005088838020540132,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACT", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node823":{
"Global MG94xREV":0.001004594966834612,
"Nucleotide GTR":0.0009639421967069825,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACA", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node830":{
"Global MG94xREV":0.001003977230672051,
"Nucleotide GTR":0.0009633494583664747,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "L", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "CTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node833":{
"Global MG94xREV":0.001004663840888954,
"Nucleotide GTR":0.000964008283646923,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "S", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "TCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node851":{
"Global MG94xREV":0.001004295878166635,
"Nucleotide GTR":0.0009636552112082129,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "V", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "GTG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node863":{
"Global MG94xREV":0.001003852509688325,
"Nucleotide GTR":0.0009632297844451456,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTG", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node866":{
"Global MG94xREV":0.001004392434673258,
"Nucleotide GTR":0.0009637478603794439,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "V", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GTC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node870":{
"Global MG94xREV":0.001004768625691012,
"Nucleotide GTR":0.0009641088281405858,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "N", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAT", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node915":{
"Global MG94xREV":0.001003846873324286,
"Nucleotide GTR":0.0009632243761668721,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAC", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node925":{
"Global MG94xREV":0.001004680367458974,
"Nucleotide GTR":0.0009640241414391034,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "Y", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "TAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node947":{
"Global MG94xREV":0.001004106276560494,
"Nucleotide GTR":0.0009634732821773525,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node978":{
"Global MG94xREV":0.001004818644283623,
"Nucleotide GTR":0.0009641568226394931,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "S", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "TCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node983":{
"Global MG94xREV":0.00100496722351498,
"Nucleotide GTR":0.0009642993893408884,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "I", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATT", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node986":{
"Global MG94xREV":0.001004822721973722,
"Nucleotide GTR":0.0009641607353184159,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTT", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406595_Guangdong_20200116_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000965995530727099,
"Nucleotide GTR":0.0009637092790234949,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "D", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAC", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406595_Guangdong_20200116_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413857_Guangdong_20200131_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009659110092868742,
"Nucleotide GTR":0.0009636249576227956,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "D", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "GAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413857_Guangdong_20200131_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414010_England_20200226_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "IV", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "RTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414010_England_20200226_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414936_Shandong_20200123_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009659240139142806,
"Nucleotide GTR":0.0009636379314717441,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAG", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414936_Shandong_20200123_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415593_Washington_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009663240155803623,
"Nucleotide GTR":0.0009640369864414265,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "E", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GAA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415593_Washington_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416339_Shanghai_20200203_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009666276803496195,
"Nucleotide GTR":0.0009643399325178191,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "F", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "TTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416339_Shanghai_20200203_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416361_Shanghai_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00096662768027222,
"Nucleotide GTR":0.0009643399324406021,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "S", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "TCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416361_Shanghai_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416390_Shanghai_20200131_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009660801152984117,
"Nucleotide GTR":0.0009637936634058682,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "N", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "AAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416390_Shanghai_20200131_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416392_Shanghai_20200202_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009659110092898109,
"Nucleotide GTR":0.0009636249576257254,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCG", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416392_Shanghai_20200202_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416425_Hangzhou_20200203_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009659110398089077,
"Nucleotide GTR":0.0009636249880725898,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "E", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "GAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416425_Hangzhou_20200203_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416541_Dasman_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "C", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "TGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416541_Dasman_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416694_Washington_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "K", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "AAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416694_Washington_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416748_ARA_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009665176413518945,
"Nucleotide GTR":0.0009642301539528157,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "I", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "ATA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416748_ARA_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417030_New_South_Wales_20200124_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009659647647623084,
"Nucleotide GTR":0.0009636785858734701,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAC", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417030_New_South_Wales_20200124_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417140_Washington_20200301_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009659647342598497,
"Nucleotide GTR":0.0009636785554432024,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "L", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "CTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417140_Washington_20200301_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417236_England_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCM", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417236_England_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417240_England_20200303_null_4":{
"Global MG94xREV":0.00096662768027222,
"Nucleotide GTR":0.0009643399324406021,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "Y", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "TAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417240_England_20200303_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417288_England_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009666335832736287,
"Nucleotide GTR":0.0009643458214711942,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "V", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "I", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GTT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ATA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417288_England_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417312_England_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCM", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417312_England_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417398_New_South_Wales_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009659104582623025,
"Nucleotide GTR":0.0009636244079023492,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCG", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417398_New_South_Wales_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009667414972363537,
"Nucleotide GTR":0.0009644534800305818,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "K", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "AAA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417487_Oslo_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "HY", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "YAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417487_Oslo_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417607_Reykjavik_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000966045775527211,
"Nucleotide GTR":0.000963759404907674,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "G", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GGA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417607_Reykjavik_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417743_Reykjavik_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009660312746678248,
"Nucleotide GTR":0.0009637449383679238,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCT", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417743_Reykjavik_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418040_Washington_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00096593382700463,
"Nucleotide GTR":0.0009636477213371475,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "K", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAA", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418040_Washington_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418715_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTR", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418715_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418874_Washington_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "Y", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "TAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418874_Washington_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418949_Washington_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0003720350434965117,
"Nucleotide GTR":0.0003711545365739235,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAC", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418949_Washington_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419388_Minnesota_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCW", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419388_Minnesota_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419419_Wales_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001935409033727245,
"Nucleotide GTR":0.00193082844089862,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "DAGV", "F", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GNT", "TTC", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419419_Wales_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419427_Wales_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "IV", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "RTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419427_Wales_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419429_Wales_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "MV", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "RTG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419429_Wales_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419494_Wales_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000966626319391216,
"Nucleotide GTR":0.0009643385747804377,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "V", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "V", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "GTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GTT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419494_Wales_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419693_Belarus_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0003720072856046203,
"Nucleotide GTR":0.0003711268443774991,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "G", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GGT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419693_Belarus_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419749_Victoria_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009666276803496195,
"Nucleotide GTR":0.0009643399325178191,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "D", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAT", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419749_Victoria_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420401_Ath_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009657725351346515,
"Nucleotide GTR":0.0009634868112016585,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAC", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420401_Ath_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420694_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAR", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420694_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420696_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009663518067357127,
"Nucleotide GTR":0.0009640647118225837,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "I", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATT", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420696_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420697_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "PL", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CYA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420697_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420725_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009655423553678699,
"Nucleotide GTR":0.0009632571762084997,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "T", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ACT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420725_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420726_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "RC", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "YGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420726_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420823_Utah_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009713569712461648,
"Nucleotide GTR":0.0009690580304543306,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "H", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAC", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420823_Utah_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420981_Wales_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "TI", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "AYT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420981_Wales_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420997_Wales_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009667885046882813,
"Nucleotide GTR":0.0009645003762285093,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "K", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "AAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420997_Wales_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421221_Hangzhou_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009659647342598497,
"Nucleotide GTR":0.0009636785554432024,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "A", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GCT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421221_Hangzhou_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421281_Indiana_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009663240155803623,
"Nucleotide GTR":0.0009640369864414265,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAA", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421281_Indiana_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421336_Wisconsin_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009661784043513378,
"Nucleotide GTR":0.0009638917198350336,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATT", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421336_Wisconsin_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421592_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009661919527587415,
"Nucleotide GTR":0.000963905236176998,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAT", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421592_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421607_New_York_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009659234607738302,
"Nucleotide GTR":0.0009636373796404289,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "C", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TGC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421607_New_York_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421669_India_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "Y", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "TAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421669_India_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421686_Minnesota_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "DA", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GMT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421686_Minnesota_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421735_Luxembourg_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009657334502356361,
"Nucleotide GTR":0.0009634478188060927,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "A", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GCT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421735_Luxembourg_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421738_Luxembourg_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009662774751407571,
"Nucleotide GTR":0.0009639905561505285,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "Y", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAG", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "TAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421738_Luxembourg_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421775_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "L", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAY", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "TTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421775_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421847_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "RS", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGW", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421847_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421895_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "L", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "TTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGY", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421895_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421947_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "DV", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GWT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421947_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421948_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGW", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421948_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421953_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "NY", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "WAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421953_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421956_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "GV", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GKT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421956_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421963_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "YAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421963_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421964_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "QH", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAK", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421964_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422056_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "RM", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AKG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422056_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422057_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "PS", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "YCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422057_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422116_Wales_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009659240910264356,
"Nucleotide GTR":0.0009636380084013949,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAG", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422116_Wales_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422312_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "ED", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAM", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422312_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422431_Singapore_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGR", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422431_Singapore_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422572_Friesland_20200328_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0009659240909427213,
"Nucleotide GTR":0.0009636380083178798,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "V", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "GTT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422572_Friesland_20200328_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422590_Netherlands_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009657594546542175,
"Nucleotide GTR":0.0009634737616792063,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAC", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422590_Netherlands_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422601_Netherlands_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009663026578551976,
"Nucleotide GTR":0.0009640156792642559,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAA", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422601_Netherlands_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422709_Netherlands_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009662570481638392,
"Nucleotide GTR":0.0009639701775187736,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "S", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "V", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "TCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "GTT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422709_Netherlands_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422897_Utrecht_20200311_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0009661919527587415,
"Nucleotide GTR":0.000963905236176998,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "S", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "TCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422897_Utrecht_20200311_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423052_England_20200319_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "TI", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "AYT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423052_England_20200319_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423060_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TWA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423060_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423068_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "QP", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CMG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423068_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423130_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "PS", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "YCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423130_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423227_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "LF", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "YTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423227_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423324_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009670187369300414,
"Nucleotide GTR":0.0009647300635724544,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "V", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "D", "Q", "VL", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GTT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GAT", "CAA", "KTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423324_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423328_England_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "GC", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "KGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423328_England_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423354_England_20200329_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0004427611976249711,
"Nucleotide GTR":0.0004417133009109998,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "F", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "TTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423354_England_20200329_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423412_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTK", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423412_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423446_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "TI", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "L", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "AYT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "TTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423446_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423453_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000966974540073655,
