{
"MLE":{
"content":{
"0":{
"by-branch":{
"AVERAGED": [
[103.2067439620706, 223.6468559985211, 1, 0, 0.3157583210786545, 0.009689289300392123, 0, -1.119454348626022, 1, 0.3157583210786545, 0.001730064561761616],
[103.0967565706725, 223.7568433899192, 1, 0, 0.3154218175449276, 0.00969962618867164, 0, -1.120648623477047, 1, 0.3154218175449276, 0.001732703060268744],
[103.0542540357203, 223.7993459248714, 0, 1, 0.3152917821561256, 0, 0.004468288304719605, 0.5162447542391706, 0.6847082178438744, 1, 0.001732056784441969],
[103.2067439620706, 223.6468559985211, 1, 0, 0.3157583210786545, 0.009689289300392123, 0, -1.119454348626022, 1, 0.3157583210786545, 0.001730116725317247],
[103.2067439620706, 223.8447829512162, 1, 0, 0.3155672286142068, 0.009689289300392123, 0, -1.119454348626022, 1, 0.3155672286142068, 0.001730426826970342]
],
"NAMES": [
["Node149"],
["Node124"],
["Node50"],
["Node19"],
["Node92"]
],
"RESOLVED": [
[103.2067439620706, 223.6468559985211, 1, 0, 0.3157583210786545, 0.009689289300392123, 0, -1.119454348626022, 1, 0.3157583210786545, 0.001730064561761616],
[103.0967565706725, 223.7568433899192, 1, 0, 0.3154218175449276, 0.00969962618867164, 0, -1.120648623477047, 1, 0.3154218175449276, 0.001732703060268744],
[103.0542540357203, 223.7993459248714, 0, 1, 0.3152917821561256, 0, 0.004468288304719605, 0.5162447542391706, 0.6847082178438744, 1, 0.001732056784441969],
[103.2067439620706, 223.6468559985211, 1, 0, 0.3157583210786545, 0.009689289300392123, 0, -1.119454348626022, 1, 0.3157583210786545, 0.001730116725317247],
[103.2067439620706, 223.8447829512162, 1, 0, 0.3155672286142068, 0.009689289300392123, 0, -1.119454348626022, 1, 0.3155672286142068, 0.001730426826970342]
]
},
"by-site":{
"AVERAGED": [
[0.6950201472994197, 2.30497985270058, 0, 0, 0.2316733824331399, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.6950201472994197, 2.30497985270058, 0, 0, 0.2316733824331399, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.5814558228315361, 2.022690271778195, 0, 0, 0.2232807998119151, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.6950201472994197, 2.30497985270058, 0, 0, 0.2316733824331399, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1.833879471940281, 1.166120528059719, 0, 0, 0.611293157313427, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1.149875238744587, 1.016245289315132, 0, 0, 0.5308454556656533, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.5814558228315361, 1.584664705228183, 0, 0, 0.268431887930248, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.6950201472994197, 2.236220072111296, 0, 0, 0.2371078776474838, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -115.5352383358724, 1, 0.3333333333333333, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.6417710529697598, 1.524349475089959, 0, 0, 0.2962767051308174, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.8338794719402811, 2.016245289315131, 0, 0, 0.2925764806074584, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.6950201472994197, 2.30497985270058, 0, 0, 0.2316733824331399, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.8338794719402811, 2.166120528059719, 0, 0, 0.2779598239800937, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.6950201472994197, 2.30497985270058, 0, 0, 0.2316733824331399, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1.33679120026918, 1.35822894703024, 0, 0, 0.4960227112248971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.8338794719402811, 2, 0, 0, 0.2942536830507284, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.8338794719402811, 2, 0, 0, 0.2942536830507284, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.8338794719402811, 2.166120528059719, 0, 0, 0.2779598239800937, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.5814558228315361, 2.291364997678933, 0, 0, 0.2023989170087599, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 1.643716695230761, 1, 0, 0.3782553561067984, 1, 0, -115.5352383358724, 1, 0.3782553561067985, 0.008655367958759918],
[0.9694846928804726, 2.030515307119527, 0, 1, 0.3231615642934909, 0, 0.4924858219456577, 56.89946681552955, 0.6768384357065091, 1, 0.008655367958759918],
[0.8125055903722453, 2.187494409627755, 0, 0, 0.2708351967907485, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.6950201472994197, 2.30497985270058, 0, 0, 0.2316733824331399, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1.833879471940281, 1.166120528059719, 0, 0, 0.611293157313427, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1.33679120026918, 1.35822894703024, 0, 0, 0.4960227112248971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.6950201472994197, 2.30497985270058, 0, 0, 0.2316733824331399, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1.33679120026918, 1.35822894703024, 0, 0, 0.4960227112248971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.5814558228315361, 1.584664705228183, 0, 0, 0.268431887930248, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.6950201472994197, 2.30497985270058, 0, 0, 0.2316733824331399, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1.276475970130956, 1.65476424927976, 0, 0, 0.4354729993393626, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.6417710529697598, 2.23104976754071, 0, 0, 0.2233940412809052, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0, 1.837088354336928, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.8728208205104693, 2, 0, 0, 0.3038201388262629, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.8338794719402811, 2.166120528059719, 0, 0, 0.2779598239800937, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.5814558228315361, 2.291364997678933, 0, 0, 0.2023989170087599, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.6950201472994197, 2.30497985270058, 0, 0, 0.2316733824331399, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.6950201472994197, 2.30497985270058, 0, 0, 0.2316733824331399, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 1.604146094609731, 0, 0, 0.3840030334971912, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.9617365260652815, 2.038263473934718, 1, 0, 0.3205788420217605, 1.03978581752662, 0, -120.1319022461979, 1, 0.3205788420217606, 0.008655367958759918],
[0.6950201472994197, 2, 0, 0, 0.2578905200378089, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.6417710529697598, 1.962375041639971, 0, 0, 0.2464420311510743, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1.833879471940281, 1.166120528059719, 0, 0, 0.611293157313427, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.6417710529697598, 1.962375041639971, 0, 0, 0.2464420311510743, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.6950201472994197, 2.236220072111296, 0, 0, 0.2371078776474838, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.8125055903722453, 2.187494409627755, 0, 0, 0.2708351967907485, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.6950201472994197, 2.30497985270058, 0, 0, 0.2316733824331399, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.8338794719402811, 2.166120528059719, 0, 0, 0.2779598239800937, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.6417710529697598, 2.23104976754071, 0, 0, 0.2233940412809052, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.6417710529697598, 2.23104976754071, 0, 0, 0.2233940412809052, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.5814558228315361, 2.291364997678933, 0, 0, 0.2023989170087599, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.6950201472994197, 2, 0, 0, 0.2578905200378089, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1.33679120026918, 1.35822894703024, 0, 0, 0.4960227112248971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.8338794719402811, 2, 0, 0, 0.2942536830507284, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.6950201472994197, 2.30497985270058, 0, 0, 0.2316733824331399, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.7637799278887037, 2.236220072111296, 0, 0, 0.2545933092962346, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.6417710529697598, 2.23104976754071, 0, 0, 0.2233940412809052, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 1.604146094609731, 0, 0, 0.3840030334971912, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1.33679120026918, 1.35822894703024, 0, 0, 0.4960227112248971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.8338794719402811, 2.166120528059719, 0, 0, 0.2779598239800937, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.8338794719402811, 2.166120528059719, 0, 0, 0.2779598239800937, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1.833879471940281, 1.166120528059719, 0, 0, 0.611293157313427, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.6950201472994197, 2.30497985270058, 0, 0, 0.2316733824331399, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.8728208205104693, 2, 0, 0, 0.3038201388262629, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.6950201472994197, 2.30497985270058, 0, 0, 0.2316733824331399, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1.33679120026918, 1.35822894703024, 0, 0, 0.4960227112248971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -115.5352383358724, 1, 0.3333333333333333, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1.833879471940281, 1.166120528059719, 0, 0, 0.611293157313427, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.6417710529697598, 1.524349475089959, 0, 0, 0.2962767051308174, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918]
