{
"MLE":{
"content":{
"0":{
"by-branch":{
"AVERAGED": [
[117.312957686441, 284.9035213859938, 1, 0, 0.2916662140670627, 0.008524207553208592, 0, -0.4561652932158924, 1, 0.2916662140670627, 0.002335262955315958],
[117.1133080919862, 285.1031709804486, 1, 0, 0.2911698405845161, 0.008538739245710265, 0, -0.4569429436578332, 1, 0.2911698405845161, 0.002335246603080519],
[117.2131328892136, 285.0033461832212, 1, 0, 0.2914180273257894, 0.008531467211487049, 0, -0.4565537872930917, 1, 0.2914180273257894, 0.00233649519811705],
[117.1327262969946, 285.0837527754402, 0, 1, 0.2912181185791253, 0, 0.003507741112092409, 0.1877136077383261, 0.7087818814208746, 1, 0.002335246682412053],
[117.2131328892136, 285.0033461832212, 0, 1, 0.2914180273257894, 0, 0.003508730733838915, 0.1877665664551745, 0.7085819726742106, 1, 0.002336264448405917],
[117.5695374252342, 285.113643291551, 0, 1, 0.29196535404324, 0, 0.003507373370335077, 0.1876939283692453, 0.70803464595676, 1, 0.00233554194714459],
[117.1133080919862, 285.0033461832212, 1, 0, 0.2912421230179494, 0.008538739245710265, 0, -0.4569429436578332, 1, 0.2912421230179494, 0.002336474027826941],
[117.1693622224615, 285.0251906024976, 0, 1, 0.291325084836381, 0, 0.003508461823623941, 0.187752175967109, 0.7086749151636189, 1, 0.002336132116699611]
],
"NAMES": [
["Node146"],
["Node162"],
["Node171"],
["Node184"],
["Node134"],
["Node68"],
["Node14"],
["Node94"]
],
"RESOLVED": [
[117.312957686441, 284.9035213859938, 1, 0, 0.2916662140670627, 0.008524207553208592, 0, -0.4561652932158924, 1, 0.2916662140670627, 0.002335262955315958],
[117.1133080919862, 285.1031709804486, 1, 0, 0.2911698405845161, 0.008538739245710265, 0, -0.4569429436578332, 1, 0.2911698405845161, 0.002335246603080519],
[117.2131328892136, 285.0033461832212, 1, 0, 0.2914180273257894, 0.008531467211487049, 0, -0.4565537872930917, 1, 0.2914180273257894, 0.00233649519811705],
[117.1327262969946, 285.0837527754402, 0, 1, 0.2912181185791253, 0, 0.003507741112092409, 0.1877136077383261, 0.7087818814208746, 1, 0.002335246682412053],
[117.2131328892136, 285.0033461832212, 0, 1, 0.2914180273257894, 0, 0.003508730733838915, 0.1877665664551745, 0.7085819726742106, 1, 0.002336264448405917],
[117.5695374252342, 285.113643291551, 0, 1, 0.29196535404324, 0, 0.003507373370335077, 0.1876939283692453, 0.70803464595676, 1, 0.00233554194714459],
[117.1133080919862, 285.0033461832212, 1, 0, 0.2912421230179494, 0.008538739245710265, 0, -0.4569429436578332, 1, 0.2912421230179494, 0.002336474027826941],
[117.1693622224615, 285.0251906024976, 0, 1, 0.291325084836381, 0, 0.003508461823623941, 0.187752175967109, 0.7086749151636189, 1, 0.002336132116699611]
]
},
"by-site":{
"AVERAGED": [
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.7128090720411452, 2.287190927958854, 0, 0, 0.2376030240137151, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.5776844641051094, 2.034510344167377, 0, 0, 0.221149074439493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.7128090720411452, 2.287190927958854, 0, 0, 0.2376030240137151, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 1.912458666495921, 0, 0, 0.3433525122617909, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.9899516988193044, 2.010048301180696, 0, 1, 0.3299838996064348, 0, 0.4975004826563637, 26.6232904500976, 0.6700161003935652, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1.290493536146255, 1.42231553589489, 0, 0, 0.4757037822699679, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.912458666495921, 2.087541333504079, 0, 0, 0.3041528888319736, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.7128090720411452, 2.160813184437997, 0, 0, 0.2480524607693227, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.7128090720411452, 2.287190927958854, 0, 0, 0.2376030240137151, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.7128090720411452, 2.287190927958854, 0, 0, 0.2376030240137151, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.5776844641051094, 2.090063917499709, 0, 0, 0.2165438345267014, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.912458666495921, 2, 0, 0, 0.3132949754764181, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.5776844641051094, 2.090063917499709, 0, 0, 0.2165438345267014, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.7128090720411452, 2.287190927958854, 0, 0, 0.2376030240137151, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.7128090720411452, 2, 0, 0, 0.2627568152095645, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1.912458666495921, 1.087541333504079, 0, 0, 0.637486222165307, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.7128090720411452, 2.287190927958854, 0, 0, 0.2376030240137151, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 1.612194808272487, 0, 0, 0.3828198405544364, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.5776844641051094, 1.50985686939897, 0, 0, 0.27672959324615, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.9563111614472631, 2.043688838552737, 0, 0, 0.3187703871490877, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.7128090720411452, 2.287190927958854, 0, 0, 0.2376030240137151, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.7128090720411452, 2.160813184437997, 0, 0, 0.2480524607693227, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.5298905161108158, 2.137857865494003, 0, 0, 0.1986283713129097, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1.242699588151961, 1.630922668327182, 0, 0, 0.4324505718697202, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.7128090720411452, 2.160813184437997, 0, 0, 0.2480524607693227, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.912458666495921, 2.087541333504079, 0, 0, 0.3041528888319736, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.5298905161108158, 1.557650817393264, 0, 0, 0.25383474214681, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.4223155358948906, 2.57768446410511, 0, 0, 0.1407718452982969, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.5776844641051094, 2.034510344167377, 0, 0, 0.221149074439493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.7252841265104174, 2.274715873489582, 1, 0, 0.2417613755034725, 1.378770006743884, 0, -73.78363566087266, 1, 0.2417613755034724, 0.01868666397900264],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.7128090720411452, 2.287190927958854, 0, 0, 0.2376030240137151, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.5776844641051094, 1.50985686939897, 0, 0, 0.27672959324615, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.5776844641051094, 2.034510344167377, 0, 0, 0.221149074439493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -53.51409974105891, 1, 0.3333333333333333, 0.01868666397900264],
[0.7128090720411452, 2.287190927958854, 0, 0, 0.2376030240137151, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 1.956147505048658, 0, 0, 0.3382781130820263, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.7128090720411452, 2.160813184437997, 0, 0, 0.2480524607693227, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.7128090720411452, 2.160813184437997, 0, 0, 0.2480524607693227, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1.912458666495921, 1.087541333504079, 0, 0, 0.637486222165307, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.8999771424359303, 2, 1, 0, 0.3103393917374001, 1.111139331042722, 0, -59.46162098763369, 1, 0.3103393917374001, 0.01868666397900264],
[0.912458666495921, 2.043688838552737, 0, 0, 0.3086647959675821, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.912458666495921, 2.043688838552737, 0, 0, 0.3086647959675821, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.912458666495921, 2.087541333504079, 0, 0, 0.3041528888319736, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.4223155358948906, 2.57768446410511, 0, 0, 0.1407718452982969, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.7128090720411452, 2.287190927958854, 0, 0, 0.2376030240137151, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.7128090720411452, 2.287190927958854, 0, 0, 0.2376030240137151, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.7128090720411452, 2.287190927958854, 0, 0, 0.2376030240137151, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.5776844641051094, 2.090063917499709, 0, 0, 0.2165438345267014, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 1.612194808272487, 0, 0, 0.3828198405544364, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.7128090720411452, 2.287190927958854, 0, 0, 0.2376030240137151, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.7128090720411452, 2.160813184437997, 0, 0, 0.2480524607693227, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.899983699380849, 2.100016300619151, 1, 0, 0.299994566460283, 1.111131235696778, 0, -59.46118777248341, 1, 0.299994566460283, 0.01868666397900264],