"Nucleotide GTR":0.0009646859713181444,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "N", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "L", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "AAT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "TTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423453_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423481_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTY", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423481_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423548_England_20200331_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0009662510814443162,
"Nucleotide GTR":0.000963964224920871,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "L", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "CTA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423548_England_20200331_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423579_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "AG", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GSA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423579_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423639_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "QE", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "V", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "SAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GTT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423639_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423648_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "NI", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AWT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423648_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423740_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAR", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423740_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423752_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000965908716688477,
"Nucleotide GTR":0.0009636226704503608,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "I", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "ATT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423752_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423780_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGY", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423780_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423825_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "AS", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "KCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423825_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423913_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009659240805124947,
"Nucleotide GTR":0.0009636379979123379,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACG", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423913_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423927_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002911439716384565,
"Nucleotide GTR":0.002904549121345772,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "I", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "ATT", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423927_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423933_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAY", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423933_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424007_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "AG", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GSA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424007_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424062_England_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009678189121882973,
"Nucleotide GTR":0.0009655283450310083,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "LF", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "E", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "V", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTN", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GAA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GTT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424062_England_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424138_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGY", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424138_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424241_Washington_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009661919527587415,
"Nucleotide GTR":0.000963905236176998,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAT", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424241_Washington_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424298_Washington_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00096691052035963,
"Nucleotide GTR":0.0009646221031215699,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "F", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "TTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAA", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424298_Washington_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424311_Washington_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009662531849876596,
"Nucleotide GTR":0.0009639663234856939,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACC", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424311_Washington_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424474_Reykjavik_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009652614362634505,
"Nucleotide GTR":0.0009629769219640726,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "P", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "CCA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424474_Reykjavik_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424541_Reykjavik_20200301_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000965924060416781,
"Nucleotide GTR":0.0009636379778641849,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "A", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "GCG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424541_Reykjavik_20200301_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424989_Michigan_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009661749839850433,
"Nucleotide GTR":0.0009638883075638254,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "Q", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CAG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424989_Michigan_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425023_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "ND", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "RAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425023_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425159_Wisconsin_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009657594848296989,
"Nucleotide GTR":0.0009634737917832699,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAC", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425159_Wisconsin_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425203_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009664767833979811,
"Nucleotide GTR":0.0009641893926986948,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTT", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425203_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425404_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009659751201679237,
"Nucleotide GTR":0.0009636889167706241,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "I", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTC", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ATA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425404_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425485_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009659234607293818,
"Nucleotide GTR":0.000963637379596085,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCG", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425485_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425585_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009660158122335598,
"Nucleotide GTR":0.0009637295125290833,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "C", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TGC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425585_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425846_Scotland_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009661396567073787,
"Nucleotide GTR":0.0009638530638963294,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "N", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAT", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425846_Scotland_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426307_New_York_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009659234607738302,
"Nucleotide GTR":0.0009636373796404289,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGG", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426307_New_York_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426320_New_York_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009659240805124947,
"Nucleotide GTR":0.0009636379979123379,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCG", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426320_New_York_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426457_Virginia_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009667414972363537,
"Nucleotide GTR":0.0009644534800305818,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "M", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "ATG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426457_Virginia_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426483_Arizona_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009663375610249247,
"Nucleotide GTR":0.0009640504998275639,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "I", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "ATT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426483_Arizona_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426835_Victoria_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009659632545974224,
"Nucleotide GTR":0.0009636770792827381,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "N", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "AAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426835_Victoria_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426880_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009668897744393316,
"Nucleotide GTR":0.0009646014063012863,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "V", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAT", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GTC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426880_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426901_Northern_territory_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009661919527587415,
"Nucleotide GTR":0.000963905236176998,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "V", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GTG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426901_Northern_territory_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427052_Victoria_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTT", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427052_Victoria_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427090_Victoria_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009750961863027064,
"Nucleotide GTR":0.0009727883957941576,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "-", "-", "-", "I", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "---", "---", "---", "ATA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427090_Victoria_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427219_Washington_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000966030749810103,
"Nucleotide GTR":0.0009637444147523994,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "L", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "CTT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427219_Washington_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427290_Ohio_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009661919527587415,
"Nucleotide GTR":0.000963905236176998,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "TTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427290_Ohio_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427291_Ohio_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.05016928343318908,
"Nucleotide GTR":0.05005054622781977,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "A", "G", "F", "K", "F", "L", "-", "I", "S", "T", "L", "S", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "E", "V", "S", "G", "N", "C", "W", "T", "T", "P", "S", "T", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "L", "-", "-", "L", "N", "-", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GCT", "GGG", "TTT", "AAA", "TTC", "TTG", "---", "ATT", "TCT", "ACT", "CTG", "AGT", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "GAA", "GTT", "TCA", "GGT", "AAT", "TGT", "TGG", "ACA", "ACA", "CCA", "TCA", "ACT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTC", "TTA", "---", "---", "TTG", "AAC", "---", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 2, 0, 1.5, 1, 2, 2.166666666666667, 1.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 2.25, 0, 2, 2, 2, 2, 2, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1.5, 0, 0, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427291_Ohio_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0.5, 1, 1, 0.8333333333333334, 0.5, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0.75, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427384_Liege_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001932593429269915,
"Nucleotide GTR":0.001928019500220038,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAC", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTC", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427384_Liege_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427406_Doha_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "KR", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "ARA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427406_Doha_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427450_Wisconsin_20200413_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000966045775527211,
"Nucleotide GTR":0.000963759404907674,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "C", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TGC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427450_Wisconsin_20200413_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427614_New_York_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAY", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427614_New_York_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427712_New_South_Wales_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009662160403873711,
"Nucleotide GTR":0.000963929266796686,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "C", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "G", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "TGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GGA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427712_New_South_Wales_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427779_New_South_Wales_20200324_null_3":{
"Global MG94xREV":0.000966377566893205,
"Nucleotide GTR":0.0009640904110127095,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "K", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "AAG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427779_New_South_Wales_20200324_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428204_Nebraska_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000966045775527211,
"Nucleotide GTR":0.000963759404907674,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "G", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GGT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428204_Nebraska_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428230_New_Taipei_City_20200317_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0009659110092898109,
"Nucleotide GTR":0.0009636249576257254,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTG", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428230_New_Taipei_City_20200317_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428487_Karnataka_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009657804212171481,
"Nucleotide GTR":0.0009634946786199197,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "G", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GGC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428487_Karnataka_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428792_New_York_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009657673404913323,
"Nucleotide GTR":0.000963481628852665,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCG", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428792_New_York_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429008_California_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000965969268805005,
"Nucleotide GTR":0.0009636830792563103,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "L", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CTA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429008_California_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429644_Washington_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009659692687361141,
"Nucleotide GTR":0.0009636830791875802,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "F", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429644_Washington_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429685_Minas_gerais_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009665051484284887,
"Nucleotide GTR":0.0009642176905968007,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "I", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "ATA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429685_Minas_gerais_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429724_Luxembourg_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000966045775527211,
"Nucleotide GTR":0.000963759404907674,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "V", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "GTT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429724_Luxembourg_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429756_Luxembourg_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009660307498119987,
"Nucleotide GTR":0.0009637444147542882,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "T", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "ACG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429756_Luxembourg_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430132_Washington_20200317_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "V", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GTT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430132_Washington_20200317_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430285_Washington_20200301_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0009659886758091482,
"Nucleotide GTR":0.0009637024403292919,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "L", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CTC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430285_Washington_20200301_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430403_New_York_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009665618747275636,
"Nucleotide GTR":0.0009642742826399775,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "R", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "AGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430403_New_York_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430471_Victoria_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "TI", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "AYC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430471_Victoria_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430474_Victoria_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "IM", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATR", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430474_Victoria_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430483_Victoria_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009669133263049756,
"Nucleotide GTR":0.0009646249024259977,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "C", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "N", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGT", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAT", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430483_Victoria_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430504_Victoria_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGY", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430504_Victoria_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430511_Victoria_20200402_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0009657594847646191,
"Nucleotide GTR":0.0009634737917183455,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTC", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430511_Victoria_20200402_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430520_Victoria_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "VF", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "KTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430520_Victoria_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430524_Victoria_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009660457755237612,
"Nucleotide GTR":0.0009637594049042322,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "M", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATG", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430524_Victoria_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430572_Victoria_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTY", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430572_Victoria_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430582_Victoria_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "KAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430582_Victoria_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430595_Victoria_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "GC", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "KGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430595_Victoria_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430621_Victoria_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "GV", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GKC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430621_Victoria_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430634_Northern_Territory_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "SL", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "C", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TYA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "TGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430634_Northern_Territory_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430644_Victoria_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "VL", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "KTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430644_Victoria_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430674_Victoria_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "AV", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GYT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430674_Victoria_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431833_Manila_20200322_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0009676023071306016,
"Nucleotide GTR":0.000965312252619248,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "T", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "ACT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431833_Manila_20200322_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431901_Wales_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTR", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431901_Wales_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432013_Wales_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "KE", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "RAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432013_Wales_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432034_Wales_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009662513521510216,
"Nucleotide GTR":0.0009639644949868865,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "Y", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "TAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432034_Wales_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432049_Wales_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "DG", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GRT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432049_Wales_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432055_Wales_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "KT", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "AMG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432055_Wales_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432181_Wales_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "PL", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CYA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432181_Wales_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432208_Wales_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACK", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432208_Wales_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432310_Wales_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "VF", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "KTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432310_Wales_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432532_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009660843423601239,
"Nucleotide GTR":0.0009637978804632618,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAG", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432532_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432558_England_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "C", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "TGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432558_England_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432594_England_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009671951743770576,