],
"RESOLVED": [
[0.6950201472994197, 2.30497985270058, 0, 0, 0.2316733824331399, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.6950201472994197, 2.30497985270058, 0, 0, 0.2316733824331399, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.5814558228315361, 2.022690271778195, 0, 0, 0.2232807998119151, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.6950201472994197, 2.30497985270058, 0, 0, 0.2316733824331399, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1.833879471940281, 1.166120528059719, 0, 0, 0.611293157313427, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1.149875238744587, 1.016245289315132, 0, 0, 0.5308454556656533, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.5814558228315361, 1.584664705228183, 0, 0, 0.268431887930248, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.6950201472994197, 2.236220072111296, 0, 0, 0.2371078776474838, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -115.5352383358724, 1, 0.3333333333333333, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.6417710529697598, 1.524349475089959, 0, 0, 0.2962767051308174, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.8338794719402811, 2.016245289315131, 0, 0, 0.2925764806074584, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.6950201472994197, 2.30497985270058, 0, 0, 0.2316733824331399, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.8338794719402811, 2.166120528059719, 0, 0, 0.2779598239800937, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.6950201472994197, 2.30497985270058, 0, 0, 0.2316733824331399, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1.33679120026918, 1.35822894703024, 0, 0, 0.4960227112248971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.8338794719402811, 2, 0, 0, 0.2942536830507284, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.8338794719402811, 2, 0, 0, 0.2942536830507284, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.8338794719402811, 2.166120528059719, 0, 0, 0.2779598239800937, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.5814558228315361, 2.291364997678933, 0, 0, 0.2023989170087599, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 1.643716695230761, 1, 0, 0.3782553561067984, 1, 0, -115.5352383358724, 1, 0.3782553561067985, 0.008655367958759918],
[0.9694846928804726, 2.030515307119527, 0, 1, 0.3231615642934909, 0, 0.4924858219456577, 56.89946681552955, 0.6768384357065091, 1, 0.008655367958759918],
[0.8125055903722453, 2.187494409627755, 0, 0, 0.2708351967907485, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.6950201472994197, 2.30497985270058, 0, 0, 0.2316733824331399, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1.833879471940281, 1.166120528059719, 0, 0, 0.611293157313427, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1.33679120026918, 1.35822894703024, 0, 0, 0.4960227112248971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.6950201472994197, 2.30497985270058, 0, 0, 0.2316733824331399, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1.33679120026918, 1.35822894703024, 0, 0, 0.4960227112248971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.5814558228315361, 1.584664705228183, 0, 0, 0.268431887930248, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.6950201472994197, 2.30497985270058, 0, 0, 0.2316733824331399, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1.276475970130956, 1.65476424927976, 0, 0, 0.4354729993393626, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.6417710529697598, 2.23104976754071, 0, 0, 0.2233940412809052, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0, 1.837088354336928, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.8728208205104693, 2, 0, 0, 0.3038201388262629, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.8338794719402811, 2.166120528059719, 0, 0, 0.2779598239800937, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.5814558228315361, 2.291364997678933, 0, 0, 0.2023989170087599, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.6950201472994197, 2.30497985270058, 0, 0, 0.2316733824331399, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.6950201472994197, 2.30497985270058, 0, 0, 0.2316733824331399, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 1.604146094609731, 0, 0, 0.3840030334971912, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.9617365260652815, 2.038263473934718, 1, 0, 0.3205788420217605, 1.03978581752662, 0, -120.1319022461979, 1, 0.3205788420217606, 0.008655367958759918],
[0.6950201472994197, 2, 0, 0, 0.2578905200378089, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.6417710529697598, 1.962375041639971, 0, 0, 0.2464420311510743, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1.833879471940281, 1.166120528059719, 0, 0, 0.611293157313427, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.6417710529697598, 1.962375041639971, 0, 0, 0.2464420311510743, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.6950201472994197, 2.236220072111296, 0, 0, 0.2371078776474838, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.8125055903722453, 2.187494409627755, 0, 0, 0.2708351967907485, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.6950201472994197, 2.30497985270058, 0, 0, 0.2316733824331399, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.8338794719402811, 2.166120528059719, 0, 0, 0.2779598239800937, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.6417710529697598, 2.23104976754071, 0, 0, 0.2233940412809052, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.6417710529697598, 2.23104976754071, 0, 0, 0.2233940412809052, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.5814558228315361, 2.291364997678933, 0, 0, 0.2023989170087599, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.6950201472994197, 2, 0, 0, 0.2578905200378089, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1.33679120026918, 1.35822894703024, 0, 0, 0.4960227112248971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.8338794719402811, 2, 0, 0, 0.2942536830507284, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.6950201472994197, 2.30497985270058, 0, 0, 0.2316733824331399, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.7637799278887037, 2.236220072111296, 0, 0, 0.2545933092962346, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.6417710529697598, 2.23104976754071, 0, 0, 0.2233940412809052, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 1.604146094609731, 0, 0, 0.3840030334971912, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1.33679120026918, 1.35822894703024, 0, 0, 0.4960227112248971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.8338794719402811, 2.166120528059719, 0, 0, 0.2779598239800937, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.8338794719402811, 2.166120528059719, 0, 0, 0.2779598239800937, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1.833879471940281, 1.166120528059719, 0, 0, 0.611293157313427, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.6950201472994197, 2.30497985270058, 0, 0, 0.2316733824331399, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.8728208205104693, 2, 0, 0, 0.3038201388262629, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.6950201472994197, 2.30497985270058, 0, 0, 0.2316733824331399, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1.33679120026918, 1.35822894703024, 0, 0, 0.4960227112248971, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -115.5352383358724, 1, 0.3333333333333333, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[1.833879471940281, 1.166120528059719, 0, 0, 0.611293157313427, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918],