[1.290493536146255, 1.42231553589489, 0, 0, 0.4757037822699679, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.5776844641051094, 2.090063917499709, 0, 0, 0.2165438345267014, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.5298905161108158, 2.137857865494003, 0, 0, 0.1986283713129097, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.7128090720411452, 2, 0, 0, 0.2627568152095645, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.5776844641051094, 1.50985686939897, 0, 0, 0.27672959324615, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.4223155358948906, 2.57768446410511, 0, 0, 0.1407718452982969, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.7128090720411452, 2.160813184437997, 0, 0, 0.2480524607693227, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.7128090720411452, 2.287190927958854, 0, 0, 0.2376030240137151, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.912458666495921, 2.087541333504079, 0, 0, 0.3041528888319736, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.7128090720411452, 2.287190927958854, 0, 0, 0.2376030240137151, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.5776844641051094, 2.090063917499709, 0, 0, 0.2165438345267014, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.912458666495921, 2.087541333504079, 0, 0, 0.3041528888319736, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.7128090720411452, 2.160813184437997, 0, 0, 0.2480524607693227, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.912458666495921, 2.043688838552737, 0, 0, 0.3086647959675821, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.04454501589818173, 1.954004388410028, 0, 1, 0.02228867387624116, 0, 0.5117695773517169, 27.38688820683934, 0.9777113261237589, 1, 0.01868666397900264],
[0.5776844641051094, 2.090063917499709, 0, 0, 0.2165438345267014, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.7128090720411452, 2, 0, 0, 0.2627568152095645, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.7128090720411452, 2.160813184437997, 0, 0, 0.2480524607693227, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.7128090720411452, 2.287190927958854, 0, 0, 0.2376030240137151, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.7128090720411452, 2.160813184437997, 0, 0, 0.2480524607693227, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.7128090720411452, 2.287190927958854, 0, 0, 0.2376030240137151, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.5776844641051094, 1.50985686939897, 0, 0, 0.27672959324615, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.9945279660144961, 2.00273090207538, 0, 1, 0.3318125026178667, 0, 0.4993182054382469, 26.72056424834889, 0.6681874973821333, 1, 0.01868666397900264],
[0.5776844641051094, 2.034510344167377, 0, 0, 0.221149074439493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 26.75704987052946, 0.6666666666666667, 1, 0.01868666397900264],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.5298905161108158, 1.557650817393264, 0, 0, 0.25383474214681, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264]
],
"RESOLVED": [
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.7128090720411452, 2.287190927958854, 0, 0, 0.2376030240137151, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.5776844641051094, 2.034510344167377, 0, 0, 0.221149074439493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.7128090720411452, 2.287190927958854, 0, 0, 0.2376030240137151, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 1.912458666495921, 0, 0, 0.3433525122617909, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.9899516988193044, 2.010048301180696, 0, 1, 0.3299838996064348, 0, 0.4975004826563637, 26.6232904500976, 0.6700161003935652, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1.290493536146255, 1.42231553589489, 0, 0, 0.4757037822699679, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.912458666495921, 2.087541333504079, 0, 0, 0.3041528888319736, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.7128090720411452, 2.160813184437997, 0, 0, 0.2480524607693227, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.7128090720411452, 2.287190927958854, 0, 0, 0.2376030240137151, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.7128090720411452, 2.287190927958854, 0, 0, 0.2376030240137151, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.5776844641051094, 2.090063917499709, 0, 0, 0.2165438345267014, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.912458666495921, 2, 0, 0, 0.3132949754764181, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.5776844641051094, 2.090063917499709, 0, 0, 0.2165438345267014, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.7128090720411452, 2.287190927958854, 0, 0, 0.2376030240137151, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.7128090720411452, 2, 0, 0, 0.2627568152095645, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1.912458666495921, 1.087541333504079, 0, 0, 0.637486222165307, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.7128090720411452, 2.287190927958854, 0, 0, 0.2376030240137151, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 1.612194808272487, 0, 0, 0.3828198405544364, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.5776844641051094, 1.50985686939897, 0, 0, 0.27672959324615, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.9563111614472631, 2.043688838552737, 0, 0, 0.3187703871490877, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.7128090720411452, 2.287190927958854, 0, 0, 0.2376030240137151, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.7128090720411452, 2.160813184437997, 0, 0, 0.2480524607693227, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.5298905161108158, 2.137857865494003, 0, 0, 0.1986283713129097, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1.242699588151961, 1.630922668327182, 0, 0, 0.4324505718697202, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.7128090720411452, 2.160813184437997, 0, 0, 0.2480524607693227, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.912458666495921, 2.087541333504079, 0, 0, 0.3041528888319736, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.5298905161108158, 1.557650817393264, 0, 0, 0.25383474214681, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.4223155358948906, 2.57768446410511, 0, 0, 0.1407718452982969, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.5776844641051094, 2.034510344167377, 0, 0, 0.221149074439493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.7252841265104174, 2.274715873489582, 1, 0, 0.2417613755034725, 1.378770006743884, 0, -73.78363566087266, 1, 0.2417613755034724, 0.01868666397900264],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.7128090720411452, 2.287190927958854, 0, 0, 0.2376030240137151, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.5776844641051094, 1.50985686939897, 0, 0, 0.27672959324615, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.5776844641051094, 2.034510344167377, 0, 0, 0.221149074439493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -53.51409974105891, 1, 0.3333333333333333, 0.01868666397900264],
[0.7128090720411452, 2.287190927958854, 0, 0, 0.2376030240137151, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 1.956147505048658, 0, 0, 0.3382781130820263, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.7128090720411452, 2.160813184437997, 0, 0, 0.2480524607693227, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.7128090720411452, 2.160813184437997, 0, 0, 0.2480524607693227, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1.912458666495921, 1.087541333504079, 0, 0, 0.637486222165307, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.8999771424359303, 2, 1, 0, 0.3103393917374001, 1.111139331042722, 0, -59.46162098763369, 1, 0.3103393917374001, 0.01868666397900264],