"Nucleotide GTR":0.0009649060834394697,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "EAGV", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATC", "G-A", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432594_England_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432760_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009663026596774902,
"Nucleotide GTR":0.0009640156810822363,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "N", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AAT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432760_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432908_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009660801152984117,
"Nucleotide GTR":0.0009637936634058682,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "R", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "AGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432908_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433000_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000965758844220977,
"Nucleotide GTR":0.0009634731526906973,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGC", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433000_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433015_England_20200403_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "S", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "TCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433015_England_20200403_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433093_Scotland_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "G", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "GGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433093_Scotland_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433188_Scotland_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009668943477188097,
"Nucleotide GTR":0.0009646059687570408,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACA", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433188_Scotland_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433214_Scotland_20200401_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0009664511505646523,
"Nucleotide GTR":0.0009641638205313903,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "I", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ATA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433214_Scotland_20200401_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433456_Scotland_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009657594847646191,
"Nucleotide GTR":0.0009634737917183455,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTC", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433456_Scotland_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433537_Scotland_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009656670778313436,
"Nucleotide GTR":0.0009633816034874347,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "G", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GGA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433537_Scotland_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433551_Scotland_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009665316311114135,
"Nucleotide GTR":0.0009642441106023363,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAT", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433551_Scotland_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433719_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009663757962389505,
"Nucleotide GTR":0.0009640886445491173,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAT", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAC", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433719_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433733_England_20200405_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009657588988378757,
"Nucleotide GTR":0.0009634732071783322,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "L", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "CTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433733_England_20200405_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434125_Washington_20200310_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000966095430001414,
"Nucleotide GTR":0.0009638089418630874,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTA", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434125_Washington_20200310_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434146_Washington_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009657594847646191,
"Nucleotide GTR":0.0009634737917183455,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "L", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "CTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434146_Washington_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434308_Washington_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009661872760890624,
"Nucleotide GTR":0.0009639005705757385,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "A", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "GCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434308_Washington_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434498_Luxembourg_20200415_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0003737984886283085,
"Nucleotide GTR":0.0003729138081052137,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "I", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATT", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434498_Luxembourg_20200415_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434554_Manila_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00193764819937787,
"Nucleotide GTR":0.001933062307046173,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "C", "T", "V", "K", "Y", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "TGT", "ACA", "GTT", "AAA", "TAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434554_Manila_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434694_Samut_Prakarn_20200122_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "SG", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "RGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434694_Samut_Prakarn_20200122_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434740_Texas_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001932425727729701,
"Nucleotide GTR":0.001927852195584283,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "L", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "TTG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTC", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434740_Texas_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434820_Texas_20200320_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0009661749839896278,
"Nucleotide GTR":0.0009638883075683979,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "D", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GAT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434820_Texas_20200320_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434967_Texas_20200330_null_10":{
"Global MG94xREV":0.0009657594648802341,
"Nucleotide GTR":0.0009634737718810202,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTC", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434967_Texas_20200330_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434988_Texas_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009658509080809016,
"Nucleotide GTR":0.0009635649986602177,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAC", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434988_Texas_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435053_Gujarat_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009659604538750508,
"Nucleotide GTR":0.0009636742851889244,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "A", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTT", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GCT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435053_Gujarat_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435060_Uttar_Pradesh_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "DG", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GRT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435060_Uttar_Pradesh_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435066_Delhi_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "MI", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATK", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435066_Delhi_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435105_Ladakh_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009661749839850433,
"Nucleotide GTR":0.0009638883075638254,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "T", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "ACT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435105_Ladakh_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435126_United_Arab_Emirates_20200225_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009664797837609646,
"Nucleotide GTR":0.0009641923859606264,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCA", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435126_United_Arab_Emirates_20200225_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435554_Louisiana_20200425_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009666143046322675,
"Nucleotide GTR":0.0009643265884571932,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "L", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TTG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435554_Louisiana_20200425_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435696_Singapore_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "KQ", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "MAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435696_Singapore_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435722_New_York_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "V", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "GTG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435722_New_York_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436111_Victoria_20200407_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "KR", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "ARA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436111_Victoria_20200407_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436117_Victoria_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "L", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "TS", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "TTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "WCT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436117_Victoria_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436118_Victoria_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "YAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436118_Victoria_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436382_Comunitat_Valenciana_20200317_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0009659558587040706,
"Nucleotide GTR":0.0009636697008934789,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "I", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ATT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436382_Comunitat_Valenciana_20200317_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436429_Delhi_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "LF", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTK", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436429_Delhi_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436613_Wisconsin_20200421_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001934702896846236,
"Nucleotide GTR":0.001930123975253758,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "V", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "Q", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GTA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "CAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436613_Wisconsin_20200421_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436729_Abruzzo_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAR", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436729_Abruzzo_20200427_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436872_Michigan_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009662262629116253,
"Nucleotide GTR":0.0009639394651269759,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "H", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "CAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436872_Michigan_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436876_Michigan_20200327_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0009659692687307759,
"Nucleotide GTR":0.0009636830791822535,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAT", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436876_Michigan_20200327_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436982_Unknown_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009657594847646191,
"Nucleotide GTR":0.0009634737917183455,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTC", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436982_Unknown_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437043_California_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "DY", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "KAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437043_California_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437053_California_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAY", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437053_California_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437098_Michigan_20200312_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009666143046322675,
"Nucleotide GTR":0.0009643265884571932,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "C", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGT", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437098_Michigan_20200312_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437187_Surabaya_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000965969268805005,
"Nucleotide GTR":0.0009636830792563103,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTT", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437187_Surabaya_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437255_Bavaria_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000965911019655365,
"Nucleotide GTR":0.0009636249679667439,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGG", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437255_Bavaria_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437289_Bavaria_20200403_null_13":{
"Global MG94xREV":0.000966418029343932,
"Nucleotide GTR":0.0009641307776996953,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "L", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "TTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437289_Bavaria_20200403_null_13",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437343_Kinshasa_20200415_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009661396567073787,
"Nucleotide GTR":0.0009638530638963294,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "I", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "ATT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437343_Kinshasa_20200415_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437355_Kinshasa_20200417_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0009673777292109733,
"Nucleotide GTR":0.0009650882062151755,
"amino-acid": [
["C", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437355_Kinshasa_20200417_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437374_Minnesota_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009663607283435142,
"Nucleotide GTR":0.0009640736123153388,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "L", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "F", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "TTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "TTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437374_Minnesota_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437430_Virginia_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000966452476327462,
"Nucleotide GTR":0.0009641651431564769,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAG", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCT", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437430_Virginia_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437463_Makkah_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00096662768027222,
"Nucleotide GTR":0.0009643399324406021,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "Y", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "TAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437463_Makkah_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437465_Makkah_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009660801152234841,
"Nucleotide GTR":0.0009637936633311182,
"amino-acid": [
["S", "L", "K", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "AAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437465_Makkah_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437536_West_Bengal_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002904009540545999,
"Nucleotide GTR":0.002897136530735736,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "M", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "V", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "ATG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GTA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAG", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437536_West_Bengal_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437571_California_20200425_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009659343178416583,
"Nucleotide GTR":0.0009636482110124962,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "T", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "ACA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437571_California_20200425_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437608_Thailand_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009661193067216578,
"Nucleotide GTR":0.0009638327620735536,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "G", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "L", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GGC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "TTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437608_Thailand_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437694_Makkah_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "L", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "CTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437694_Makkah_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437846_Washington_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009660441470622721,
"Nucleotide GTR":0.000963757780296873,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGC", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437846_Washington_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437852_USA_20200405_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0003733252748296033,
"Nucleotide GTR":0.0003724417142763418,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "Y", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "TAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437852_USA_20200405_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437861_Washington_20200404_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "F", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "TTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437861_Washington_20200404_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437868_Connecticut_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACA", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437868_Connecticut_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437893_Athens_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000344133561038339,
"Nucleotide GTR":0.0003433190894231347,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "R", "K", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "AGA", "AAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437893_Athens_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437925_Ischgl_20200309_null_15":{
"Global MG94xREV":0.0009659794018334723,
"Nucleotide GTR":0.0009636931883026224,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "Y", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "TAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437925_Ischgl_20200309_null_15",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437978_Ischgl_20200311_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0006563561229498749,
"Nucleotide GTR":0.0006548027044748064,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "M", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ATG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437978_Ischgl_20200311_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438044_Vienna_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTY", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438044_Vienna_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438058_Vienna_20200317_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0009652004676785883,
"Nucleotide GTR":0.0009629160976754579,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "S", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AGT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438058_Vienna_20200317_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438084_Vienna_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "GV", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GKA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438084_Vienna_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438085_Vienna_20200322_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0003733253294396023,
"Nucleotide GTR":0.0003724417687570923,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTT", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438085_Vienna_20200322_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438162_Washington_20200423_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000965767340410124,
"Nucleotide GTR":0.0009634816287716477,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAG", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438162_Washington_20200423_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438167_Washington_20200423_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009713420647701485,
"Nucleotide GTR":0.0009690431592579342,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "P", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CCT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438167_Washington_20200423_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438260_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009660451233355978,
"Nucleotide GTR":0.0009637587542596224,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "R", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CGT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438260_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438282_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009659647647623084,
"Nucleotide GTR":0.0009636785858734701,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAC", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438282_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438393_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAY", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438393_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438396_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009662513521379517,
"Nucleotide GTR":0.0009639644949738474,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "C", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "TGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438396_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438460_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009661784043513378,
"Nucleotide GTR":0.0009638917198350336,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "S", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "TCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438460_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438461_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "LF", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTW", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438461_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438473_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "ED", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAM", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438473_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438515_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000965837837523215,
"Nucleotide GTR":0.0009635519590370271,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCC", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438515_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438534_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009668331622306988,
"Nucleotide GTR":0.0009645449280785311,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "V", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAT", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GTT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438534_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438968_Kanto_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009667751451258098,
"Nucleotide GTR":0.0009644870482845301,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "N", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "AAT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438968_Kanto_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439005_Scotland_20200423_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0003694709145158022,
"Nucleotide GTR":0.0003685964761971198,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "E", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "GAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439005_Scotland_20200423_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439042_Scotland_20200425_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009659104582623025,
"Nucleotide GTR":0.0009636244079023492,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAG", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439042_Scotland_20200425_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439159_Scotland_20200420_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0003733253294386006,
"Nucleotide GTR":0.0003724417687560943,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "F", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TTT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439159_Scotland_20200420_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439223_Scotland_20200423_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009666276803496195,
"Nucleotide GTR":0.0009643399325178191,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "F", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "TTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439223_Scotland_20200423_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439229_Scotland_20200424_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009670475817204893,