[0.6417710529697598, 1.524349475089959, 0, 0, 0.2962767051308174, 0, 0, 0, 1, 1, 0.008655367958759918]
]
}
}
},
"headers": [
["ES", "Expected synonymous sites"],
["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
]
},
"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
},
"branch attributes":{
"0":{
"Node108":{
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node124":{
"Global MG94xREV":0.001732703060268744,
"Nucleotide GTR":0.002957415673331459,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATT", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node149":{
"Global MG94xREV":0.001730064561761616,
"Nucleotide GTR":0.002952912226077306,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCC", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node19":{
"Global MG94xREV":0.001730116725317247,
"Nucleotide GTR":0.002953001259980768,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCC", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node50":{
"Global MG94xREV":0.001732056784441969,
"Nucleotide GTR":0.002956312595543226,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "S", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "AGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node92":{
"Global MG94xREV":0.001730426826970342,
"Nucleotide GTR":0.002953530548299244,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGG", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413221_Scotland_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003008934348740647,
"Nucleotide GTR":0.002958533764699605,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCT", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413221_Scotland_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413890_Guangdong_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003003191028234192,
"Nucleotide GTR":0.002952886646593841,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAG", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413890_Guangdong_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415654_Hauts_de_France_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003003191028234192,
"Nucleotide GTR":0.002952886646593841,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAG", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415654_Hauts_de_France_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415710_Saint_Petersburg_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003081093400424206,
"Nucleotide GTR":0.003029484129875858,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "R", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "CGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415710_Saint_Petersburg_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416502_Bretagne_20200226_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003006909934191259,
"Nucleotide GTR":0.002956543259722118,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "R", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "AGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416502_Bretagne_20200226_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416566_unknown_20200215_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003003191125347641,
"Nucleotide GTR":0.002952886742080611,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGG", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416566_unknown_20200215_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417176_Hong_Kong_20200121_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003003803177928709,
"Nucleotide GTR":0.00295348854259102,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACC", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417176_Hong_Kong_20200121_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420329_Riemst_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003003351110940638,
"Nucleotide GTR":0.002953044047865281,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGG", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420329_Riemst_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420352_Sint_Gillis_Waas_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003003962455288318,
"Nucleotide GTR":0.002953645152005426,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "S", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TCA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420352_Sint_Gillis_Waas_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421251_Jiangxi_20200203_null_5":{
"Global MG94xREV":0.003008773348590895,
"Nucleotide GTR":0.002958375461352326,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "S", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "TCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421251_Jiangxi_20200203_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422125_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003007134153063426,
"Nucleotide GTR":0.002956763722858598,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "L", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CTA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422125_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422349_Wales_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.003003215955134402,
"Nucleotide GTR":0.002952911155960738,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "P", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "CCT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422349_Wales_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422635_Zuid_Holland_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003006073625977657,
"Nucleotide GTR":0.002955720959930606,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "TTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422635_Zuid_Holland_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423819_England_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.003020531602491115,
"Nucleotide GTR":0.00296993676085102,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTT", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423819_England_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427168_Idaho_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003006910055383008,
"Nucleotide GTR":0.002956543378883864,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "N", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "AAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427168_Idaho_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427776_New_South_Wales_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003003191077512011,
"Nucleotide GTR":0.002952886695046242,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "A", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "GCT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427776_New_South_Wales_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428353_Hauts_De_France_20200324_null_4":{
"Global MG94xREV":0.003003962536698873,
"Nucleotide GTR":0.002953645232052336,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "P", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "CCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428353_Hauts_De_France_20200324_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428485_Karnataka_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00302657264601057,
"Nucleotide GTR":0.002975876615016937,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "E", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAA", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428485_Karnataka_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428722_Balikesir_20200322_null_4":{
"Global MG94xREV":0.003007134211024594,
"Nucleotide GTR":0.002956763779848899,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "I", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ATA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428722_Balikesir_20200322_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429071_California_20200328_null_5":{
"Global MG94xREV":0.003011338009817666,