[0.912458666495921, 2.043688838552737, 0, 0, 0.3086647959675821, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.912458666495921, 2.043688838552737, 0, 0, 0.3086647959675821, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.912458666495921, 2.087541333504079, 0, 0, 0.3041528888319736, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.4223155358948906, 2.57768446410511, 0, 0, 0.1407718452982969, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.7128090720411452, 2.287190927958854, 0, 0, 0.2376030240137151, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.7128090720411452, 2.287190927958854, 0, 0, 0.2376030240137151, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.7128090720411452, 2.287190927958854, 0, 0, 0.2376030240137151, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.5776844641051094, 2.090063917499709, 0, 0, 0.2165438345267014, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 1.612194808272487, 0, 0, 0.3828198405544364, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.7128090720411452, 2.287190927958854, 0, 0, 0.2376030240137151, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.7128090720411452, 2.160813184437997, 0, 0, 0.2480524607693227, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.899983699380849, 2.100016300619151, 1, 0, 0.299994566460283, 1.111131235696778, 0, -59.46118777248341, 1, 0.299994566460283, 0.01868666397900264],
[1.290493536146255, 1.42231553589489, 0, 0, 0.4757037822699679, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.5776844641051094, 2.090063917499709, 0, 0, 0.2165438345267014, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.5298905161108158, 2.137857865494003, 0, 0, 0.1986283713129097, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.7128090720411452, 2, 0, 0, 0.2627568152095645, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.5776844641051094, 1.50985686939897, 0, 0, 0.27672959324615, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.4223155358948906, 2.57768446410511, 0, 0, 0.1407718452982969, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.7128090720411452, 2.160813184437997, 0, 0, 0.2480524607693227, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.7128090720411452, 2.287190927958854, 0, 0, 0.2376030240137151, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.912458666495921, 2.087541333504079, 0, 0, 0.3041528888319736, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.7128090720411452, 2.287190927958854, 0, 0, 0.2376030240137151, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.5776844641051094, 2.090063917499709, 0, 0, 0.2165438345267014, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.912458666495921, 2.087541333504079, 0, 0, 0.3041528888319736, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.7128090720411452, 2.160813184437997, 0, 0, 0.2480524607693227, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.912458666495921, 2.043688838552737, 0, 0, 0.3086647959675821, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.04454501589818173, 1.954004388410028, 0, 1, 0.02228867387624116, 0, 0.5117695773517169, 27.38688820683934, 0.9777113261237589, 1, 0.01868666397900264],
[0.5776844641051094, 2.090063917499709, 0, 0, 0.2165438345267014, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.7128090720411452, 2, 0, 0, 0.2627568152095645, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.7128090720411452, 2.160813184437997, 0, 0, 0.2480524607693227, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.7128090720411452, 2.287190927958854, 0, 0, 0.2376030240137151, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.7128090720411452, 2.160813184437997, 0, 0, 0.2480524607693227, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.7128090720411452, 2.287190927958854, 0, 0, 0.2376030240137151, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.5776844641051094, 1.50985686939897, 0, 0, 0.27672959324615, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.9945279660144961, 2.00273090207538, 0, 1, 0.3318125026178667, 0, 0.4993182054382469, 26.72056424834889, 0.6681874973821333, 1, 0.01868666397900264],
[0.5776844641051094, 2.034510344167377, 0, 0, 0.221149074439493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 26.75704987052946, 0.6666666666666667, 1, 0.01868666397900264],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.01868666397900264],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264],
[0.5298905161108158, 1.557650817393264, 0, 0, 0.25383474214681, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01868666397900264]
]
}
}
},
"headers": [
["ES", "Expected synonymous sites"],
["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
]
},
"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
},
"branch attributes":{
"0":{
"Node117":{
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node134":{
"Global MG94xREV":0.002336264448405917,
"Nucleotide GTR":0.002401861649880278,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "S", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "TCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node14":{
"Global MG94xREV":0.002336474027826941,
"Nucleotide GTR":0.002402077113833555,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAT", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node146":{
"Global MG94xREV":0.002335262955315958,
"Nucleotide GTR":0.002400832037052399,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAC", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node162":{
"Global MG94xREV":0.002335246603080519,
"Nucleotide GTR":0.002400815225681915,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAT", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node171":{
"Global MG94xREV":0.00233649519811705,
"Nucleotide GTR":0.002402098878539159,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCT", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node184":{
"Global MG94xREV":0.002335246682412053,
"Nucleotide GTR":0.0024008153072409,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ATT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node68":{
"Global MG94xREV":0.00233554194714459,
"Nucleotide GTR":0.002401118862362039,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "C", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGT", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node94":{
"Global MG94xREV":0.002336132116699611,
"Nucleotide GTR":0.002401725602588774,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "C", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "TGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1":{
"Global MG94xREV":0.004873349429063562,
"Nucleotide GTR":0.004822003474246302,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "L", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCG", "CTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414934_Shandong_20200121_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002431990859280393,
"Nucleotide GTR":0.002406367231302499,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414934_Shandong_20200121_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0]
]
},
"epi_isl_415486_Netherlands_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002427906529647561,
"Nucleotide GTR":0.002402325934456016,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCC", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415486_Netherlands_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415525_Noord_Holland_20200312_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002428973123379636,
"Nucleotide GTR":0.002403381290480973,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "F", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "TTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415525_Noord_Holland_20200312_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415593_Washington_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.004869150412629215,
"Nucleotide GTR":0.004817848698946566,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "R", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACA", "CGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415593_Washington_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415618_Washington_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "C", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGT", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415618_Washington_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416345_Shanghai_20200204_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002428264821089078,
"Nucleotide GTR":0.002402680450913523,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "A", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "GCT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416345_Shanghai_20200204_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417563_Reykjavik_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002439628344824541,