"Nucleotide GTR":0.0009647588400950387,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "V", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAC", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GTA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439229_Scotland_20200424_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439285_Scotland_20200414_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0009661003668611769,
"Nucleotide GTR":0.0009638138670386293,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTT", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439285_Scotland_20200414_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439297_Scotland_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009667885047626954,
"Nucleotide GTR":0.0009645003763027477,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "T", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "ACA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439297_Scotland_20200427_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439335_Scotland_20200430_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000966485359848023,
"Nucleotide GTR":0.0009641979488505863,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "E", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GAA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439335_Scotland_20200430_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439379_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009676023071306016,
"Nucleotide GTR":0.000965312252619248,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATA", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439379_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439399_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "AS", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "KCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439399_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439408_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "PS", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAC", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "YCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439408_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439419_England_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "RW", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "YGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439419_England_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439434_England_20200401_null_9":{
"Global MG94xREV":0.0009660451232931848,
"Nucleotide GTR":0.0009637587542173105,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTG", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439434_England_20200401_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439445_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "AV", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GYT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439445_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439476_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAC", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACK", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439476_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439651_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTR", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439651_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439681_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009657624701611651,
"Nucleotide GTR":0.0009634767700492592,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATC", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439681_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439777_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009657594648802341,
"Nucleotide GTR":0.0009634737718810202,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAC", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439777_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439920_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009661003668611769,
"Nucleotide GTR":0.0009638138670386293,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "S", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "TCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439920_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439944_England_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009672652857360525,
"Nucleotide GTR":0.0009649760288637283,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "N", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "L", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAT", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "TTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439944_England_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440019_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACR", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440019_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440082_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000966030749810103,
"Nucleotide GTR":0.0009637444147523994,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "A", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GCT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440082_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440096_England_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000966166392441386,
"Nucleotide GTR":0.0009638797363540428,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "V", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "L", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "GTA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "TTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440096_England_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440217_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009660196654846868,
"Nucleotide GTR":0.0009637333566606,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "V", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "GTA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440217_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440247_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "SL", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "L", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TYG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "TTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440247_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440257_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009661784043556334,
"Nucleotide GTR":0.0009638917198393181,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "F", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "TTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440257_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440277_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCY", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440277_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440325_England_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "YC", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TRT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440325_England_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440364_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "TM", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "AYG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440364_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440382_England_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "TR", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "ASA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440382_England_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440508_England_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "IL", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "MTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440508_England_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440515_England_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009657033424969939,
"Nucleotide GTR":0.0009634177823243725,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "E", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "V", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "GAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GTT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440515_England_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440591_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009675948002534188,
"Nucleotide GTR":0.0009653047635088259,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "L", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CTA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440591_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440631_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009661784043556334,
"Nucleotide GTR":0.0009638917198393181,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTT", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440631_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440640_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAR", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440640_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440669_England_20200401_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0009663026587707816,
"Nucleotide GTR":0.0009640156801776722,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "K", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AAA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440669_England_20200401_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440731_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "ND", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "RAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440731_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440740_England_20200405_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0009662675208154609,
"Nucleotide GTR":0.0009639806253844444,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "L", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CTA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440740_England_20200405_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440767_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009659424481293821,
"Nucleotide GTR":0.0009636563220580157,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "L", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TTA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440767_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440779_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009659343377456704,
"Nucleotide GTR":0.0009636482308694023,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGG", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440779_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440819_England_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009649058358206794,
"Nucleotide GTR":0.0009626221631319427,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCG", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440819_England_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440821_England_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACR", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440821_England_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441060_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAY", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441060_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441072_England_20200403_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAR", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441072_England_20200403_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441079_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009658448697015039,
"Nucleotide GTR":0.0009635589745720409,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAC", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441079_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441130_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "IV", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "RTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441130_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441132_England_20200402_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "V", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GTC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441132_England_20200402_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441224_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "GC", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "KGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441224_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441325_England_20200401_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001932161845392657,
"Nucleotide GTR":0.001927588937785781,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "S", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "TCT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441325_England_20200401_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441391_Northern_Ireland_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009661334206091684,
"Nucleotide GTR":0.0009638468425572858,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "V", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GTC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441391_Northern_Ireland_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441534_England_20200426_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009659794017571555,
"Nucleotide GTR":0.0009636931882264853,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "V", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GTT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441534_England_20200426_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441548_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "IF", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "WTT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441548_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441555_England_20200405_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "A", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "GCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441555_England_20200405_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441570_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "I", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "VL", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "ATT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "KTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441570_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441649_England_20200406_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "I", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "ATT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441649_England_20200406_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441783_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009660530055255645,
"Nucleotide GTR":0.0009637666177945651,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "K", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AAA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441783_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442025_England_20200411_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0009660457755237612,
"Nucleotide GTR":0.0009637594049042322,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "G", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GGC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442025_England_20200411_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442207_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009657594848296989,
"Nucleotide GTR":0.0009634737917832699,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTC", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442207_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442209_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009652815990437196,
"Nucleotide GTR":0.0009629970370244625,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "R", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAC", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CGA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442209_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442231_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "VF", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "KTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442231_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442233_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009680118504203477,
"Nucleotide GTR":0.0009657208266301367,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "DG", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATT", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GRC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442233_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442246_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCY", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442246_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442282_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "NI", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "AWT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442282_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442349_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009657594847646191,
"Nucleotide GTR":0.0009634737917183455,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAC", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442349_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442518_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000966079510690443,
"Nucleotide GTR":0.0009637930602288432,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAA", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442518_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442533_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000965749001342821,
"Nucleotide GTR":0.0009634633331079889,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "L", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAG", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "TTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442533_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442553_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009663026587871084,
"Nucleotide GTR":0.0009640156801939599,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "I", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "ATA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442553_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442636_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "SF", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TYT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442636_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442662_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009666143046322675,
"Nucleotide GTR":0.0009643265884571932,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "L", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CTT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442662_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442733_England_20200405_null_29":{
"Global MG94xREV":0.0009663026596774902,
"Nucleotide GTR":0.0009640156810822363,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "N", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "AAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442733_England_20200405_null_29",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442776_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAY", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442776_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442854_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0003720072856715632,
"Nucleotide GTR":0.0003711268444442836,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAG", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442854_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442906_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "KN", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTG", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAK", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442906_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442935_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0003721879635423127,
"Nucleotide GTR":0.0003713070946990903,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "T", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ACC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442935_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442942_England_20200408_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0009661396567073787,
"Nucleotide GTR":0.0009638530638963294,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "Y", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "TAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442942_England_20200408_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442963_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "SI", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AKT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442963_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443011_England_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "A", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAR", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "GCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443011_England_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443028_England_20200408_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0009661919527587415,
"Nucleotide GTR":0.000963905236176998,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "V", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GTC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443028_England_20200408_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443260_Ile_de_France_20200402_null_3":{
"Global MG94xREV":0.000966045775527211,
"Nucleotide GTR":0.000963759404907674,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "G", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GGT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443260_Ile_de_France_20200402_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443282_Bretagne_20200322_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009661396567073787,
"Nucleotide GTR":0.0009638530638963294,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "I", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "ATA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443282_Bretagne_20200322_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443284_Hauts_de_France_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009660629416603778,
"Nucleotide GTR":0.0009637765304132182,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "L", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "CTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443284_Hauts_de_France_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443291_Bretagne_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009664511505473003,
"Nucleotide GTR":0.0009641638205140791,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "TTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443291_Bretagne_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443325_England_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009663692837066188,
"Nucleotide GTR":0.0009640821474301987,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443325_England_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443382_England_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "YAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443382_England_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443488_England_20200415_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009667414972363537,
"Nucleotide GTR":0.0009644534800305818,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "S", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "AGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443488_England_20200415_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443501_England_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009662880607189283,
"Nucleotide GTR":0.0009640011166754823,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "V", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GTC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTG", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443501_England_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443505_England_20200416_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCY", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443505_England_20200416_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443510_England_20200416_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009663894363841661,
"Nucleotide GTR":0.0009641022524117764,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "S", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "L", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AGT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "TTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443510_England_20200416_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443538_England_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009659675195604553,
"Nucleotide GTR":0.000963681334151752,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "S", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "TCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443538_England_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443599_England_20200416_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTY", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443599_England_20200416_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443615_England_20200414_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0003721737070688084,
"Nucleotide GTR":0.0003712928719668253,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAC", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443615_England_20200414_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443625_England_20200414_null_6":{
"Global MG94xREV":0.000440908032253266,
"Nucleotide GTR":0.0004398645214834874,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "D", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAC", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443625_England_20200414_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443690_England_20200329_null_3":{
"Global MG94xREV":0.000965683923765471,