"Nucleotide GTR":0.00296089716370771,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "Q", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CAA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429071_California_20200328_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429766_Luxembourg_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00300597488799465,
"Nucleotide GTR":0.002955623875839451,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "S", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TCA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429766_Luxembourg_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429853_Zhejiang_20200128_null_5":{
"Global MG94xREV":0.003007035961516925,
"Nucleotide GTR":0.002956667176050976,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAT", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429853_Zhejiang_20200128_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430342_New_York_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.003007036132506143,
"Nucleotide GTR":0.002956667344176066,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "V", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GTT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430342_New_York_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430738_Beijing_20200205_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGG", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430738_Beijing_20200205_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432003_Wales_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003005974687972738,
"Nucleotide GTR":0.002955623679167972,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAC", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432003_Wales_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432392_Wales_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.003004873586750968,
"Nucleotide GTR":0.002954541021733346,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "H", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAT", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432392_Wales_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432723_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003003115670265363,
"Nucleotide GTR":0.002952812550894379,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAC", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432723_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433271_Scotland_20200409_null_18":{
"Global MG94xREV":0.003003565875057233,
"Nucleotide GTR":0.002953255214616279,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACG", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433271_Scotland_20200409_null_18",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433381_Scotland_20200406_null_3":{
"Global MG94xREV":0.003007063444252562,
"Nucleotide GTR":0.002956694198442261,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "S", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "TCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433381_Scotland_20200406_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433684_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003003565803314142,
"Nucleotide GTR":0.002953255144074906,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "G", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "GGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433684_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433838_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003005645080898673,
"Nucleotide GTR":0.002955299593114678,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "F", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTT", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433838_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434536_Costa_Rica_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.01214643561421924,
"Nucleotide GTR":0.01194297904853185,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "M", "C", "D", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "ATG", "TGT", "GAT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1.5, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434536_Costa_Rica_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434675_Stockholm_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003005645126720637,
"Nucleotide GTR":0.00295529963816911,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "F", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "TTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434675_Stockholm_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434720_Texas_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003022898237884927,
"Nucleotide GTR":0.002972263754367598,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "L", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CTA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434720_Texas_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435059_EC_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.009058558776895584,
"Nucleotide GTR":0.008906825106429601,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "R", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "R", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "CGT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGG", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435059_EC_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435489_New_York_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003005814178274197,
"Nucleotide GTR":0.002955465858056689,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACC", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435489_New_York_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435554_Louisiana_20200425_null_3":{
"Global MG94xREV":0.003005613441125838,
"Nucleotide GTR":0.002955268483317858,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "A", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GCT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435554_Louisiana_20200425_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436052_New_York_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00300655534710289,
"Nucleotide GTR":0.002956194612077506,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "F", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "TTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436052_New_York_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436514_Florida_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003003671062385757,
"Nucleotide GTR":0.002953358640024408,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "R", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AGA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436514_Florida_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436568_Wisconsin_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003004039271455921,
"Nucleotide GTR":0.002953720681478389,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "Q", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "CAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436568_Wisconsin_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436654_California_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003026229434856051,
"Nucleotide GTR":0.002975539152755759,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "L", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTA", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436654_California_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437331_Ankara_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003006875149245088,
"Nucleotide GTR":0.002956509057434588,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "F", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "TTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437331_Ankara_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437651_Unknown_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003006875231929783,
"Nucleotide GTR":0.00295650913873429,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "I", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ATT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437651_Unknown_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437976_Ischgl_20200311_null_4":{
"Global MG94xREV":0.003011257071485494,