"Nucleotide GTR":0.002413924247757908,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "N", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "AAC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417563_Reykjavik_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002427621010504713,
"Nucleotide GTR":0.002402043423563085,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "G", "C", "D", "Q", "L", "C", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "GGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "TGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419245_Hong_Kong_20200222_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002427158565660931,
"Nucleotide GTR":0.002401585851070937,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "F", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TTT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419245_Hong_Kong_20200222_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419249_Hong_Kong_20200225_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002426066783952837,
"Nucleotide GTR":0.002400505572452263,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "L", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "TTA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419249_Hong_Kong_20200225_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419768_Victoria_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002429083878210799,
"Nucleotide GTR":0.002403490878391387,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "L", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CTT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419768_Victoria_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419917_Victoria_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002425658296984969,
"Nucleotide GTR":0.002400101389332026,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "S", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "TCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419917_Victoria_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420364_Anderlecht_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002438479201003518,
"Nucleotide GTR":0.002412787211397591,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "T", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "ACT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420364_Anderlecht_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420412_Koersel_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.004906685883585216,
"Nucleotide GTR":0.00485498869352153,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "S", "H", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TCT", "CAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420412_Koersel_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420431_Saint_Saulve_20200324_null_3":{
"Global MG94xREV":0.002426180899535021,
"Nucleotide GTR":0.002400618485704591,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGC", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420431_Saint_Saulve_20200324_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421238_Jiangxi_20200129_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00242935242792697,
"Nucleotide GTR":0.002403756598648723,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAA", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421238_Jiangxi_20200129_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421585_New_Jersey_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002429047104485344,
"Nucleotide GTR":0.002403454492116509,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "S", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "TCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421585_New_Jersey_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421692_Minnesota_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002427979679108649,
"Nucleotide GTR":0.002402398313209199,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACC", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421692_Minnesota_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421722_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002429426482891369,
"Nucleotide GTR":0.002403829873364774,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGA", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421722_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422746_Netherlands_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002425618956498909,
"Nucleotide GTR":0.002400062463340112,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "N", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAT", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422746_Netherlands_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423274_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAC", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423274_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424870_Missouri_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002429083878345968,
"Nucleotide GTR":0.00240349087852513,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGT", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424870_Missouri_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424936_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002431991200884923,
"Nucleotide GTR":0.00240636756930786,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "K", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "AAG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424936_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426017_Scotland_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002429083878167029,
"Nucleotide GTR":0.002403490878348077,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "F", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "TTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0]
],
"original name":"epi_isl_426017_Scotland_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426068_Idaho_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002429046846845943,
"Nucleotide GTR":0.002403454237191615,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "I", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ATT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426068_Idaho_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426088_Washington_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.004870630751957687,
"Nucleotide GTR":0.004819313441315008,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "I", "C", "T", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATT", "TGT", "ACA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426088_Washington_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426516_Arizona_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAT", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426516_Arizona_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427290_Ohio_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002429047106539266,
"Nucleotide GTR":0.002403454494148793,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "L", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CTA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427290_Ohio_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427655_New_South_Wales_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002427158227607535,
"Nucleotide GTR":0.002401585516579297,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "C", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "TGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427655_New_South_Wales_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428480_Karnataka_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002449020265238257,
"Nucleotide GTR":0.002423217214232812,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "-", "G", "W", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "---", "GGC", "TGG", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428480_Karnataka_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429139_Varmland_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002428337887758243,