"Nucleotide GTR":0.000963398409551765,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "R", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CGT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443690_England_20200329_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443803_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "EA", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GMA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443803_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443807_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "QH", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAM", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443807_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443907_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAR", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443907_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443923_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "GV", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GKT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443923_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443979_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "PL", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CYA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443979_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443989_England_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009673777292109733,
"Nucleotide GTR":0.0009650882062151755,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "N", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAT", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443989_England_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444004_England_20200325_null_34":{
"Global MG94xREV":0.0009666143046322675,
"Nucleotide GTR":0.0009643265884571932,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "F", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "TTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444004_England_20200325_null_34",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444065_California_20200430_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009676023071234479,
"Nucleotide GTR":0.0009653122526121104,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "Y", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TAC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444065_California_20200430_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444095_England_20200406_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0003729018714688238,
"Nucleotide GTR":0.0003720193129974807,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "S", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "AGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444095_England_20200406_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444128_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009659841918199497,
"Nucleotide GTR":0.0009636979669524911,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "S", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "L", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "AGT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "TTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444128_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444199_England_20200415_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009660730900597575,
"Nucleotide GTR":0.0009637866547940659,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "Y", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "TAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444199_England_20200415_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444240_England_20200418_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009669123250024523,
"Nucleotide GTR":0.0009646239034932884,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCA", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444240_England_20200418_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444241_England_20200418_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009660801152984117,
"Nucleotide GTR":0.0009637936634058682,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTA", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444241_England_20200418_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444283_England_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "I", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATT", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444283_England_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444435_England_20200418_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAT", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444435_England_20200418_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444438_England_20200417_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0009660348927508752,
"Nucleotide GTR":0.0009637485478879426,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "S", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "TCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444438_England_20200417_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444447_England_20200416_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0009657594847646191,
"Nucleotide GTR":0.0009634737917183455,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTC", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444447_England_20200416_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444574_Illinois_20200319_null_8":{
"Global MG94xREV":0.0003733110823723368,
"Nucleotide GTR":0.0003724275554088056,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "V", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GTT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444574_Illinois_20200319_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444606_Illinois_20200320_null_25":{
"Global MG94xREV":0.000965969268805005,
"Nucleotide GTR":0.0009636830792563103,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTT", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444606_Illinois_20200320_null_25",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444613_New_York_20200403_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009660801152984117,
"Nucleotide GTR":0.0009637936634058682,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "I", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "ATT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444613_New_York_20200403_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444670_New_Jersey_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009666143046321928,
"Nucleotide GTR":0.0009643265884571184,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "C", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "TGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444670_New_Jersey_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444698_New_York_20200330_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0009659692687361141,
"Nucleotide GTR":0.0009636830791875802,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "L", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CTT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444698_New_York_20200330_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444735_New_York_20200402_null_8":{
"Global MG94xREV":0.0003733110823704002,
"Nucleotide GTR":0.0003724275554068737,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "F", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TTT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444735_New_York_20200402_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444743_New_York_20200402_null_17":{
"Global MG94xREV":0.0009663240155764379,
"Nucleotide GTR":0.0009640369864375111,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "S", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "AGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444743_New_York_20200402_null_17",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444781_New_York_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00096662768027222,
"Nucleotide GTR":0.0009643399324406021,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "S", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGT", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444781_New_York_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444853_Unknown_20200403_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0009660730910701072,
"Nucleotide GTR":0.0009637866558020246,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "N", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAT", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444853_Unknown_20200403_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444867_Unknown_20200327_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0009660801152234841,
"Nucleotide GTR":0.0009637936633311182,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "K", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "AAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444867_Unknown_20200327_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444889_Unknown_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009665673041740976,
"Nucleotide GTR":0.000964279699236472,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "IM", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATN", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444889_Unknown_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444906_Unknown_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "Y", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "TAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444906_Unknown_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444918_Unknown_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009667414972363537,
"Nucleotide GTR":0.0009644534800305818,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "N", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "AAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444918_Unknown_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444919_Unknown_20200329_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0009666143046322675,
"Nucleotide GTR":0.0009643265884571932,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "Y", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "TAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444919_Unknown_20200329_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444946_Unknown_20200329_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0003733253304056105,
"Nucleotide GTR":0.0003724417697208152,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "L", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TTA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444946_Unknown_20200329_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444973_Catalonia_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009667873652959238,
"Nucleotide GTR":0.0009644992395327871,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "C", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "TGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444973_Catalonia_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445035_Florida_20200428_null_5":{
"Global MG94xREV":0.000965969268805005,
"Nucleotide GTR":0.0009636830792563103,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "I", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ATA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445035_Florida_20200428_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445068_Luxembourg_20200428_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009673777292842946,
"Nucleotide GTR":0.0009650882062883229,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "Y", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "TAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445068_Luxembourg_20200428_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445087_Kraljevo_20200404_null_16":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "I", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ATA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445087_Kraljevo_20200404_null_16",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445109_California_20200312_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0003756264373925365,
"Nucleotide GTR":0.0003747374306061787,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGT", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445109_California_20200312_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445149_Louisiana_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009664820260885694,
"Nucleotide GTR":0.0009641946229812436,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "D", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "GAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445149_Louisiana_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445165_California_20200317_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0003733395782674236,
"Nucleotide GTR":0.0003724559838617698,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "C", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "TGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445165_California_20200317_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445169_California_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009660801152984117,
"Nucleotide GTR":0.0009637936634058682,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "I", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "ATT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445169_California_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445256_Santiago_20200310_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0009664913660927658,
"Nucleotide GTR":0.0009642039408801619,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "V", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GTT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445256_Santiago_20200310_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445266_Antofagasta_20200312_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009660451232931848,
"Nucleotide GTR":0.0009637587542173105,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "G", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GGT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445266_Antofagasta_20200312_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445273_Rancagua_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009654063777358918,
"Nucleotide GTR":0.0009631215203990173,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "L", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CTA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445273_Rancagua_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445306_Santiago_20200316_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0009673646738888635,
"Nucleotide GTR":0.0009650751817915028,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACT", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445306_Santiago_20200316_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445335_Puerto_Montt_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGY", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445335_Puerto_Montt_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445382_Wales_20200402_null_30":{
"Global MG94xREV":0.0009663787955234339,
"Nucleotide GTR":0.0009640916367351017,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCA", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445382_Wales_20200402_null_30",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445415_Wales_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0003733253295204993,
"Nucleotide GTR":0.0003724417688377983,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAT", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445415_Wales_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445426_Wales_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "IV", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAC", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "RTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445426_Wales_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445433_Wales_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0004559073800883426,
"Nucleotide GTR":0.0004548283698949639,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACT", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445433_Wales_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445452_Wales_20200403_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0009657594648802341,
"Nucleotide GTR":0.0009634737718810202,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTC", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445452_Wales_20200403_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445488_Wales_20200403_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "I", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "ATT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445488_Wales_20200403_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445511_Wales_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "SG", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "RGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445511_Wales_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445512_Wales_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "WC", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGK", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445512_Wales_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445561_Wales_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "NI", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AWT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445561_Wales_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445606_Wales_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "SL", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TYA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445606_Wales_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445649_Wales_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTR", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445649_Wales_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445745_Wales_20200412_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "AV", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GYT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445745_Wales_20200412_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445768_Wales_20200409_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "Y", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "TAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445768_Wales_20200409_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445788_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "SF", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TYT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445788_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445789_Wales_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009660801152234841,
"Nucleotide GTR":0.0009637936633311182,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "N", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AAT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445789_Wales_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445832_Wales_20200410_null_8":{
"Global MG94xREV":0.0009662052215049694,
"Nucleotide GTR":0.000963918473519671,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "Y", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "TAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445832_Wales_20200410_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445868_Wales_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009659692687361141,
"Nucleotide GTR":0.0009636830791875802,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "S", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "TCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445868_Wales_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445903_Wales_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "ILVF", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "S", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "NTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "TCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445903_Wales_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445916_Wales_20200401_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "TM", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "AYG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445916_Wales_20200401_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445918_Wales_20200401_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTR", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445918_Wales_20200401_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445934_Wales_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "WGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445934_Wales_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446053_Wales_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAY", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446053_Wales_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446084_Wales_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "VL", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "KTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446084_Wales_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446208_Wales_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "N", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAT", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446208_Wales_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446225_Wales_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009649058061079731,
"Nucleotide GTR":0.0009626221334895586,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "G", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GGA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446225_Wales_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446254_Wales_20200408_null_3":{
"Global MG94xREV":0.000965995530727099,
"Nucleotide GTR":0.0009637092790234949,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "M", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATG", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446254_Wales_20200408_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446265_Wales_20200418_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "KR", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "ARA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446265_Wales_20200418_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446410_Wales_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009673777292109733,
"Nucleotide GTR":0.0009650882062151755,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATT", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446410_Wales_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446454_Wales_20200412_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "SL", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TYA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446454_Wales_20200412_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446504_Wales_20200411_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000965969268805005,
"Nucleotide GTR":0.0009636830792563103,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "S", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "TCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446504_Wales_20200411_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446555_Wales_20200414_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009660801152984117,
"Nucleotide GTR":0.0009637936634058682,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "E", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GAA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446555_Wales_20200414_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446640_Wales_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "HY", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "YAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446640_Wales_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446722_Wales_20200414_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCT", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446722_Wales_20200414_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446735_Wales_20200414_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "RG", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "RGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446735_Wales_20200414_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446811_Wales_20200418_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "I", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ATA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446811_Wales_20200418_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446829_Wales_20200415_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAY", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446829_Wales_20200415_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446835_Wales_20200415_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0009713569712461648,
"Nucleotide GTR":0.0009690580304543306,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "Q", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "CAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446835_Wales_20200415_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446846_Wales_20200417_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "EG", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GRA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446846_Wales_20200417_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446930_Wales_20200416_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "SF", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TYT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446930_Wales_20200416_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446978_Wales_20200416_null_8":{
"Global MG94xREV":0.0009661749839896278,
"Nucleotide GTR":0.0009638883075683979,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "N", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "AAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446978_Wales_20200416_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446979_Wales_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009661396567073787,
"Nucleotide GTR":0.0009638530638963294,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "L", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "TTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446979_Wales_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447025_Bangkok_20200402_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "V", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "GTT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447025_Bangkok_20200402_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447044_Gujarat_20200503_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009657594648802341,
"Nucleotide GTR":0.0009634737718810202,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAC", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447044_Gujarat_20200503_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447048_Gujarat_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0003769493350843822,
"Nucleotide GTR":0.000376057197354862,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "I", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATT", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447048_Gujarat_20200427_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447063_Michigan_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009662759837843206,