"Nucleotide GTR":0.002960817581117719,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "T", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "ACT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437976_Ischgl_20200311_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438104_Vienna_20200325_null_46":{
"Global MG94xREV":0.003008278725107217,
"Nucleotide GTR":0.002957889122965486,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAA", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438104_Vienna_20200325_null_46",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438365_England_20200330_null_14":{
"Global MG94xREV":0.003006875149245088,
"Nucleotide GTR":0.002956509057434588,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438365_England_20200330_null_14",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0]
]
},
"epi_isl_438715_England_20200425_null_3":{
"Global MG94xREV":0.003001633707063276,
"Nucleotide GTR":0.002951355411035788,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "H", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "CAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCC", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438715_England_20200425_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438781_Scotland_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0.003004206632606843,
"Nucleotide GTR":0.0029538852392781,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACC", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438781_Scotland_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439668_Scotland_20200430_null_8":{
"Global MG94xREV":0.003006532643391136,
"Nucleotide GTR":0.002956172288659971,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCT", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439668_Scotland_20200430_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439687_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003003804044653267,
"Nucleotide GTR":0.002953489394797673,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAC", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439687_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440298_England_20200314_null_3":{
"Global MG94xREV":0.003004960632270038,
"Nucleotide GTR":0.002954626609212963,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "N", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAT", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440298_England_20200314_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440722_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003006428402181373,
"Nucleotide GTR":0.002956069793522821,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "K", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AAG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440722_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440922_England_20200420_null_3":{
"Global MG94xREV":0.003005341199080705,
"Nucleotide GTR":0.002955000801411459,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTT", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440922_England_20200420_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441236_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003003154741829271,
"Nucleotide GTR":0.002952850967997461,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "G", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GGT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441236_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441351_England_20200420_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "S", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "AGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441351_England_20200420_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441685_Northern_Ireland_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0.003006428402181373,
"Nucleotide GTR":0.002956069793522821,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "K", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AAA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441685_Northern_Ireland_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441735_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003005643224891304,
"Nucleotide GTR":0.00295529776819601,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "S", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "TCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441735_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442349_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003007293330695254,
"Nucleotide GTR":0.002956920234215698,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "L", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CTT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442349_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442490_England_20200405_null_10":{
"Global MG94xREV":0.003003748032179768,
"Nucleotide GTR":0.002953434320550485,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGC", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442490_England_20200405_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442638_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003008538410011823,
"Nucleotide GTR":0.002958144458067354,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTT", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATT", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442638_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442646_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003004478958258245,
"Nucleotide GTR":0.002954153003390338,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "T", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ACG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442646_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442717_England_20200405_null_3":{
"Global MG94xREV":0.003006378426126953,
"Nucleotide GTR":0.002956020654582823,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTT", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442717_England_20200405_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442893_England_20200406_null_3":{
"Global MG94xREV":0.003007293225155127,
"Nucleotide GTR":0.002956920130443404,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "I", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ATA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442893_England_20200406_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442931_England_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.003007293190630896,
"Nucleotide GTR":0.002956920096497467,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAT", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442931_England_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443387_England_20200413_null_5":{
"Global MG94xREV":0.003005729525287373,
"Nucleotide GTR":0.002955382623033662,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTG", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443387_England_20200413_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443415_England_20200414_null_5":{
"Global MG94xREV":0.003007293303179776,
"Nucleotide GTR":0.002956920207161116,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "S", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "TCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443415_England_20200414_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443456_England_20200414_null_2":{
"Global MG94xREV":0.003006428402181373,
"Nucleotide GTR":0.002956069793522821,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "N", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "AAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443456_England_20200414_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443517_England_20200416_null_6":{
"Global MG94xREV":0.003007293220358902,
"Nucleotide GTR":0.002956920125727512,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAT", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443517_England_20200416_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443742_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00300820337225515,
"Nucleotide GTR":0.002957815032297072,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAA", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443742_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444102_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003005729652586206,