"Nucleotide GTR":0.002402752747747087,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "R", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AGG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429139_Varmland_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429598_Washington_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002432784842198247,
"Nucleotide GTR":0.002407152848760087,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "N", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "AAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429598_Washington_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429853_Zhejiang_20200128_null_4":{
"Global MG94xREV":0.002427979678964884,
"Nucleotide GTR":0.002402398313066952,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAC", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429853_Zhejiang_20200128_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430578_Victoria_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002427222761968413,
"Nucleotide GTR":0.002401649371001573,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAC", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTT", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430578_Victoria_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432283_Wales_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002428016129248036,
"Nucleotide GTR":0.002402434379307336,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "CTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432283_Wales_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432559_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002428016130864017,
"Nucleotide GTR":0.002402434380906291,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAC", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432559_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432895_Scotland_20200406_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002429047186721003,
"Nucleotide GTR":0.002403454573485728,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "S", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "TCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432895_Scotland_20200406_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434257_Washington_20200331_null_4":{
"Global MG94xREV":0.002425406527513544,
"Nucleotide GTR":0.002399852272521586,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTC", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434257_Washington_20200331_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0]
]
},
"epi_isl_434602_Virginia_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002429571168758948,
"Nucleotide GTR":0.002403973034811803,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCT", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAT", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434602_Virginia_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434604_Virginia_20200408_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAT", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434604_Virginia_20200408_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435446_Louisiana_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002425619038994401,
"Nucleotide GTR":0.002400062544966426,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "S", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "TCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435446_Louisiana_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435476_New_York_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002429426484564459,
"Nucleotide GTR":0.002403829875020238,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTA", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435476_New_York_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435699_Singapore_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002425619298593418,
"Nucleotide GTR":0.00240006280183029,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "S", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "TCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435699_Singapore_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436054_New_York_20200309_null_3":{
"Global MG94xREV":0.002426027811087515,
"Nucleotide GTR":0.002400467010207808,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "L", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "TTA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436054_New_York_20200309_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436336_Comunitat_Valenciana_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002429231930601254,
"Nucleotide GTR":0.002403637370891367,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTT", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436336_Comunitat_Valenciana_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436631_Wisconsin_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002433254599144461,
"Nucleotide GTR":0.002407617656313832,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "T", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "ACC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436631_Wisconsin_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436982_Unknown_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002429232004932739,
"Nucleotide GTR":0.002403637444439691,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436982_Unknown_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437217_Bavaria_20200411_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ATT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437217_Bavaria_20200411_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437221_Bavaria_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002425109402255354,
"Nucleotide GTR":0.002399558277796168,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ACG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437221_Bavaria_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437334_Ankara_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002425503481098919,
"Nucleotide GTR":0.002399948204597119,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "A", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "GCC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437334_Ankara_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437843_Washington_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002425430500639363,
"Nucleotide GTR":0.002399875993064852,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACG", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437843_Washington_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438320_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002439590385349425,
"Nucleotide GTR":0.002413886688226511,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGA", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438320_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438363_England_20200329_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCT", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438363_England_20200329_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438450_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002433254599179304,
"Nucleotide GTR":0.002407617656348309,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "N", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "AAT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438450_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438754_Scotland_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00242837476237148,
"Nucleotide GTR":0.002402789233846785,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAG", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438754_Scotland_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438824_Scotland_20200402_null_3":{
"Global MG94xREV":0.002427942990654478,
"Nucleotide GTR":0.00240236201130718,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCC", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438824_Scotland_20200402_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438853_Scotland_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002425109226284093,
"Nucleotide GTR":0.002399558103678954,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGC", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438853_Scotland_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438986_Scotland_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002429417165448501,