"Nucleotide GTR":0.0009639890683237323,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "T", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "ACA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447063_Michigan_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447217_Michigan_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "TI", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "AYA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447217_Michigan_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447224_Michigan_20200408_null_8":{
"Global MG94xREV":0.000966045775527211,
"Nucleotide GTR":0.000963759404907674,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTG", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447224_Michigan_20200408_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447297_South_Coast_District_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0003733253304056105,
"Nucleotide GTR":0.0003724417697208152,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCT", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447297_South_Coast_District_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447309_South_Coast_District_20200321_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009665929067493064,
"Nucleotide GTR":0.0009643052412172679,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "N", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAT", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447309_South_Coast_District_20200321_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447366_Jerusalem_District_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00096662768027222,
"Nucleotide GTR":0.0009643399324406021,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "F", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TTT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447366_Jerusalem_District_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447411_Jerusalem_District_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009666276803496195,
"Nucleotide GTR":0.0009643399325178191,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "L", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "TTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447411_Jerusalem_District_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447416_Tel_Aviv_District_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009660530055952973,
"Nucleotide GTR":0.0009637666178641326,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCA", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447416_Tel_Aviv_District_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447440_Tel_Aviv_District_20200402_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0003733253295204993,
"Nucleotide GTR":0.0003724417688377983,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "L", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TTA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447440_Tel_Aviv_District_20200402_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447470_Comunitat_Valenciana_20200326_null_16":{
"Global MG94xREV":0.0003733395777523883,
"Nucleotide GTR":0.0003724559833479536,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTT", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447470_Comunitat_Valenciana_20200326_null_16",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447517_Comunitat_Valenciana_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAY", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447517_Comunitat_Valenciana_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447547_Gujarat_20200428_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "A", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GCT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447547_Gujarat_20200428_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447552_Gujarat_20200502_null_15":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTT", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447552_Gujarat_20200502_null_15",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447799_Cesar_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009657542901127143,
"Nucleotide GTR":0.0009634686093607835,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTG", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447799_Cesar_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447810_Risaralda_20200405_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAC", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447810_Risaralda_20200405_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447861_Telangana_20200416_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "GV", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GKT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447861_Telangana_20200416_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447863_Telangana_20200414_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0003662075214204216,
"Nucleotide GTR":0.0003653408066757996,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "V", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GTT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447863_Telangana_20200414_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447865_Telangana_20200414_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009668961908360748,
"Nucleotide GTR":0.000964607807512144,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "DAGV", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "T", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GNT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "ACA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447865_Telangana_20200414_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447866_Telangana_20200414_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009659558587782668,
"Nucleotide GTR":0.0009636697009675,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAT", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447866_Telangana_20200414_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447940_England_20200429_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0009660293399091414,
"Nucleotide GTR":0.0009637430081882941,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTT", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447940_England_20200429_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448006_England_20200501_null_3":{
"Global MG94xREV":0.000966645796807583,
"Nucleotide GTR":0.0009643580060989958,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "S", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "I", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "TCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ATA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448006_England_20200501_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448021_England_20200501_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009659784779024319,
"Nucleotide GTR":0.0009636922665582772,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "I", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAC", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "ATT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448021_England_20200501_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448022_England_20200502_null_27":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTG", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448022_England_20200502_null_27",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448109_England_20200507_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00096662768027222,
"Nucleotide GTR":0.0009643399324406021,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "Y", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "TAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448109_England_20200507_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448113_England_20200506_null_14":{
"Global MG94xREV":0.0003733395749318284,
"Nucleotide GTR":0.0003724559805340692,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "F", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "TTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448113_England_20200506_null_14",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448135_Scotland_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001933134191607274,
"Nucleotide GTR":0.001928558982718336,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "I", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCG", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ATA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448135_Scotland_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448171_Scotland_20200412_null_83":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "L", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "TTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448171_Scotland_20200412_null_83",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448197_Scotland_20200421_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0003737566225804501,
"Nucleotide GTR":0.0003728720411430343,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "V", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GTT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448197_Scotland_20200421_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448318_England_20200422_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGK", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448318_England_20200422_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448368_England_20200502_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCY", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448368_England_20200502_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448394_England_20200501_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009659343076859108,
"Nucleotide GTR":0.0009636482008807839,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTA", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448394_England_20200501_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448403_England_20200501_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009657594546542175,
"Nucleotide GTR":0.0009634737616792063,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCC", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448403_England_20200501_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448423_England_20200429_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000966733340890117,
"Nucleotide GTR":0.0009644453429882235,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "I", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "V", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ATA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GTT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448423_England_20200429_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448426_England_20200429_null_160":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "V", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GTT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448426_England_20200429_null_160",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448444_England_20200422_null_12":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAG", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448444_England_20200422_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448489_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001932593429182548,
"Nucleotide GTR":0.001928019500132876,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTC", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAC", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448489_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448511_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009669254114816438,
"Nucleotide GTR":0.0009646369590003011,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "Y", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "TAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCA", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAG", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448511_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448524_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "EV", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GWA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448524_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448574_England_20200101_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "GV", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GKT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448574_England_20200101_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448589_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009660451233355978,
"Nucleotide GTR":0.0009637587542596224,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAG", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448589_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448608_England_20200101_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009673822566115247,
"Nucleotide GTR":0.000965092722900587,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "L", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTA", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448608_England_20200101_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448642_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "DA", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GMT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448642_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448739_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009661784043556334,
"Nucleotide GTR":0.0009638917198393181,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "V", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GTT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448739_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448748_England_20200101_null_15":{
"Global MG94xREV":0.0004392172400223017,
"Nucleotide GTR":0.0004381777309031471,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448748_England_20200101_null_15",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448749_England_20200101_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0009659570661518915,
"Nucleotide GTR":0.0009636709054835943,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAG", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448749_England_20200101_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448775_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "LF", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTK", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448775_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448784_England_20200407_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "Y", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "TAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCA", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448784_England_20200407_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448948_Northern_Ireland_20200329_null_16":{
"Global MG94xREV":0.000965969268805005,
"Nucleotide GTR":0.0009636830792563103,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAT", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448948_Northern_Ireland_20200329_null_16",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448989_England_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "KE", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "RAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448989_England_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449014_England_20200420_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTY", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449014_England_20200420_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449016_England_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "RC", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "YGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449016_England_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449029_England_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009672700975579414,
"Nucleotide GTR":0.0009649808292973282,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATA", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449029_England_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449064_England_20200504_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCM", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449064_England_20200504_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449072_England_20200504_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "MI", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATK", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449072_England_20200504_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449098_England_20200506_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "SF", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TYT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449098_England_20200506_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449109_England_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009659692687361141,
"Nucleotide GTR":0.0009636830791875802,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "L", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CTT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449109_England_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449114_England_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009660457556420154,
"Nucleotide GTR":0.0009637593850695413,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAG", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449114_England_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449123_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "PL", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CYT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449123_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449129_England_20200408_null_44":{
"Global MG94xREV":0.000373572837541309,
"Nucleotide GTR":0.0003726886910736683,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTT", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449129_England_20200408_null_44",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449139_England_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009649058358206794,
"Nucleotide GTR":0.0009626221631319427,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "E", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "GAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449139_England_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449142_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009673777292779302,
"Nucleotide GTR":0.0009650882062819735,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "L", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CTA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449142_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449143_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009659110398235626,
"Nucleotide GTR":0.0009636249880872104,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "S", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AGT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449143_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449150_England_20200418_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "EG", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GRA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449150_England_20200418_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449175_England_20200418_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "PL", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CYA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449175_England_20200418_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449221_Scotland_20200427_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0009661919527587415,
"Nucleotide GTR":0.000963905236176998,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "I", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ATT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449221_Scotland_20200427_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449252_Scotland_20200427_null_58":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "L", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "TTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449252_Scotland_20200427_null_58",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449315_Scotland_20200508_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "E", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "GAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449315_Scotland_20200508_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449604_England_20200428_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009660451233355978,
"Nucleotide GTR":0.0009637587542596224,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "V", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "GTC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449604_England_20200428_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449622_England_20200430_null_8":{
"Global MG94xREV":0.0009660799277641145,
"Nucleotide GTR":0.0009637934763154145,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "H", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAT", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449622_England_20200430_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449623_England_20200430_null_23026":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449623_England_20200430_null_23026",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449628_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000966810269758104,
"Nucleotide GTR":0.0009645220897862652,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTT", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449628_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449643_England_20200404_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAT", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449643_England_20200404_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449653_England_20200404_null_171":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "L", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "TTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449653_England_20200404_null_171",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449655_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000966045775527211,
"Nucleotide GTR":0.000963759404907674,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTG", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449655_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449670_England_20200415_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0009664613701237222,
"Nucleotide GTR":0.0009641740159035113,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCT", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449670_England_20200415_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449697_England_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009714012779387576,
"Nucleotide GTR":0.0009691022322848921,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "L", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "CTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449697_England_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449700_England_20200416_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "S", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "TCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449700_England_20200416_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449701_England_20200415_null_1237":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449701_England_20200415_null_1237",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449710_England_20200416_null_381":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAC", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449710_England_20200416_null_381",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449715_England_20200416_null_10":{
"Global MG94xREV":0.000383505746374487,
"Nucleotide GTR":0.0003825980913822009,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCT", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449715_England_20200416_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449719_England_20200417_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "N", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAT", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449719_England_20200417_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
}
},
"attributes":{
"Global MG94xREV":{
"attribute type":"branch length",
"display order":1
},
"Nucleotide GTR":{
"attribute type":"branch length",
"display order":0
},
"amino-acid":{
"attribute type":"node label",
"display order":1
},
"codon":{
"attribute type":"node label",
"display order":0
},
"nonsynonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":1
},
"original name":{
"attribute type":"node label",
"display order":-1
},
"synonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":0
}
}
},
"data partitions":{
"0":{
"coverage": [
[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311, 312, 313, 314, 315, 316, 317, 318, 319, 320, 321, 322, 323, 324, 325, 326, 327, 328, 329, 330, 331, 332, 333, 334, 335, 336, 337, 338, 339, 340, 341, 342, 343, 344, 345, 346]
],
"name":"slac.filter.default"
}
},
"fits":{
"Global MG94xREV":{
"AIC-c":10479.66366724635,
"Equilibrium frequencies": [
[0.04181990336357998],
[0.01154682836215501],
[0.01141509064016887],
[0.04676474834340695],
[0.01930784700827711],
[0.005331059555758828],
[0.005270237517046457],
[0.02159083435810663],
[0.01591990071220487],
[0.004395618982383097],
[0.004345469381705209],
[0.01780229246313002],
[0.03560910626191401],
[0.009831974850858714],
[0.009719801886226944],
[0.03981957774015984],
[0.01969338667967959],
[0.005437510313757544],
[0.005375473778741718],
[0.02202196078976737],
[0.009092247147974896],
[0.002510446194272893],
[0.002481804522947265],
[0.01016732740997675],
[0.007496831303072589],
[0.002069938411000664],
[0.002046322491341671],
[0.008383267321619018],
[0.01676866378281466],
[0.004629969631433184],
[0.004577146325068892],
[0.01875141448895496],
[0.04902546433819609],
[0.01353634457656579],
[0.01338190847146347],
[0.05482230511778374],
[0.02263458518117924],
[0.006249600049608541],
[0.006178298385806359],
[0.02531093079418926],
[0.01866289641676995],
[0.005152983252773177],
[0.005094192885941539],
[0.02086962388940837],
[0.04174454813969841],
[0.01152602214869278],
[0.01139452180471892],
[0.04668048301044946],
[0.01026932925457415],
[0.04159086661578455],
[0.01717169701550296],
[0.004741250509383493],
[0.004687157599895121],
[0.01920210294552161],
[0.003909303679934807],
[0.003864702448740052],
[0.01583271155127714],
[0.03166944421407032],
[0.008744200900836536],
[0.008644438345168795],
[0.03541408443655911]
],
"Log Likelihood":-4629.72818277722,
"Rate Distributions":{
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *background*": [
[0.578354322470091, 1]
],
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *test*": [