"Nucleotide GTR":0.002955382748200198,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "G", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GGC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444102_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444125_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003003116271134315,
"Nucleotide GTR":0.002952813141698587,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTC", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444125_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444188_England_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003003276220831935,
"Nucleotide GTR":0.002952970412189138,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACC", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444188_England_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444208_England_20200415_null_3":{
"Global MG94xREV":0.003007358076638409,
"Nucleotide GTR":0.002956983895644221,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "I", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ATT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444208_England_20200415_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444387_England_20200428_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003009059670419383,
"Nucleotide GTR":0.002958656987201339,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCC", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCA", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444387_England_20200428_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444389_England_20200428_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCC", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444389_England_20200428_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444462_Gujarat_20200429_null_75":{
"Global MG94xREV":0.003008774384997967,
"Nucleotide GTR":0.002958376480399255,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "TTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444462_Gujarat_20200429_null_75",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444644_New_York_20200329_null_12":{
"Global MG94xREV":0.003008774384997967,
"Nucleotide GTR":0.002958376480399255,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "F", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "TTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444644_New_York_20200329_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444663_New_York_20200331_null_4":{
"Global MG94xREV":0.003008774175364081,
"Nucleotide GTR":0.002958376274276807,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "I", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ATA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444663_New_York_20200331_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444742_New_Jersey_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003003803610430266,
"Nucleotide GTR":0.002953488967848041,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAC", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444742_New_Jersey_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444956_Unknown_20200331_null_34":{
"Global MG94xREV":0.003008774284179807,
"Nucleotide GTR":0.002958376381269832,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAT", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444956_Unknown_20200331_null_34",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444998_Guam_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.003007453822398788,
"Nucleotide GTR":0.002957078037633392,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "L", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CTT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444998_Guam_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445024_Florida_20200430_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003007453779164591,
"Nucleotide GTR":0.002957077995123389,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "V", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GTA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445024_Florida_20200430_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445340_Temuco_20200325_null_46":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATT", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445340_Temuco_20200325_null_46",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445789_Wales_20200328_null_4":{
"Global MG94xREV":0.003007293311881408,
"Nucleotide GTR":0.002956920215716991,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAT", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445789_Wales_20200328_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445801_Wales_20200328_null_8":{
"Global MG94xREV":0.003007293225155127,
"Nucleotide GTR":0.002956920130443404,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "I", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ATT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445801_Wales_20200328_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446062_Wales_20200409_null_6":{
"Global MG94xREV":0.003008773324119614,
"Nucleotide GTR":0.002958375437290948,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "V", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GTT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446062_Wales_20200409_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446198_Wales_20200406_null_4":{
"Global MG94xREV":0.003005338709289511,
"Nucleotide GTR":0.002954998353325038,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "I", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATT", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446198_Wales_20200406_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446211_Wales_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003005729599274121,
"Nucleotide GTR":0.002955382695781113,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "G", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "GGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446211_Wales_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446704_Wales_20200414_null_10":{
"Global MG94xREV":0.003005338971901417,
"Nucleotide GTR":0.002954998611538113,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCT", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446704_Wales_20200414_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446794_Wales_20200421_null_9":{
"Global MG94xREV":0.003007293318016723,
"Nucleotide GTR":0.002956920221749538,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "I", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ATT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446794_Wales_20200421_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446852_Wales_20200418_null_8":{
"Global MG94xREV":0.003011338009817666,
"Nucleotide GTR":0.00296089716370771,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "K", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "AAA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446852_Wales_20200418_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446894_Wales_20200414_null_3":{
"Global MG94xREV":0.003007293239992073,
"Nucleotide GTR":0.002956920145031823,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "I", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ATA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446894_Wales_20200414_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447030_Gujarat_20200503_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003006428406977579,
"Nucleotide GTR":0.00295606979823869,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "I", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "ATA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447030_Gujarat_20200503_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447245_Kinshasa_20200424_null_6":{
"Global MG94xREV":0.003007293322812951,
"Nucleotide GTR":0.00295692022646543,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "I", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ATA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447245_Kinshasa_20200424_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447254_Taipei_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003006660412077371,