"Nucleotide GTR":0.002403820654091143,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "V", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438986_Scotland_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438996_Scotland_20200422_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002429009815360563,
"Nucleotide GTR":0.002403417595872589,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "V", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GTA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438996_Scotland_20200422_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439062_Scotland_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002428301353766595,
"Nucleotide GTR":0.002402716598680164,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAG", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439062_Scotland_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439184_Scotland_20200422_null_4":{
"Global MG94xREV":0.002429232004877965,
"Nucleotide GTR":0.002403637444385498,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATT", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439184_Scotland_20200422_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439195_Scotland_20200422_null_5":{
"Global MG94xREV":0.002429269120905083,
"Nucleotide GTR":0.002403674169355523,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "I", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ATA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439195_Scotland_20200422_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439341_Scotland_20200430_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002429009814288637,
"Nucleotide GTR":0.002403417594811958,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCT", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439341_Scotland_20200430_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439493_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002425619040029967,
"Nucleotide GTR":0.002400062545991084,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "L", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TTG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439493_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439748_England_20200409_null_3":{
"Global MG94xREV":0.00242897278430508,
"Nucleotide GTR":0.002403380954978928,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "I", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ATT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439748_England_20200409_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440094_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002425503481128685,
"Nucleotide GTR":0.002399948204626572,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "V", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "GTA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440094_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440119_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002425182207394503,
"Nucleotide GTR":0.002399630315855213,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCC", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440119_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440540_England_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002428972783843898,
"Nucleotide GTR":0.002403380954522606,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "I", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ATA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440540_England_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440914_England_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002427575180280206,
"Nucleotide GTR":0.002401998076209068,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "I", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATA", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440914_England_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441006_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002429278280734003,
"Nucleotide GTR":0.002403683232675835,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "I", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "ATC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441006_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441031_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002428301354556916,
"Nucleotide GTR":0.002402716599462159,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "G", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GGT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441031_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441522_England_20200420_null_6":{
"Global MG94xREV":0.002427042722915801,
"Nucleotide GTR":0.002401471228853179,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTT", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441522_England_20200420_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442425_England_20200411_null_4":{
"Global MG94xREV":0.002429010157171752,
"Nucleotide GTR":0.00240341793408243,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTT", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442425_England_20200411_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442445_England_20200325_null_3":{
"Global MG94xREV":0.002425406786524628,
"Nucleotide GTR":0.00239985252880371,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "T", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ACG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442445_England_20200325_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442498_England_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002429269121078541,
"Nucleotide GTR":0.002403674169527152,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442498_England_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442569_England_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002429009814146065,
"Nucleotide GTR":0.002403417594670888,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTT", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442569_England_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442749_England_20200406_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002425182547296935,
"Nucleotide GTR":0.002399630652176405,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGC", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442749_England_20200406_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442854_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "C", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "TGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442854_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442868_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002429009815365001,
"Nucleotide GTR":0.002403417595876979,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTT", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442868_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442890_England_20200407_null_8":{
"Global MG94xREV":0.002429009814248999,
"Nucleotide GTR":0.002403417594772735,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "V", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GTT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442890_England_20200407_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442971_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002428301611483651,
"Nucleotide GTR":0.002402716853681892,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "GTG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442971_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443264_Bourgogne_20200402_null_3":{
"Global MG94xREV":0.002427042981003115,
"Nucleotide GTR":0.002401471484221262,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCT", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443264_Bourgogne_20200402_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443303_Ile_de_France_20200409_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002427942989570904,
"Nucleotide GTR":0.002402362010235025,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAC", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443303_Ile_de_France_20200409_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443479_England_20200414_null_3":{
"Global MG94xREV":0.002429009898061715,