[0.613854274741967, 1]
]
},
"display order":1,
"estimated parameters":608
},
"Nucleotide GTR":{
"AIC-c":11458.8520632709,
"Equilibrium frequencies": [
[0.3312803848367359],
[0.1444297305688496],
[0.195481935693948],
[0.3288079489004665]
],
"Log Likelihood":-4704.44520171364,
"Rate Distributions":{
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide C":0.3733803686729198,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide G":1,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide T":0.1589539858336229,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide G":0.08828682735131303,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide T":1.445875724814358,
"Substitution rate from nucleotide G to nucleotide T":0.6296757759123403
},
"display order":0,
"estimated parameters":1023
}
},
"input":{
"file name":"/data/shares/veg/SARS-CoV-2/SARS-CoV-2/data/fasta/2020-05-19/sequences.endornase.compressed.fas",
"number of sequences":509,
"number of sites":347,
"partition count":1,
"trees":{
"0":"(epi_isl_441079_England_20200403_null_1,epi_isl_440779_England_20200401_null_1,epi_isl_441391_Northern_Ireland_20200314_null_1,epi_isl_428487_Karnataka_20200414_null_1,epi_isl_447309_South_Coast_District_20200321_null_2,(epi_isl_424298_Washington_20200323_null_1,epi_isl_437861_Washington_20200404_null_7)Node1007,epi_isl_442518_England_20200324_null_1,epi_isl_429008_California_20200328_null_1,epi_isl_416425_Hangzhou_20200203_null_1,epi_isl_447366_Jerusalem_District_20200401_null_1,epi_isl_436876_Michigan_20200327_null_3,epi_isl_416392_Shanghai_20200202_null_1,epi_isl_447411_Jerusalem_District_20200317_null_2,epi_isl_446504_Wales_20200411_null_2,epi_isl_416361_Shanghai_20200201_null_1,epi_isl_439042_Scotland_20200425_null_1,epi_isl_446555_Wales_20200414_null_2,epi_isl_421592_New_York_20200318_null_1,epi_isl_443989_England_20200327_null_2,epi_isl_427450_Wisconsin_20200413_null_2,epi_isl_416339_Shanghai_20200203_null_2,epi_isl_428230_New_Taipei_City_20200317_null_5,epi_isl_440767_England_20200402_null_1,epi_isl_447799_Cesar_20200404_null_1,(((epi_isl_448511_England_20200405_null_1,epi_isl_448784_England_20200407_null_3)Node257,epi_isl_421669_India_20200312_null_1)Node256,epi_isl_437043_California_20200401_null_1)Node255,epi_isl_449109_England_20200408_null_2,epi_isl_421336_Wisconsin_20200324_null_1,epi_isl_439379_England_20200329_null_1,epi_isl_445382_Wales_20200402_null_30,epi_isl_417236_England_20200301_null_1,epi_isl_417743_Reykjavik_20200316_null_1,epi_isl_442025_England_20200411_null_3,epi_isl_421281_Indiana_20200319_null_1,epi_isl_439297_Scotland_20200427_null_1,epi_isl_440217_England_20200322_null_1,epi_isl_448948_Northern_Ireland_20200329_null_16,epi_isl_421221_Hangzhou_20200315_null_1,epi_isl_431833_Manila_20200322_null_3,epi_isl_434820_Texas_20200320_null_4,epi_isl_440640_England_20200402_null_1,epi_isl_444853_Unknown_20200403_null_5,epi_isl_436382_Comunitat_Valenciana_20200317_null_6,epi_isl_449655_England_20200404_null_1,epi_isl_427219_Washington_20200327_null_1,epi_isl_443284_Hauts_de_France_20200402_null_1,epi_isl_449604_England_20200428_null_2,epi_isl_427290_Ohio_20200331_null_1,epi_isl_440082_England_20200323_null_1,epi_isl_448589_England_20200101_null_1,epi_isl_420997_Wales_20200323_null_1,epi_isl_437255_Bavaria_20200319_null_1,(epi_isl_421738_Luxembourg_20200317_null_1,epi_isl_445768_Wales_20200409_null_2)Node165,epi_isl_437289_Bavaria_20200403_null_13,epi_isl_443260_Ile_de_France_20200402_null_3,epi_isl_417240_England_20200303_null_4,epi_isl_438460_England_20200330_null_1,epi_isl_439434_England_20200401_null_9,epi_isl_446835_Wales_20200415_null_6,epi_isl_448739_England_20200101_null_1,epi_isl_444606_Illinois_20200320_null_25,epi_isl_449142_England_20200101_null_1,epi_isl_449143_England_20200408_null_1,epi_isl_438260_England_20200329_null_1,epi_isl_442733_England_20200405_null_29,epi_isl_442942_England_20200408_null_5,epi_isl_448403_England_20200501_null_1,epi_isl_439681_England_20200407_null_1,epi_isl_446254_Wales_20200408_null_3,epi_isl_445868_Wales_20200408_null_2,epi_isl_426483_Arizona_20200322_null_1,epi_isl_442662_England_20200405_null_1,epi_isl_439777_England_20200408_null_1,epi_isl_426901_Northern_territory_20200325_null_2,epi_isl_438167_Washington_20200423_null_1,((epi_isl_448171_Scotland_20200412_null_83,epi_isl_436117_Victoria_20200410_null_1,epi_isl_437374_Minnesota_20200410_null_1)Node282,epi_isl_430644_Victoria_20200326_null_1)Node281,epi_isl_438515_England_20200401_null_1,epi_isl_437187_Surabaya_20200325_null_1,epi_isl_417398_New_South_Wales_20200311_null_1,epi_isl_446410_Wales_20200410_null_1,epi_isl_444241_England_20200418_null_2,epi_isl_419749_Victoria_20200310_null_1,epi_isl_440257_England_20200321_null_1,epi_isl_428204_Nebraska_20200325_null_1,epi_isl_417030_New_South_Wales_20200124_null_1,epi_isl_437463_Makkah_20200323_null_1,epi_isl_445452_Wales_20200403_null_3,epi_isl_424541_Reykjavik_20200301_null_2,epi_isl_444919_Unknown_20200329_null_4,epi_isl_445789_Wales_20200328_null_2,epi_isl_425485_England_20200317_null_1,epi_isl_437098_Michigan_20200312_null_2,epi_isl_422590_Netherlands_20200331_null_1,epi_isl_423412_England_20200329_null_1,epi_isl_434125_Washington_20200310_null_2,epi_isl_439285_Scotland_20200414_null_7,epi_isl_444698_New_York_20200330_null_7,epi_isl_426307_New_York_20200326_null_1,epi_isl_444004_England_20200325_null_34,epi_isl_437465_Makkah_20200323_null_1,epi_isl_426320_New_York_20200320_null_1,epi_isl_445306_Santiago_20200316_null_4,epi_isl_440591_England_20200402_null_1,epi_isl_448489_England_20200405_null_1,(epi_isl_423354_England_20200329_null_2,epi_isl_442231_England_20200406_null_1)Node305,epi_isl_441130_England_20200403_null_1,(epi_isl_449014_England_20200420_null_3,epi_isl_449129_England_20200408_null_44)Node651,(epi_isl_439005_Scotland_20200423_null_1,epi_isl_448989_England_20200420_null_1)Node648,(epi_isl_442854_England_20200408_null_1,epi_isl_443907_England_20200326_null_1)Node645,(epi_isl_418949_Washington_20200316_null_1,epi_isl_442776_England_20200406_null_1)Node642,(epi_isl_419693_Belarus_20200301_null_1,epi_isl_435060_Uttar_Pradesh_20200312_null_1)Node639,(epi_isl_444574_Illinois_20200319_null_8,epi_isl_445745_Wales_20200412_null_2)Node636,(epi_isl_444735_New_York_20200402_null_8,epi_isl_446930_Wales_20200416_null_2)Node633,(epi_isl_445415_Wales_20200404_null_1,epi_isl_446053_Wales_20200410_null_1)Node630,(epi_isl_444946_Unknown_20200329_null_7,epi_isl_445606_Wales_20200405_null_1)Node627,(epi_isl_446454_Wales_20200412_null_2,epi_isl_447440_Tel_Aviv_District_20200402_null_6)Node609,(epi_isl_447297_South_Coast_District_20200324_null_2,epi_isl_448368_England_20200502_null_1)Node606,(epi_isl_438044_Vienna_20200315_null_1,epi_isl_438085_Vienna_20200322_null_7)Node592,(epi_isl_423227_England_20200324_null_1,epi_isl_448113_England_20200506_null_14)Node334,(epi_isl_434694_Samut_Prakarn_20200122_null_1,epi_isl_444095_England_20200406_null_2)Node328,epi_isl_436613_Wisconsin_20200421_null_1,epi_isl_443803_England_20200327_null_1,(epi_isl_423481_England_20200331_null_1,epi_isl_447470_Comunitat_Valenciana_20200326_null_16)Node589,(epi_isl_427614_New_York_20200316_null_1,epi_isl_443615_England_20200414_null_2)Node347,((epi_isl_427712_New_South_Wales_20200320_null_1,epi_isl_432558_England_20200402_null_2)Node342,epi_isl_441224_England_20200402_null_1)Node341,epi_isl_448524_England_20200406_null_1,(epi_isl_430471_Victoria_20200325_null_2,epi_isl_442935_England_20200408_null_1)Node586,(epi_isl_444889_Unknown_20200319_null_1,epi_isl_447048_Gujarat_20200427_null_1)Node583,epi_isl_449175_England_20200418_null_1,epi_isl_435696_Singapore_20200420_null_1,epi_isl_417312_England_20200308_null_1,epi_isl_449150_England_20200418_null_1,epi_isl_449098_England_20200506_null_1,epi_isl_449064_England_20200504_null_1,epi_isl_449016_England_20200419_null_1,epi_isl_448318_England_20200422_null_1,epi_isl_446735_Wales_20200414_null_2,epi_isl_445788_Wales_20200328_null_1,epi_isl_445649_Wales_20200408_null_1,epi_isl_445561_Wales_20200405_null_1,epi_isl_445512_Wales_20200404_null_1,epi_isl_445511_Wales_20200404_null_1,epi_isl_445335_Puerto_Montt_20200329_null_1,epi_isl_443979_England_20200326_null_1,epi_isl_443923_England_20200323_null_1,epi_isl_440508_England_20200312_null_1,epi_isl_440382_England_20200316_null_1,epi_isl_440325_England_20200320_null_2,epi_isl_440019_England_20200320_null_1,epi_isl_439651_England_20200325_null_1,epi_isl_439445_England_20200331_null_1,epi_isl_438461_England_20200329_null_1,epi_isl_438393_England_20200329_null_1,epi_isl_438084_Vienna_20200322_null_1,epi_isl_437053_California_20200406_null_1,epi_isl_436429_Delhi_20200405_null_1,epi_isl_436118_Victoria_20200411_null_1,epi_isl_432049_Wales_20200401_null_1,epi_isl_430595_Victoria_20200408_null_1,epi_isl_430572_Victoria_20200407_null_1,epi_isl_430474_Victoria_20200331_null_1,epi_isl_427406_Doha_20200323_null_2,epi_isl_425023_England_20200324_null_1,epi_isl_424138_England_20200320_null_1,epi_isl_423933_England_20200319_null_1,epi_isl_417487_Oslo_20200301_null_1,epi_isl_447866_Telangana_20200414_null_2,epi_isl_423825_England_20200322_null_1,epi_isl_446265_Wales_20200418_null_1,epi_isl_440364_England_20200320_null_1,epi_isl_439419_England_20200330_null_2,epi_isl_432013_Wales_20200331_null_2,epi_isl_422431_Singapore_20200331_null_1,epi_isl_422056_Wales_20200328_null_1,epi_isl_421963_England_20200401_null_1,epi_isl_423780_England_20200324_null_1,epi_isl_425585_England_20200324_null_1,epi_isl_423740_England_20200323_null_1,epi_isl_423579_England_20200331_null_1,epi_isl_423328_England_20200327_null_2,epi_isl_423130_England_20200324_null_1,epi_isl_423068_England_20200323_null_1,epi_isl_422312_Wales_20200328_null_1,epi_isl_422057_Wales_20200328_null_1,epi_isl_421956_England_20200331_null_1,epi_isl_421953_England_20200331_null_1,epi_isl_421948_England_20200331_null_1,(epi_isl_446811_Wales_20200418_null_6,epi_isl_448006_England_20200501_null_3)Node42,epi_isl_444438_England_20200417_null_5,epi_isl_421947_England_20200331_null_1,epi_isl_418715_England_20200317_null_1,epi_isl_421847_England_20200326_null_1,epi_isl_421686_Minnesota_20200317_null_1,epi_isl_420694_England_20200328_null_1,epi_isl_419427_Wales_20200318_null_1,epi_isl_423052_England_20200319_null_5,epi_isl_442282_England_20200404_null_1,epi_isl_423648_England_20200323_null_1,epi_isl_445934_Wales_20200401_null_1,epi_isl_436111_Victoria_20200407_null_2,epi_isl_427090_Victoria_20200403_null_1,epi_isl_419388_Minnesota_20200314_null_1,epi_isl_419419_Wales_20200318_null_1,epi_isl_449623_England_20200430_null_23026,epi_isl_424007_England_20200320_null_1,epi_isl_446846_Wales_20200417_null_3,epi_isl_432594_England_20200412_null_1,epi_isl_448608_England_20200101_null_2,((epi_isl_438534_England_20200331_null_1,epi_isl_449643_England_20200404_null_5)Node466,epi_isl_441060_England_20200402_null_1)Node465,epi_isl_430674_Victoria_20200410_null_1,(epi_isl_448423_England_20200429_null_1,epi_isl_425404_England_20200319_null_1,epi_isl_445087_Kraljevo_20200404_null_16)Node459,(epi_isl_440515_England_20200311_null_2,epi_isl_449315_Scotland_20200508_null_1)Node456,(epi_isl_424062_England_20200311_null_1,epi_isl_448426_England_20200429_null_160,epi_isl_423639_England_20200321_null_1,epi_isl_417288_England_20200305_null_1,epi_isl_419494_Wales_20200320_null_1)Node446,epi_isl_448642_England_20200101_null_1,epi_isl_420981_Wales_20200323_null_1,epi_isl_419429_Wales_20200317_null_1,epi_isl_442233_England_20200403_null_1,epi_isl_417607_Reykjavik_20200317_null_1,epi_isl_415593_Washington_20200310_null_1,epi_isl_437846_Washington_20200404_null_1,epi_isl_430520_Victoria_20200402_null_1,epi_isl_447217_Michigan_20200321_null_1,epi_isl_443382_England_20200415_null_1,epi_isl_441548_England_20200406_null_1,epi_isl_440277_England_20200317_null_1,epi_isl_432310_Wales_20200401_null_1,(epi_isl_441325_England_20200401_null_3,epi_isl_447025_Bangkok_20200402_null_3)Node524,(epi_isl_418874_Washington_20200316_null_2,epi_isl_436872_Michigan_20200327_null_1)Node521,(epi_isl_443505_England_20200416_null_2,epi_isl_449715_England_20200416_null_10)Node518,epi_isl_443325_England_20200415_null_1,epi_isl_448749_England_20200101_null_6,epi_isl_430403_New_York_20200410_null_1,((epi_isl_427291_Ohio_20200331_null_1,epi_isl_437893_Athens_20200329_null_1)Node510,epi_isl_416694_Washington_20200313_null_1)Node509,epi_isl_430582_Victoria_20200407_null_1,(epi_isl_441555_England_20200405_null_5,epi_isl_443011_England_20200410_null_1)Node528,epi_isl_423927_England_20200318_null_1,epi_isl_447044_Gujarat_20200503_null_2,epi_isl_413857_Guangdong_20200131_null_1,epi_isl_445068_Luxembourg_20200428_null_2,epi_isl_436982_Unknown_20200330_null_2,epi_isl_417140_Washington_20200301_null_2,epi_isl_448109_England_20200507_null_1,(epi_isl_420726_England_20200327_null_1,epi_isl_445165_California_20200317_null_5)Node603,((epi_isl_416541_Dasman_20200302_null_1,epi_isl_430634_Northern_Territory_20200101_null_1)Node598,epi_isl_433093_Scotland_20200414_null_1)Node597,epi_isl_423060_England_20200324_null_1,(epi_isl_437852_USA_20200405_null_5,epi_isl_446640_Wales_20200408_null_1)Node624,(epi_isl_439159_Scotland_20200420_null_5,epi_isl_442636_England_20200405_null_1)Node621,(epi_isl_438473_England_20200331_null_1,epi_isl_443625_England_20200414_null_6)Node615,epi_isl_437536_West_Bengal_20200319_null_1,epi_isl_439335_Scotland_20200430_null_1,epi_isl_444447_England_20200416_null_3,epi_isl_422572_Friesland_20200328_null_3,epi_isl_438968_Kanto_20200420_null_1,epi_isl_441534_England_20200426_null_1,epi_isl_448135_Scotland_20200408_null_1,epi_isl_421964_England_20200401_null_1,epi_isl_436729_Abruzzo_20200427_null_1,epi_isl_449622_England_20200430_null_8,((epi_isl_447863_Telangana_20200414_null_3,epi_isl_447865_Telangana_20200414_null_2)Node665,epi_isl_447861_Telangana_20200416_null_2)Node664,epi_isl_432532_England_20200402_null_1,epi_isl_429685_Minas_gerais_20200317_null_1,(epi_isl_423324_England_20200326_null_1,epi_isl_430132_Washington_20200317_null_6)Node673,epi_isl_445256_Santiago_20200310_null_3,epi_isl_439399_England_20200331_null_1,epi_isl_439920_England_20200324_null_1,epi_isl_447063_Michigan_20200328_null_2,epi_isl_442349_England_20200326_null_1,epi_isl_427384_Liege_20200408_null_2,epi_isl_437925_Ischgl_20200309_null_15,epi_isl_432055_Wales_20200407_null_1,(epi_isl_445916_Wales_20200401_null_3,epi_isl_437978_Ischgl_20200311_null_4)Node689,epi_isl_427779_New_South_Wales_20200324_null_3,epi_isl_422116_Wales_20200324_null_1,epi_isl_437355_Kinshasa_20200417_null_4,(epi_isl_434498_Luxembourg_20200415_null_2,epi_isl_435066_Delhi_20200318_null_1)Node695,epi_isl_447940_England_20200429_null_5,epi_isl_441783_England_20200401_null_1,epi_isl_438162_Washington_20200423_null_2,epi_isl_443690_England_20200329_null_3,epi_isl_449123_England_20200408_null_1,(epi_isl_443599_England_20200416_null_3,epi_isl_448748_England_20200101_null_15)Node709,(epi_isl_447552_Gujarat_20200502_null_15,epi_isl_449628_England_20200404_null_1)Node713,(epi_isl_435053_Gujarat_20200407_null_1,epi_isl_447547_Gujarat_20200428_null_3)Node716,(epi_isl_448197_Scotland_20200421_null_2,epi_isl_448574_England_20200101_null_6)Node720,epi_isl_434988_Texas_20200331_null_1,epi_isl_420401_Ath_20200324_null_1,((epi_isl_441570_England_20200406_null_1,epi_isl_441649_England_20200406_null_4)Node728,epi_isl_442963_England_20200407_null_1)Node727,epi_isl_449114_England_20200408_null_2,(epi_isl_437608_Thailand_20200313_null_1,epi_isl_449252_Scotland_20200427_null_58)Node733,epi_isl_416748_ARA_20200304_null_1,epi_isl_435105_Ladakh_20200317_null_1,epi_isl_440731_England_20200403_null_1,epi_isl_444199_England_20200415_null_2,epi_isl_420823_Utah_20200327_null_1,epi_isl_438282_England_20200331_null_1,epi_isl_449221_Scotland_20200427_null_7,epi_isl_423548_England_20200331_null_3,(epi_isl_430504_Victoria_20200331_null_1,epi_isl_445109_California_20200312_null_4)Node784,epi_isl_420725_England_20200328_null_1,((epi_isl_442533_England_20200407_null_1,epi_isl_448444_England_20200422_null_12)Node751,epi_isl_441072_England_20200403_null_2)Node750,(epi_isl_437430_Virginia_20200415_null_1,epi_isl_446722_Wales_20200414_null_6)Node756,epi_isl_435126_United_Arab_Emirates_20200225_null_2,((epi_isl_421775_England_20200325_null_1,epi_isl_443510_England_20200416_null_2,epi_isl_421895_England_20200327_null_1,epi_isl_444128_England_20200408_null_1,epi_isl_440096_England_20200323_null_2,epi_isl_423453_England_20200329_null_1,epi_isl_449653_England_20200404_null_171,epi_isl_423446_England_20200329_null_1,epi_isl_440247_England_20200321_null_1)Node762,epi_isl_446084_Wales_20200416_null_1)Node761,(epi_isl_439944_England_20200328_null_2,epi_isl_449719_England_20200417_null_5)Node780,epi_isl_442207_England_20200404_null_1,epi_isl_433537_Scotland_20200327_null_1,epi_isl_430621_Victoria_20200410_null_1,((epi_isl_439476_England_20200330_null_1,epi_isl_439408_England_20200330_null_1,epi_isl_439229_Scotland_20200424_null_1,epi_isl_449710_England_20200416_null_381,epi_isl_442209_England_20200405_null_1,epi_isl_445426_Wales_20200402_null_1)Node796,epi_isl_446829_Wales_20200415_null_5)Node795,(epi_isl_445488_Wales_20200403_null_3,epi_isl_448021_England_20200501_null_1)Node808,epi_isl_421607_New_York_20200321_null_1,epi_isl_444065_California_20200430_null_2,(epi_isl_433719_England_20200404_null_1,epi_isl_426880_Victoria_20200323_null_1,epi_isl_444435_England_20200418_null_2)Node812,epi_isl_443807_England_20200329_null_1,(epi_isl_432208_Wales_20200331_null_1,epi_isl_445433_Wales_20200402_null_2)Node820,(epi_isl_424311_Washington_20200324_null_1,epi_isl_440821_England_20200331_null_2,epi_isl_437868_Connecticut_20200402_null_2)Node823,(epi_isl_423752_England_20200323_null_1,epi_isl_437694_Makkah_20200405_null_1)Node830,(epi_isl_433015_England_20200403_null_4,epi_isl_445903_Wales_20200331_null_1)Node833,epi_isl_447416_Tel_Aviv_District_20200317_null_1,epi_isl_424989_Michigan_20200312_null_1,epi_isl_444867_Unknown_20200327_null_5,epi_isl_414010_England_20200226_null_1,epi_isl_449697_England_20200415_null_1,(epi_isl_434740_Texas_20200324_null_1,epi_isl_435722_New_York_20200416_null_1)Node851,epi_isl_442246_England_20200406_null_1,epi_isl_444240_England_20200418_null_1,epi_isl_449670_England_20200415_null_5,epi_isl_422897_Utrecht_20200311_null_3,epi_isl_434308_Washington_20200331_null_1,epi_isl_428792_New_York_20200404_null_1,epi_isl_449029_England_20200420_null_1,epi_isl_449072_England_20200504_null_1,epi_isl_430285_Washington_20200301_null_3,(epi_isl_430483_Victoria_20200331_null_1,epi_isl_446208_Wales_20200406_null_1)Node870,epi_isl_431901_Wales_20200404_null_1,(epi_isl_442906_England_20200408_null_1,epi_isl_448022_England_20200502_null_27)Node863,(epi_isl_441132_England_20200402_null_7,epi_isl_443501_England_20200414_null_1)Node866,epi_isl_444613_New_York_20200403_null_2,epi_isl_444743_New_York_20200402_null_17,epi_isl_444781_New_York_20200318_null_2,epi_isl_432908_England_20200327_null_1,epi_isl_406595_Guangdong_20200116_null_1,epi_isl_414936_Shandong_20200123_null_1,epi_isl_445266_Antofagasta_20200312_null_2,epi_isl_439223_Scotland_20200423_null_1,epi_isl_440631_England_20200402_null_1,epi_isl_434967_Texas_20200330_null_10,epi_isl_438396_England_20200330_null_1,epi_isl_443488_England_20200415_null_2,epi_isl_433456_Scotland_20200411_null_1,epi_isl_432760_England_20200322_null_1,epi_isl_437343_Kinshasa_20200415_null_2,epi_isl_416390_Shanghai_20200131_null_2,epi_isl_445035_Florida_20200428_null_5,epi_isl_432034_Wales_20200330_null_1,epi_isl_444918_Unknown_20200330_null_1,epi_isl_433000_England_20200402_null_1,epi_isl_426457_Virginia_20200330_null_1,epi_isl_443291_Bretagne_20200402_null_1,epi_isl_433733_England_20200405_null_2,epi_isl_423913_England_20200318_null_1,epi_isl_444670_New_Jersey_20200330_null_2,epi_isl_422601_Netherlands_20200401_null_1,epi_isl_425846_Scotland_20200312_null_1,(epi_isl_418040_Washington_20200316_null_1,epi_isl_447810_Risaralda_20200405_null_2)Node915,epi_isl_434146_Washington_20200326_null_1,epi_isl_429724_Luxembourg_20200319_null_1,epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1,epi_isl_433214_Scotland_20200401_null_4,(epi_isl_444906_Unknown_20200330_null_1,epi_isl_445149_Louisiana_20200408_null_1)Node925,epi_isl_430524_Victoria_20200402_null_1,epi_isl_430511_Victoria_20200402_null_4,epi_isl_442553_England_20200407_null_1,epi_isl_446979_Wales_20200416_null_1,epi_isl_429644_Washington_20200408_null_2,epi_isl_440669_England_20200401_null_4,epi_isl_443282_Bretagne_20200322_null_2,epi_isl_425159_Wisconsin_20200330_null_1,epi_isl_445832_Wales_20200410_null_8,epi_isl_433551_Scotland_20200331_null_1,epi_isl_440740_England_20200405_null_4,epi_isl_445918_Wales_20200401_null_5,(epi_isl_425203_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1,epi_isl_427052_Victoria_20200330_null_1)Node986,(epi_isl_420696_England_20200329_null_1,epi_isl_444283_England_20200416_null_1)Node983,(epi_isl_448775_England_20200407_null_1,epi_isl_432181_Wales_20200404_null_1,epi_isl_447517_Comunitat_Valenciana_20200401_null_1,epi_isl_426835_Victoria_20200326_null_2,epi_isl_449701_England_20200415_null_1237,epi_isl_445273_Rancagua_20200316_null_1,epi_isl_444973_Catalonia_20200406_null_1,epi_isl_420697_England_20200329_null_1,epi_isl_438058_Vienna_20200317_null_5,epi_isl_424474_Reykjavik_20200320_null_1,epi_isl_433188_Scotland_20200419_null_1,epi_isl_437571_California_20200425_null_1,epi_isl_440819_England_20200401_null_2,epi_isl_446225_Wales_20200406_null_1,epi_isl_448394_England_20200501_null_1,epi_isl_449139_England_20200408_null_2)Node947,(epi_isl_443538_England_20200416_null_1,epi_isl_422709_Netherlands_20200322_null_1,epi_isl_449700_England_20200416_null_7)Node978,epi_isl_445169_California_20200328_null_1,epi_isl_424241_Washington_20200321_null_1,epi_isl_429756_Luxembourg_20200327_null_1,epi_isl_447224_Michigan_20200408_null_8,epi_isl_435554_Louisiana_20200425_null_2,epi_isl_443028_England_20200408_null_7,epi_isl_446978_Wales_20200416_null_8,epi_isl_421735_Luxembourg_20200317_null_1,epi_isl_434554_Manila_20200326_null_1)"
}
},
"tested":{
"0":{
"Node1007":"test",
"Node165":"test",
"Node255":"test",
"Node256":"test",
"Node257":"test",
"Node281":"test",
"Node282":"test",
"Node305":"test",
"Node328":"test",
"Node334":"test",
"Node341":"test",
"Node342":"test",
"Node347":"test",
"Node42":"test",
"Node446":"test",
"Node456":"test",
"Node459":"test",
"Node465":"test",
"Node466":"test",
"Node509":"test",
"Node510":"test",
"Node518":"test",
"Node521":"test",
"Node524":"test",
"Node528":"test",
"Node583":"test",
"Node586":"test",
"Node589":"test",
"Node592":"test",
"Node597":"test",
"Node598":"test",
"Node603":"test",
"Node606":"test",
"Node609":"test",
"Node615":"test",
"Node621":"test",
"Node624":"test",
"Node627":"test",
"Node630":"test",
"Node633":"test",
"Node636":"test",
"Node639":"test",
"Node642":"test",
"Node645":"test",
"Node648":"test",
"Node651":"test",
"Node664":"test",
"Node665":"test",
"Node673":"test",
"Node689":"test",
"Node695":"test",
"Node709":"test",
"Node713":"test",
"Node716":"test",
"Node720":"test",
"Node727":"test",
"Node728":"test",
"Node733":"test",
"Node750":"test",
"Node751":"test",
"Node756":"test",
"Node761":"test",
"Node762":"test",
"Node780":"test",
"Node784":"test",
"Node795":"test",
"Node796":"test",
"Node808":"test",
"Node812":"test",
"Node820":"test",
"Node823":"test",
"Node830":"test",
"Node833":"test",
"Node851":"test",
"Node863":"test",
"Node866":"test",
"Node870":"test",
"Node915":"test",
"Node925":"test",
"Node947":"test",
"Node978":"test",
"Node983":"test",
"Node986":"test",
"epi_isl_406595_Guangdong_20200116_null_1":"background",
"epi_isl_413857_Guangdong_20200131_null_1":"background",
"epi_isl_414010_England_20200226_null_1":"background",
"epi_isl_414936_Shandong_20200123_null_1":"background",
"epi_isl_415593_Washington_20200310_null_1":"background",
"epi_isl_416339_Shanghai_20200203_null_2":"background",
"epi_isl_416361_Shanghai_20200201_null_1":"background",
"epi_isl_416390_Shanghai_20200131_null_2":"background",
"epi_isl_416392_Shanghai_20200202_null_1":"background",
"epi_isl_416425_Hangzhou_20200203_null_1":"background",
"epi_isl_416541_Dasman_20200302_null_1":"background",
"epi_isl_416694_Washington_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_416748_ARA_20200304_null_1":"background",
"epi_isl_417030_New_South_Wales_20200124_null_1":"background",
"epi_isl_417140_Washington_20200301_null_2":"background",
"epi_isl_417236_England_20200301_null_1":"background",
"epi_isl_417240_England_20200303_null_4":"background",
"epi_isl_417288_England_20200305_null_1":"background",
"epi_isl_417312_England_20200308_null_1":"background",
"epi_isl_417398_New_South_Wales_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_417487_Oslo_20200301_null_1":"background",
"epi_isl_417607_Reykjavik_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_417743_Reykjavik_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_418040_Washington_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_418715_England_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_418874_Washington_20200316_null_2":"background",
"epi_isl_418949_Washington_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_419388_Minnesota_20200314_null_1":"background",
"epi_isl_419419_Wales_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_419427_Wales_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_419429_Wales_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_419494_Wales_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_419693_Belarus_20200301_null_1":"background",
"epi_isl_419749_Victoria_20200310_null_1":"background",
"epi_isl_420401_Ath_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_420694_England_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_420696_England_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_420697_England_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_420725_England_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_420726_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_420823_Utah_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_420981_Wales_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_420997_Wales_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_421221_Hangzhou_20200315_null_1":"background",
"epi_isl_421281_Indiana_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_421336_Wisconsin_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_421592_New_York_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_421607_New_York_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_421669_India_20200312_null_1":"background",
"epi_isl_421686_Minnesota_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_421735_Luxembourg_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_421738_Luxembourg_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_421775_England_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_421847_England_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_421895_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_421947_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_421948_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_421953_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_421956_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_421963_England_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_421964_England_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_422056_Wales_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_422057_Wales_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_422116_Wales_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_422312_Wales_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_422431_Singapore_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_422572_Friesland_20200328_null_3":"background",