"Nucleotide GTR":0.002956297917181069,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "G", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GGG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447254_Taipei_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447506_Comunitat_Valenciana_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003007453742481913,
"Nucleotide GTR":0.002957077959055159,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "TTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447506_Comunitat_Valenciana_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447520_Comunitat_Valenciana_20200401_null_9":{
"Global MG94xREV":0.003005889766652753,
"Nucleotide GTR":0.002955540180306446,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "V", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "GTG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447520_Comunitat_Valenciana_20200401_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447608_Germany_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003010453562390369,
"Nucleotide GTR":0.002960027531049275,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "F", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "S", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "TTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "AGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447608_Germany_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447615_Taipei_20200319_null_2":{
"Global MG94xREV":0.003003191072723886,
"Nucleotide GTR":0.002952886690338318,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACG", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447615_Taipei_20200319_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447700_France_20200301_null_97":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCC", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447700_France_20200301_null_97",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447752_Huila_20200330_null_26890":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447752_Huila_20200330_null_26890",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447817_Cordoba_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00300679457386666,
"Nucleotide GTR":0.00295642983171875,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCG", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447817_Cordoba_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447836_Athen_20200316_null_4":{
"Global MG94xREV":0.003006459474224785,
"Nucleotide GTR":0.002956100345099862,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGT", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447836_Athen_20200316_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
}
},
"attributes":{
"Global MG94xREV":{
"attribute type":"branch length",
"display order":1
},
"Nucleotide GTR":{
"attribute type":"branch length",
"display order":0
},
"amino-acid":{
"attribute type":"node label",
"display order":1
},
"codon":{
"attribute type":"node label",
"display order":0
},
"nonsynonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":1
},
"original name":{
"attribute type":"node label",
"display order":-1
},
"synonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":0
}
}
},
"data partitions":{
"0":{
"coverage": [
[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112]
],
"name":"slac.filter.default"
}
},
"fits":{
"Global MG94xREV":{
"AIC-c":2709.03893257354,
"Equilibrium frequencies": [
[0.03404975332018687],
[0.01171360667146339],
[0.01439655928488618],
[0.03926477063707272],
[0.02813899937003673],
[0.009680221987210491],
[0.01189743634377335],
[0.03244873305928439],
[0.02256778658111766],
[0.00776364436390845],
[0.009541874632351555],
[0.02602424033916994],
[0.02742583122349215],
[0.009434881849774398],
[0.01159590207404534],
[0.0316263369779848],
[0.01834582154867559],
[0.006311227446063151],
[0.007756787694519517],
[0.02115564446190414],
[0.01516113952857723],
[0.005215650858288064],
[0.006410273871798947],
[0.01748320055620816],
[0.01215940043595911],
[0.00418300927846087],
[0.005141110057357546],
[0.01402171888626288],
[0.01477688841733791],
[0.005083462929118497],
[0.006247808850357498],
[0.01704009802891592],
[0.0312108905283309],
[0.01073699689031885],
[0.01319626111825066],
[0.03599111119689524],
[0.02579293954515405],
[0.008873143540621409],
[0.010905499954772],
[0.02974335366758536],
[0.02068622083180875],
[0.007116358584576966],
[0.008746330752676],
[0.0238544963504114],
[0.02513923105156273],
[0.008648258382138225],
[0.01062910579136872],
[0.02898952400476804],
[0.00893400567197318],
[0.02994736748630377],
[0.02146170577743593],
[0.007383136600479142],
[0.009074213157264215],
[0.02474875359322384],
[0.00592135665194531],
[0.007277618625727324],
[0.01984877222874097],
[0.02091777012678599],
[0.007196014884606902],
[0.008844231995048208],
[0.02412150944366243]
],
"Log Likelihood":-1229.173279036466,
"Rate Distributions":{
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *background*": [
[0.6378769653783188, 1]
],
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *test*": [
[0.2050934188262712, 1]
]
},
"display order":1,
"estimated parameters":124
},
"Nucleotide GTR":{
"AIC-c":2927.604190675924,
"Equilibrium frequencies": [
[0.3095340378612137],
[0.1883609703009995],
[0.2122461838073145],
[0.2898588080304723]
],
"Log Likelihood":-1251.513174433193,
"Rate Distributions":{
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide C":0.4056713926107808,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide G":1,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide T":0.1451073071774964,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide G":0.0641269327833299,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide T":2.41029216415596,
"Substitution rate from nucleotide G to nucleotide T":0.7270095588656145
},
"display order":0,
"estimated parameters":211
}
},
"input":{
"file name":"/data/shares/veg/SARS-CoV-2/SARS-CoV-2/data/fasta/2020-05-18/sequences.nsp9.compressed.fas",
"number of sequences":103,
"number of sites":113,
"partition count":1,
"trees":{
"0":"(epi_isl_413221_Scotland_20200302_null_1,epi_isl_443387_England_20200413_null_5,epi_isl_415654_Hauts_de_France_20200309_null_1,epi_isl_423819_England_20200323_null_2,epi_isl_437651_Unknown_20200404_null_1,epi_isl_447245_Kinshasa_20200424_null_6,epi_isl_427776_New_South_Wales_20200323_null_1,epi_isl_432003_Wales_20200401_null_1,epi_isl_438781_Scotland_20200331_null_2,epi_isl_447520_Comunitat_Valenciana_20200401_null_9,epi_isl_436514_Florida_20200406_null_1,epi_isl_435059_EC_20200320_null_1,epi_isl_447752_Huila_20200330_null_26890,epi_isl_447030_Gujarat_20200503_null_1,epi_isl_444742_New_Jersey_20200402_null_1,epi_isl_435554_Louisiana_20200425_null_3,epi_isl_441236_England_20200403_null_1,epi_isl_442893_England_20200406_null_3,epi_isl_428353_Hauts_De_France_20200324_null_4,epi_isl_429853_Zhejiang_20200128_null_5,epi_isl_446704_Wales_20200414_null_10,epi_isl_432723_England_20200407_null_1,epi_isl_440922_England_20200420_null_3,epi_isl_446211_Wales_20200406_null_1,epi_isl_416502_Bretagne_20200226_null_1,epi_isl_433271_Scotland_20200409_null_18,epi_isl_436568_Wisconsin_20200331_null_1,epi_isl_445024_Florida_20200430_null_1,epi_isl_439668_Scotland_20200430_null_8,(epi_isl_444387_England_20200428_null_1,epi_isl_444389_England_20200428_null_2)Node149,epi_isl_447817_Cordoba_20200409_null_1,epi_isl_445801_Wales_20200328_null_8,epi_isl_421251_Jiangxi_20200203_null_5,epi_isl_430342_New_York_20200330_null_2,epi_isl_446198_Wales_20200406_null_4,epi_isl_444102_England_20200406_null_1,epi_isl_444956_Unknown_20200331_null_34,epi_isl_432392_Wales_20200408_null_2,epi_isl_438104_Vienna_20200325_null_46,epi_isl_447506_Comunitat_Valenciana_20200330_null_1,epi_isl_422635_Zuid_Holland_20200331_null_1,(epi_isl_442638_England_20200406_null_1,epi_isl_445340_Temuco_20200325_null_46)Node124,epi_isl_442717_England_20200405_null_3,epi_isl_443517_England_20200416_null_6,epi_isl_427168_Idaho_20200329_null_1,epi_isl_429766_Luxembourg_20200323_null_1,epi_isl_447254_Taipei_20200316_null_1,(epi_isl_441351_England_20200420_null_4,epi_isl_447608_Germany_20200201_null_1)Node50,epi_isl_441685_Northern_Ireland_20200327_null_2,epi_isl_444663_New_York_20200331_null_4,epi_isl_440298_England_20200314_null_3