"Nucleotide GTR":0.002403417677702396,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACT", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443479_England_20200414_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443481_England_20200414_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002433254599297253,
"Nucleotide GTR":0.002407617656465019,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "E", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAA", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443481_England_20200414_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443510_England_20200416_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002428301354813422,
"Nucleotide GTR":0.002402716599715961,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTG", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443510_England_20200416_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443791_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002427943147457871,
"Nucleotide GTR":0.002402362166458484,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAC", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443791_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444408_England_20200420_null_20":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "S", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "TCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444408_England_20200420_null_20",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444565_Illinois_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002429315389279844,
"Nucleotide GTR":0.002403719950243406,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "I", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "ATA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444565_Illinois_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444632_New_York_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002427943073127564,
"Nucleotide GTR":0.002402362092911325,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGC", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444632_New_York_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445159_Louisiana_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002429009814220358,
"Nucleotide GTR":0.002403417594744398,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAT", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445159_Louisiana_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445235_Vastra_Gotaland_20200420_null_3":{
"Global MG94xREV":0.002429046845973299,
"Nucleotide GTR":0.002403454236328165,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "I", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ATT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445235_Vastra_Gotaland_20200420_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445240_Uppsala_20200422_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002428301353595169,
"Nucleotide GTR":0.002402716598510542,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "S", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AGT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445240_Uppsala_20200422_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445267_Antofagasta_20200312_null_4":{
"Global MG94xREV":0.002429047745462011,
"Nucleotide GTR":0.0024034551263398,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "TTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445267_Antofagasta_20200312_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445427_Wales_20200402_null_13":{
"Global MG94xREV":0.002429046847162166,
"Nucleotide GTR":0.002403454237504508,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "V", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GTT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445427_Wales_20200402_null_13",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446190_Wales_20200404_null_3":{
"Global MG94xREV":0.002429046847833731,
"Nucleotide GTR":0.002403454238168995,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGT", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446190_Wales_20200404_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446291_Wales_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002429046846191079,
"Nucleotide GTR":0.00240345423654365,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "F", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "TTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446291_Wales_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446367_Wales_20200409_null_11":{
"Global MG94xREV":0.002427979678173809,
"Nucleotide GTR":0.00240239831228421,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "CTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446367_Wales_20200409_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446632_Wales_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002429046846267194,
"Nucleotide GTR":0.002403454236618962,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGT", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446632_Wales_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446764_Wales_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002427942989427668,
"Nucleotide GTR":0.002402362010093295,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAC", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446764_Wales_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446971_Wales_20200420_null_44":{
"Global MG94xREV":0.002429176216348386,
"Nucleotide GTR":0.002403582243647815,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "E", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAG", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446971_Wales_20200420_null_44",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447241_Kinshasa_20200424_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002429009815433478,
"Nucleotide GTR":0.002403417595944733,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "L", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CTC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447241_Kinshasa_20200424_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447534_Gujarat_20200505_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002427943146442916,
"Nucleotide GTR":0.002402362165454221,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAC", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447534_Gujarat_20200505_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447537_Gujarat_20200505_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002429009899157133,
"Nucleotide GTR":0.002403417678786273,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "V", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GTT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447537_Gujarat_20200505_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447580_Telangana_20200413_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002429009815360563,
"Nucleotide GTR":0.002403417595872589,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "V", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GTT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447580_Telangana_20200413_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447621_Taipei_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002429009815426195,
"Nucleotide GTR":0.00240341759593753,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCT", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447621_Taipei_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447794_Valle_del_Cauca_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002429574535313599,
"Nucleotide GTR":0.002403976365896194,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCA", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447794_Valle_del_Cauca_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447835_Athen_20200331_null_25801":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447835_Athen_20200331_null_25801",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
}
},
"attributes":{
"Global MG94xREV":{
"attribute type":"branch length",
"display order":1
},
"Nucleotide GTR":{
"attribute type":"branch length",
"display order":0
},
"amino-acid":{
"attribute type":"node label",
"display order":1
},
"codon":{
"attribute type":"node label",
"display order":0
},
"nonsynonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":1
},
"original name":{
"attribute type":"node label",
"display order":-1
},
"synonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":0
}
}
},
"data partitions":{