"epi_isl_422590_Netherlands_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_422601_Netherlands_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_422709_Netherlands_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_422897_Utrecht_20200311_null_3":"background",
"epi_isl_423052_England_20200319_null_5":"background",
"epi_isl_423060_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_423068_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_423130_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_423227_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_423324_England_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_423328_England_20200327_null_2":"background",
"epi_isl_423354_England_20200329_null_2":"background",
"epi_isl_423412_England_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_423446_England_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_423453_England_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_423481_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_423548_England_20200331_null_3":"background",
"epi_isl_423579_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_423639_England_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_423648_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_423740_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_423752_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_423780_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_423825_England_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_423913_England_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_423927_England_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_423933_England_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_424007_England_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_424062_England_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_424138_England_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_424241_Washington_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_424298_Washington_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_424311_Washington_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_424474_Reykjavik_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_424541_Reykjavik_20200301_null_2":"background",
"epi_isl_424989_Michigan_20200312_null_1":"background",
"epi_isl_425023_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_425159_Wisconsin_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_425203_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_425404_England_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_425485_England_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_425585_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_425846_Scotland_20200312_null_1":"background",
"epi_isl_426307_New_York_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_426320_New_York_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_426457_Virginia_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_426483_Arizona_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_426835_Victoria_20200326_null_2":"background",
"epi_isl_426880_Victoria_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_426901_Northern_territory_20200325_null_2":"background",
"epi_isl_427052_Victoria_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_427090_Victoria_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_427219_Washington_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_427290_Ohio_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_427291_Ohio_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_427384_Liege_20200408_null_2":"background",
"epi_isl_427406_Doha_20200323_null_2":"background",
"epi_isl_427450_Wisconsin_20200413_null_2":"background",
"epi_isl_427614_New_York_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_427712_New_South_Wales_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_427779_New_South_Wales_20200324_null_3":"background",
"epi_isl_428204_Nebraska_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_428230_New_Taipei_City_20200317_null_5":"background",
"epi_isl_428487_Karnataka_20200414_null_1":"background",
"epi_isl_428792_New_York_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_429008_California_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_429644_Washington_20200408_null_2":"background",
"epi_isl_429685_Minas_gerais_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_429724_Luxembourg_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_429756_Luxembourg_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_430132_Washington_20200317_null_6":"background",
"epi_isl_430285_Washington_20200301_null_3":"background",
"epi_isl_430403_New_York_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_430471_Victoria_20200325_null_2":"background",
"epi_isl_430474_Victoria_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_430483_Victoria_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_430504_Victoria_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_430511_Victoria_20200402_null_4":"background",
"epi_isl_430520_Victoria_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_430524_Victoria_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_430572_Victoria_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_430582_Victoria_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_430595_Victoria_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_430621_Victoria_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_430634_Northern_Territory_20200101_null_1":"background",
"epi_isl_430644_Victoria_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_430674_Victoria_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_431833_Manila_20200322_null_3":"background",
"epi_isl_431901_Wales_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_432013_Wales_20200331_null_2":"background",
"epi_isl_432034_Wales_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_432049_Wales_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_432055_Wales_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_432181_Wales_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_432208_Wales_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_432310_Wales_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_432532_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_432558_England_20200402_null_2":"background",
"epi_isl_432594_England_20200412_null_1":"background",
"epi_isl_432760_England_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_432908_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_433000_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_433015_England_20200403_null_4":"background",
"epi_isl_433093_Scotland_20200414_null_1":"background",
"epi_isl_433188_Scotland_20200419_null_1":"background",
"epi_isl_433214_Scotland_20200401_null_4":"background",
"epi_isl_433456_Scotland_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_433537_Scotland_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_433551_Scotland_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_433719_England_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_433733_England_20200405_null_2":"background",
"epi_isl_434125_Washington_20200310_null_2":"background",
"epi_isl_434146_Washington_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_434308_Washington_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_434498_Luxembourg_20200415_null_2":"background",
"epi_isl_434554_Manila_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_434694_Samut_Prakarn_20200122_null_1":"background",
"epi_isl_434740_Texas_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_434820_Texas_20200320_null_4":"background",
"epi_isl_434967_Texas_20200330_null_10":"background",
"epi_isl_434988_Texas_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_435053_Gujarat_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_435060_Uttar_Pradesh_20200312_null_1":"background",
"epi_isl_435066_Delhi_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_435105_Ladakh_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_435126_United_Arab_Emirates_20200225_null_2":"background",
"epi_isl_435554_Louisiana_20200425_null_2":"background",
"epi_isl_435696_Singapore_20200420_null_1":"background",
"epi_isl_435722_New_York_20200416_null_1":"background",
"epi_isl_436111_Victoria_20200407_null_2":"background",
"epi_isl_436117_Victoria_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_436118_Victoria_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_436382_Comunitat_Valenciana_20200317_null_6":"background",
"epi_isl_436429_Delhi_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_436613_Wisconsin_20200421_null_1":"background",
"epi_isl_436729_Abruzzo_20200427_null_1":"background",
"epi_isl_436872_Michigan_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_436876_Michigan_20200327_null_3":"background",
"epi_isl_436982_Unknown_20200330_null_2":"background",
"epi_isl_437043_California_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_437053_California_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_437098_Michigan_20200312_null_2":"background",
"epi_isl_437187_Surabaya_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_437255_Bavaria_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_437289_Bavaria_20200403_null_13":"background",
"epi_isl_437343_Kinshasa_20200415_null_2":"background",
"epi_isl_437355_Kinshasa_20200417_null_4":"background",
"epi_isl_437374_Minnesota_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_437430_Virginia_20200415_null_1":"background",
"epi_isl_437463_Makkah_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_437465_Makkah_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_437536_West_Bengal_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_437571_California_20200425_null_1":"background",
"epi_isl_437608_Thailand_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_437694_Makkah_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_437846_Washington_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_437852_USA_20200405_null_5":"background",
"epi_isl_437861_Washington_20200404_null_7":"background",
"epi_isl_437868_Connecticut_20200402_null_2":"background",
"epi_isl_437893_Athens_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_437925_Ischgl_20200309_null_15":"background",
"epi_isl_437978_Ischgl_20200311_null_4":"background",
"epi_isl_438044_Vienna_20200315_null_1":"background",
"epi_isl_438058_Vienna_20200317_null_5":"background",
"epi_isl_438084_Vienna_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_438085_Vienna_20200322_null_7":"background",
"epi_isl_438162_Washington_20200423_null_2":"background",
"epi_isl_438167_Washington_20200423_null_1":"background",
"epi_isl_438260_England_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_438282_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_438393_England_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_438396_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_438460_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_438461_England_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_438473_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_438515_England_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_438534_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_438968_Kanto_20200420_null_1":"background",
"epi_isl_439005_Scotland_20200423_null_1":"background",
"epi_isl_439042_Scotland_20200425_null_1":"background",
"epi_isl_439159_Scotland_20200420_null_5":"background",
"epi_isl_439223_Scotland_20200423_null_1":"background",
"epi_isl_439229_Scotland_20200424_null_1":"background",
"epi_isl_439285_Scotland_20200414_null_7":"background",
"epi_isl_439297_Scotland_20200427_null_1":"background",
"epi_isl_439335_Scotland_20200430_null_1":"background",
"epi_isl_439379_England_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_439399_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_439408_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_439419_England_20200330_null_2":"background",
"epi_isl_439434_England_20200401_null_9":"background",
"epi_isl_439445_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_439476_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_439651_England_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_439681_England_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_439777_England_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_439920_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_439944_England_20200328_null_2":"background",
"epi_isl_440019_England_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_440082_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_440096_England_20200323_null_2":"background",
"epi_isl_440217_England_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_440247_England_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_440257_England_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_440277_England_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_440325_England_20200320_null_2":"background",
"epi_isl_440364_England_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_440382_England_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_440508_England_20200312_null_1":"background",
"epi_isl_440515_England_20200311_null_2":"background",
"epi_isl_440591_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_440631_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_440640_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_440669_England_20200401_null_4":"background",
"epi_isl_440731_England_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_440740_England_20200405_null_4":"background",
"epi_isl_440767_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_440779_England_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_440819_England_20200401_null_2":"background",
"epi_isl_440821_England_20200331_null_2":"background",
"epi_isl_441060_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_441072_England_20200403_null_2":"background",
"epi_isl_441079_England_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_441130_England_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_441132_England_20200402_null_7":"background",
"epi_isl_441224_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_441325_England_20200401_null_3":"background",
"epi_isl_441391_Northern_Ireland_20200314_null_1":"background",
"epi_isl_441534_England_20200426_null_1":"background",
"epi_isl_441548_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_441555_England_20200405_null_5":"background",
"epi_isl_441570_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_441649_England_20200406_null_4":"background",
"epi_isl_441783_England_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_442025_England_20200411_null_3":"background",
"epi_isl_442207_England_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_442209_England_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_442231_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_442233_England_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_442246_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_442282_England_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_442349_England_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_442518_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_442533_England_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_442553_England_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_442636_England_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_442662_England_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_442733_England_20200405_null_29":"background",
"epi_isl_442776_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_442854_England_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_442906_England_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_442935_England_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_442942_England_20200408_null_5":"background",
"epi_isl_442963_England_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_443011_England_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_443028_England_20200408_null_7":"background",
"epi_isl_443260_Ile_de_France_20200402_null_3":"background",
"epi_isl_443282_Bretagne_20200322_null_2":"background",
"epi_isl_443284_Hauts_de_France_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_443291_Bretagne_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_443325_England_20200415_null_1":"background",
"epi_isl_443382_England_20200415_null_1":"background",
"epi_isl_443488_England_20200415_null_2":"background",
"epi_isl_443501_England_20200414_null_1":"background",
"epi_isl_443505_England_20200416_null_2":"background",
"epi_isl_443510_England_20200416_null_2":"background",
"epi_isl_443538_England_20200416_null_1":"background",
"epi_isl_443599_England_20200416_null_3":"background",
"epi_isl_443615_England_20200414_null_2":"background",
"epi_isl_443625_England_20200414_null_6":"background",
"epi_isl_443690_England_20200329_null_3":"background",
"epi_isl_443803_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_443807_England_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_443907_England_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_443923_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_443979_England_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_443989_England_20200327_null_2":"background",
"epi_isl_444004_England_20200325_null_34":"background",
"epi_isl_444065_California_20200430_null_2":"background",
"epi_isl_444095_England_20200406_null_2":"background",
"epi_isl_444128_England_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_444199_England_20200415_null_2":"background",
"epi_isl_444240_England_20200418_null_1":"background",
"epi_isl_444241_England_20200418_null_2":"background",
"epi_isl_444283_England_20200416_null_1":"background",
"epi_isl_444435_England_20200418_null_2":"background",
"epi_isl_444438_England_20200417_null_5":"background",
"epi_isl_444447_England_20200416_null_3":"background",
"epi_isl_444574_Illinois_20200319_null_8":"background",
"epi_isl_444606_Illinois_20200320_null_25":"background",
"epi_isl_444613_New_York_20200403_null_2":"background",
"epi_isl_444670_New_Jersey_20200330_null_2":"background",
"epi_isl_444698_New_York_20200330_null_7":"background",
"epi_isl_444735_New_York_20200402_null_8":"background",
"epi_isl_444743_New_York_20200402_null_17":"background",
"epi_isl_444781_New_York_20200318_null_2":"background",
"epi_isl_444853_Unknown_20200403_null_5":"background",
"epi_isl_444867_Unknown_20200327_null_5":"background",
"epi_isl_444889_Unknown_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_444906_Unknown_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_444918_Unknown_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_444919_Unknown_20200329_null_4":"background",
"epi_isl_444946_Unknown_20200329_null_7":"background",
"epi_isl_444973_Catalonia_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_445035_Florida_20200428_null_5":"background",
"epi_isl_445068_Luxembourg_20200428_null_2":"background",
"epi_isl_445087_Kraljevo_20200404_null_16":"background",
"epi_isl_445109_California_20200312_null_4":"background",
"epi_isl_445149_Louisiana_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_445165_California_20200317_null_5":"background",
"epi_isl_445169_California_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_445256_Santiago_20200310_null_3":"background",
"epi_isl_445266_Antofagasta_20200312_null_2":"background",
"epi_isl_445273_Rancagua_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_445306_Santiago_20200316_null_4":"background",
"epi_isl_445335_Puerto_Montt_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_445382_Wales_20200402_null_30":"background",
"epi_isl_445415_Wales_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_445426_Wales_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_445433_Wales_20200402_null_2":"background",
"epi_isl_445452_Wales_20200403_null_3":"background",
"epi_isl_445488_Wales_20200403_null_3":"background",
"epi_isl_445511_Wales_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_445512_Wales_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_445561_Wales_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_445606_Wales_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_445649_Wales_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_445745_Wales_20200412_null_2":"background",
"epi_isl_445768_Wales_20200409_null_2":"background",
"epi_isl_445788_Wales_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_445789_Wales_20200328_null_2":"background",
"epi_isl_445832_Wales_20200410_null_8":"background",
"epi_isl_445868_Wales_20200408_null_2":"background",
"epi_isl_445903_Wales_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_445916_Wales_20200401_null_3":"background",
"epi_isl_445918_Wales_20200401_null_5":"background",
"epi_isl_445934_Wales_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_446053_Wales_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_446084_Wales_20200416_null_1":"background",
"epi_isl_446208_Wales_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_446225_Wales_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_446254_Wales_20200408_null_3":"background",
"epi_isl_446265_Wales_20200418_null_1":"background",
"epi_isl_446410_Wales_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_446454_Wales_20200412_null_2":"background",
"epi_isl_446504_Wales_20200411_null_2":"background",
"epi_isl_446555_Wales_20200414_null_2":"background",
"epi_isl_446640_Wales_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_446722_Wales_20200414_null_6":"background",
"epi_isl_446735_Wales_20200414_null_2":"background",
"epi_isl_446811_Wales_20200418_null_6":"background",
"epi_isl_446829_Wales_20200415_null_5":"background",
"epi_isl_446835_Wales_20200415_null_6":"background",
"epi_isl_446846_Wales_20200417_null_3":"background",
"epi_isl_446930_Wales_20200416_null_2":"background",
"epi_isl_446978_Wales_20200416_null_8":"background",
"epi_isl_446979_Wales_20200416_null_1":"background",
"epi_isl_447025_Bangkok_20200402_null_3":"background",
"epi_isl_447044_Gujarat_20200503_null_2":"background",
"epi_isl_447048_Gujarat_20200427_null_1":"background",
"epi_isl_447063_Michigan_20200328_null_2":"background",
"epi_isl_447217_Michigan_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_447224_Michigan_20200408_null_8":"background",
"epi_isl_447297_South_Coast_District_20200324_null_2":"background",
"epi_isl_447309_South_Coast_District_20200321_null_2":"background",
"epi_isl_447366_Jerusalem_District_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_447411_Jerusalem_District_20200317_null_2":"background",
"epi_isl_447416_Tel_Aviv_District_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_447440_Tel_Aviv_District_20200402_null_6":"background",
"epi_isl_447470_Comunitat_Valenciana_20200326_null_16":"background",
"epi_isl_447517_Comunitat_Valenciana_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_447547_Gujarat_20200428_null_3":"background",
"epi_isl_447552_Gujarat_20200502_null_15":"background",
"epi_isl_447799_Cesar_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_447810_Risaralda_20200405_null_2":"background",
"epi_isl_447861_Telangana_20200416_null_2":"background",
"epi_isl_447863_Telangana_20200414_null_3":"background",
"epi_isl_447865_Telangana_20200414_null_2":"background",
"epi_isl_447866_Telangana_20200414_null_2":"background",
"epi_isl_447940_England_20200429_null_5":"background",
"epi_isl_448006_England_20200501_null_3":"background",
"epi_isl_448021_England_20200501_null_1":"background",
"epi_isl_448022_England_20200502_null_27":"background",
"epi_isl_448109_England_20200507_null_1":"background",
"epi_isl_448113_England_20200506_null_14":"background",
"epi_isl_448135_Scotland_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_448171_Scotland_20200412_null_83":"background",
"epi_isl_448197_Scotland_20200421_null_2":"background",
"epi_isl_448318_England_20200422_null_1":"background",
"epi_isl_448368_England_20200502_null_1":"background",
"epi_isl_448394_England_20200501_null_1":"background",
"epi_isl_448403_England_20200501_null_1":"background",
"epi_isl_448423_England_20200429_null_1":"background",
"epi_isl_448426_England_20200429_null_160":"background",
"epi_isl_448444_England_20200422_null_12":"background",
"epi_isl_448489_England_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_448511_England_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_448524_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_448574_England_20200101_null_6":"background",
"epi_isl_448589_England_20200101_null_1":"background",
"epi_isl_448608_England_20200101_null_2":"background",
"epi_isl_448642_England_20200101_null_1":"background",
"epi_isl_448739_England_20200101_null_1":"background",
"epi_isl_448748_England_20200101_null_15":"background",
"epi_isl_448749_England_20200101_null_6":"background",
"epi_isl_448775_England_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_448784_England_20200407_null_3":"background",
"epi_isl_448948_Northern_Ireland_20200329_null_16":"background",
"epi_isl_448989_England_20200420_null_1":"background",
"epi_isl_449014_England_20200420_null_3":"background",
"epi_isl_449016_England_20200419_null_1":"background",
"epi_isl_449029_England_20200420_null_1":"background",
"epi_isl_449064_England_20200504_null_1":"background",
"epi_isl_449072_England_20200504_null_1":"background",
"epi_isl_449098_England_20200506_null_1":"background",
"epi_isl_449109_England_20200408_null_2":"background",
"epi_isl_449114_England_20200408_null_2":"background",
"epi_isl_449123_England_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_449129_England_20200408_null_44":"background",
"epi_isl_449139_England_20200408_null_2":"background",
"epi_isl_449142_England_20200101_null_1":"background",
"epi_isl_449143_England_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_449150_England_20200418_null_1":"background",
"epi_isl_449175_England_20200418_null_1":"background",
"epi_isl_449221_Scotland_20200427_null_7":"background",
"epi_isl_449252_Scotland_20200427_null_58":"background",
"epi_isl_449315_Scotland_20200508_null_1":"background",
"epi_isl_449604_England_20200428_null_2":"background",
"epi_isl_449622_England_20200430_null_8":"background",
"epi_isl_449623_England_20200430_null_23026":"background",
"epi_isl_449628_England_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_449643_England_20200404_null_5":"background",
"epi_isl_449653_England_20200404_null_171":"background",
"epi_isl_449655_England_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_449670_England_20200415_null_5":"background",
"epi_isl_449697_England_20200415_null_1":"background",
"epi_isl_449700_England_20200416_null_7":"background",
"epi_isl_449701_England_20200415_null_1237":"background",
"epi_isl_449710_England_20200416_null_381":"background",
"epi_isl_449715_England_20200416_null_10":"background",
"epi_isl_449719_England_20200417_null_5":"background"
}
},
"timers":{
"Model fitting":{
"order":1,
"timer":15
},
"Primary SLAC analysis":{
"order":2,
"timer":7
},
"Total time":{
"order":0,
"timer":22
}
}
}