,epi_isl_443742_England_20200325_null_1,epi_isl_446794_Wales_20200421_null_9,epi_isl_439687_England_20200407_null_1,epi_isl_433381_Scotland_20200406_null_3,epi_isl_437976_Ischgl_20200311_null_4,epi_isl_420329_Riemst_20200305_null_1,epi_isl_422349_Wales_20200324_null_2,epi_isl_437331_Ankara_20200325_null_1,epi_isl_440722_England_20200405_null_1,epi_isl_446062_Wales_20200409_null_6,epi_isl_433838_England_20200101_null_1,epi_isl_444125_England_20200408_null_1,epi_isl_443456_England_20200414_null_2,epi_isl_444462_Gujarat_20200429_null_75,epi_isl_428722_Balikesir_20200322_null_4,epi_isl_446852_Wales_20200418_null_8,epi_isl_442646_England_20200406_null_1,epi_isl_420352_Sint_Gillis_Waas_20200307_null_1,epi_isl_415710_Saint_Petersburg_20200315_null_1,epi_isl_435489_New_York_20200331_null_1,epi_isl_443415_England_20200414_null_5,epi_isl_413890_Guangdong_20200228_null_1,epi_isl_428485_Karnataka_20200412_null_1,epi_isl_438365_England_20200330_null_14,epi_isl_442931_England_20200408_null_2,epi_isl_444644_New_York_20200329_null_12,epi_isl_422125_Wales_20200328_null_1,epi_isl_429071_California_20200328_null_5,epi_isl_445789_Wales_20200328_null_4,epi_isl_417176_Hong_Kong_20200121_null_1,epi_isl_434675_Stockholm_20200420_null_1,epi_isl_444188_England_20200414_null_1,epi_isl_447836_Athen_20200316_null_4,epi_isl_446894_Wales_20200414_null_3,epi_isl_447615_Taipei_20200319_null_2,epi_isl_433684_England_20200401_null_1,epi_isl_441735_England_20200405_null_1,epi_isl_444998_Guam_20200326_null_2,(epi_isl_438715_England_20200425_null_3,epi_isl_447700_France_20200301_null_97)Node19,epi_isl_436654_California_20200407_null_1,epi_isl_436052_New_York_20200309_null_1,(epi_isl_430738_Beijing_20200205_null_1,epi_isl_434536_Costa_Rica_20200317_null_1)Node92,epi_isl_442490_England_20200405_null_10,epi_isl_442349_England_20200326_null_1,epi_isl_416566_unknown_20200215_null_1,epi_isl_434720_Texas_20200315_null_1,epi_isl_444208_England_20200415_null_3)"
}
},
"tested":{
"0":{
"Node124":"test",
"Node149":"test",
"Node19":"test",
"Node50":"test",
"Node92":"test",
"epi_isl_413221_Scotland_20200302_null_1":"background",
"epi_isl_413890_Guangdong_20200228_null_1":"background",
"epi_isl_415654_Hauts_de_France_20200309_null_1":"background",
"epi_isl_415710_Saint_Petersburg_20200315_null_1":"background",
"epi_isl_416502_Bretagne_20200226_null_1":"background",
"epi_isl_416566_unknown_20200215_null_1":"background",
"epi_isl_417176_Hong_Kong_20200121_null_1":"background",
"epi_isl_420329_Riemst_20200305_null_1":"background",
"epi_isl_420352_Sint_Gillis_Waas_20200307_null_1":"background",
"epi_isl_421251_Jiangxi_20200203_null_5":"background",
"epi_isl_422125_Wales_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_422349_Wales_20200324_null_2":"background",
"epi_isl_422635_Zuid_Holland_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_423819_England_20200323_null_2":"background",
"epi_isl_427168_Idaho_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_427776_New_South_Wales_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_428353_Hauts_De_France_20200324_null_4":"background",
"epi_isl_428485_Karnataka_20200412_null_1":"background",
"epi_isl_428722_Balikesir_20200322_null_4":"background",
"epi_isl_429071_California_20200328_null_5":"background",
"epi_isl_429766_Luxembourg_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_429853_Zhejiang_20200128_null_5":"background",
"epi_isl_430342_New_York_20200330_null_2":"background",
"epi_isl_430738_Beijing_20200205_null_1":"background",
"epi_isl_432003_Wales_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_432392_Wales_20200408_null_2":"background",
"epi_isl_432723_England_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_433271_Scotland_20200409_null_18":"background",
"epi_isl_433381_Scotland_20200406_null_3":"background",
"epi_isl_433684_England_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_433838_England_20200101_null_1":"background",
"epi_isl_434536_Costa_Rica_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_434675_Stockholm_20200420_null_1":"background",
"epi_isl_434720_Texas_20200315_null_1":"background",
"epi_isl_435059_EC_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_435489_New_York_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_435554_Louisiana_20200425_null_3":"background",
"epi_isl_436052_New_York_20200309_null_1":"background",
"epi_isl_436514_Florida_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_436568_Wisconsin_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_436654_California_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_437331_Ankara_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_437651_Unknown_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_437976_Ischgl_20200311_null_4":"background",
"epi_isl_438104_Vienna_20200325_null_46":"background",
"epi_isl_438365_England_20200330_null_14":"background",
"epi_isl_438715_England_20200425_null_3":"background",
"epi_isl_438781_Scotland_20200331_null_2":"background",
"epi_isl_439668_Scotland_20200430_null_8":"background",
"epi_isl_439687_England_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_440298_England_20200314_null_3":"background",
"epi_isl_440722_England_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_440922_England_20200420_null_3":"background",
"epi_isl_441236_England_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_441351_England_20200420_null_4":"background",
"epi_isl_441685_Northern_Ireland_20200327_null_2":"background",
"epi_isl_441735_England_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_442349_England_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_442490_England_20200405_null_10":"background",
"epi_isl_442638_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_442646_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_442717_England_20200405_null_3":"background",
"epi_isl_442893_England_20200406_null_3":"background",
"epi_isl_442931_England_20200408_null_2":"background",
"epi_isl_443387_England_20200413_null_5":"background",
"epi_isl_443415_England_20200414_null_5":"background",
"epi_isl_443456_England_20200414_null_2":"background",
"epi_isl_443517_England_20200416_null_6":"background",
"epi_isl_443742_England_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_444102_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_444125_England_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_444188_England_20200414_null_1":"background",
"epi_isl_444208_England_20200415_null_3":"background",
"epi_isl_444387_England_20200428_null_1":"background",
"epi_isl_444389_England_20200428_null_2":"background",
"epi_isl_444462_Gujarat_20200429_null_75":"background",
"epi_isl_444644_New_York_20200329_null_12":"background",
"epi_isl_444663_New_York_20200331_null_4":"background",
"epi_isl_444742_New_Jersey_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_444956_Unknown_20200331_null_34":"background",
"epi_isl_444998_Guam_20200326_null_2":"background",
"epi_isl_445024_Florida_20200430_null_1":"background",
"epi_isl_445340_Temuco_20200325_null_46":"background",
"epi_isl_445789_Wales_20200328_null_4":"background",
"epi_isl_445801_Wales_20200328_null_8":"background",
"epi_isl_446062_Wales_20200409_null_6":"background",
"epi_isl_446198_Wales_20200406_null_4":"background",
"epi_isl_446211_Wales_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_446704_Wales_20200414_null_10":"background",
"epi_isl_446794_Wales_20200421_null_9":"background",
"epi_isl_446852_Wales_20200418_null_8":"background",
"epi_isl_446894_Wales_20200414_null_3":"background",
"epi_isl_447030_Gujarat_20200503_null_1":"background",
"epi_isl_447245_Kinshasa_20200424_null_6":"background",
"epi_isl_447254_Taipei_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_447506_Comunitat_Valenciana_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_447520_Comunitat_Valenciana_20200401_null_9":"background",
"epi_isl_447608_Germany_20200201_null_1":"background",
"epi_isl_447615_Taipei_20200319_null_2":"background",
"epi_isl_447700_France_20200301_null_97":"background",
"epi_isl_447752_Huila_20200330_null_26890":"background",
"epi_isl_447817_Cordoba_20200409_null_1":"background",
"epi_isl_447836_Athen_20200316_null_4":"background"
}
},
"timers":{
"Model fitting":{
"order":1,
"timer":2
},
"Primary SLAC analysis":{
"order":2,
"timer":1
},
"Total time":{
"order":0,
"timer":3
}
}
}