"0":{
"coverage": [
[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138]
],
"name":"slac.filter.default"
}
},
"fits":{
"Global MG94xREV":{
"AIC-c":3038.493146294969,
"Equilibrium frequencies": [
[0.02530983110187703],
[0.01254076777007266],
[0.009901819886001003],
[0.03598972239070128],
[0.02132925376955872],
[0.01056843157729116],
[0.008344521473844034],
[0.03032947627652514],
[0.01896304074531071],
[0.009395996727284786],
[0.007418801539811126],
[0.02696480151764725],
[0.01695821250733376],
[0.008402624418708286],
[0.006634464100540572],
[0.02411400368199998],
[0.01596893183772765],
[0.007912445757024838],
[0.00624743350489129],
[0.02270728008426841],
[0.01345743471083135],
[0.006668024089537876],
[0.00526487490564043],
[0.01913601625330043],
[0.01196450122005994],
[0.005928290500302677],
[0.004680803108879175],
[0.01701311540641732],
[0.01069957908961431],
[0.005301534256008031],
[0.004185934887314454],
[0.01521443898944128],
[0.03066203883350898],
[0.01519273308542421],
[0.01199573338300381],
[0.04360038046516443],
[0.02583969860326233],
[0.01280331180906821],
[0.01010911690592357],
[0.0367431760270354],
[0.02297310833066005],
[0.01138294504502495],
[0.008987637254320316],
[0.03266698177257474],
[0.02054432399622782],
[0.0101795067376296],
[0.008037437905905652],
[0.02921333273038032],
[0.01280196144722893],
[0.03673930073418145],
[0.02177349022503038],
[0.01078854629084438],
[0.008518317551390738],
[0.0309611654665438],
[0.009591692475802228],
[0.007573317123689499],
[0.02752641271971343],
[0.01731141080938335],
[0.008577630639214415],
[0.00677264384408999],
[0.02461623970200602]
],
"Log Likelihood":-1385.059784840899,
"Rate Distributions":{
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *background*": [
[0.5488196496761698, 1]
],
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *test*": [
[0.5098008582338243, 1]
]
},
"display order":1,
"estimated parameters":133
},
"Nucleotide GTR":{
"AIC-c":3287.95663135018,
"Equilibrium frequencies": [
[0.2781518151815182],
[0.200990099009901],
[0.2228822882288229],
[0.297975797579758]
],
"Log Likelihood":-1419.873891522445,
"Rate Distributions":{
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide C":0.1728864828034959,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide G":1,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide T":0.4302005724146552,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide G":0.2149530302541947,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide T":3.358001144845187,
"Substitution rate from nucleotide G to nucleotide T":0.6831693594501751
},
"display order":0,
"estimated parameters":223
}
},
"input":{
"file name":"/data/shares/veg/SARS-CoV-2/SARS-CoV-2/data/fasta/2020-05-18/sequences.nsp10.compressed.fas",
"number of sequences":109,
"number of sites":139,
"partition count":1,
"trees":{
"0":"(epi_isl_447534_Gujarat_20200505_null_1,epi_isl_443479_England_20200414_null_3,epi_isl_432895_Scotland_20200406_null_2,epi_isl_415593_Washington_20200310_null_1,epi_isl_447835_Athen_20200331_null_25801,epi_isl_444565_Illinois_20200318_null_1,epi_isl_426017_Scotland_20200331_null_1,epi_isl_422746_Netherlands_20200325_null_1,epi_isl_437334_Ankara_20200324_null_1,epi_isl_419768_Victoria_20200312_null_1,epi_isl_414934_Shandong_20200121_null_1,epi_isl_434257_Washington_20200331_null_4,epi_isl_415486_Netherlands_20200313_null_1,epi_isl_447241_Kinshasa_20200424_null_1,epi_isl_424870_Missouri_20200306_null_1,(epi_isl_423274_England_20200320_null_1,epi_isl_430578_Victoria_20200404_null_1)Node146,epi_isl_441522_England_20200420_null_6,epi_isl_442868_England_20200408_null_1,epi_isl_445267_Antofagasta_20200312_null_4,epi_isl_439493_England_20200330_null_1,epi_isl_442498_England_20200325_null_2,epi_isl_438996_Scotland_20200422_null_1,(epi_isl_426516_Arizona_20200313_null_1,epi_isl_443481_England_20200414_null_2)Node162,epi_isl_429139_Varmland_20200306_null_1,(epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1,epi_isl_438363_England_20200329_null_5)Node171,epi_isl_447621_Taipei_20200413_null_1,epi_isl_443510_England_20200416_null_2,epi_isl_446291_Wales_20200408_null_2,epi_isl_417563_Reykjavik_20200316_null_1,epi_isl_437221_Bavaria_20200406_null_1,epi_isl_443303_Ile_de_France_20200409_null_2,(epi_isl_437217_Bavaria_20200411_null_6,epi_isl_438450_England_20200331_null_1)Node184,epi_isl_446367_Wales_20200409_null_11,epi_isl_442890_England_20200407_null_8,epi_isl_421692_Minnesota_20200317_null_1,epi_isl_429598_Washington_20200331_null_1,epi_isl_440094_England_20200323_null_1,epi_isl_416345_Shanghai_20200204_null_1,epi_isl_445240_Uppsala_20200422_null_1,epi_isl_421722_New_York_20200318_null_1,epi_isl_420412_Koersel_20200324_null_1,epi_isl_438986_Scotland_20200420_null_1,epi_isl_439062_Scotland_20200322_null_1,epi_isl_446190_Wales_20200404_null_3,epi_isl_424936_New_York_20200401_null_1,epi_isl_442445_England_20200325_null_3,epi_isl_441031_England_20200406_null_1,(epi_isl_436631_Wisconsin_20200326_null_1,epi_isl_444408_England_20200420_null_20)Node134,epi_isl_446632_Wales_20200408_null_2,epi_isl_439748_England_20200409_null_3,epi_isl_446764_Wales_20200416_null_1,epi_isl_435476_New_York_20200330_null_1,(epi_isl_415618_Washington_20200309_null_1,epi_isl_426088_Washington_20200325_null_1)Node68,epi_isl_440914_England_20200419_null_1,epi_isl_441006_England_20200403_null_1,epi_isl_445235_Vastra_Gotaland_20200420_null_3,epi_isl_437843_Washington_20200405_null_1,epi_isl_419245_Hong_Kong_20200222_null_2,epi_isl_420431_Saint_Saulve_20200324_null_3,epi_isl_428480_Karnataka_20200406_null_1,epi_isl_443791_England_20200331_null_1,epi_isl_432283_Wales_20200408_null_1,epi_isl_419917_Victoria_20200320_null_2,epi_isl_436982_Unknown_20200330_null_2,epi_isl_439341_Scotland_20200430_null_2,epi_isl_427290_Ohio_20200331_null_1,epi_isl_446971_Wales_20200420_null_44,epi_isl_447794_Valle_del_Cauca_20200403_null_1,epi_isl_447580_Telangana_20200413_null_2,epi_isl_429853_Zhejiang_20200128_null_4,epi_isl_435699_Singapore_20200318_null_1,epi_isl_442749_England_20200406_null_2,epi_isl_444632_New_York_20200330_null_1,epi_isl_432559_England_20200402_null_1,epi_isl_420364_Anderlecht_20200319_null_1,epi_isl_436336_Comunitat_Valenciana_20200326_null_1,epi_isl_442425_England_20200411_null_4,epi_isl_426068_Idaho_20200327_null_1,epi_isl_438320_England_20200330_null_1,epi_isl_440119_England_20200318_null_1,epi_isl_442569_England_20200411_null_1,epi_isl_445427_Wales_20200402_null_13,epi_isl_436054_New_York_20200309_null_3,epi_isl_439195_Scotland_20200422_null_5,epi_isl_415525_Noord_Holland_20200312_null_2,epi_isl_445159_Louisiana_20200407_null_1,epi_isl_438754_Scotland_20200330_null_2,(epi_isl_434602_Virginia_20200408_null_1,epi_isl_434604_Virginia_20200408_null_6)Node14,epi_isl_443264_Bourgogne_20200402_null_3,epi_isl_442971_England_20200407_null_1,epi_isl_421585_New_Jersey_20200318_null_1,epi_isl_435446_Louisiana_20200328_null_1,epi_isl_439184_Scotland_20200422_null_4,epi_isl_447537_Gujarat_20200505_null_1,epi_isl_421238_Jiangxi_20200129_null_1,epi_isl_419249_Hong_Kong_20200225_null_1,epi_isl_438853_Scotland_20200407_null_1,epi_isl_440540_England_20200310_null_1,epi_isl_438824_Scotland_20200402_null_3,(epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1,epi_isl_442854_England_20200408_null_1)Node94,epi_isl_427655_New_South_Wales_20200311_null_1)"
}
},
"tested":{
"0":{
"Node134":"test",
"Node14":"test",
"Node146":"test",
"Node162":"test",
"Node171":"test",
"Node184":"test",
"Node68":"test",
"Node94":"test",
"epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1":"background",
"epi_isl_414934_Shandong_20200121_null_1":"background",
"epi_isl_415486_Netherlands_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_415525_Noord_Holland_20200312_null_2":"background",
"epi_isl_415593_Washington_20200310_null_1":"background",
"epi_isl_415618_Washington_20200309_null_1":"background",
"epi_isl_416345_Shanghai_20200204_null_1":"background",
"epi_isl_417563_Reykjavik_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1":"background",
"epi_isl_419245_Hong_Kong_20200222_null_2":"background",
"epi_isl_419249_Hong_Kong_20200225_null_1":"background",
"epi_isl_419768_Victoria_20200312_null_1":"background",
"epi_isl_419917_Victoria_20200320_null_2":"background",
"epi_isl_420364_Anderlecht_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_420412_Koersel_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_420431_Saint_Saulve_20200324_null_3":"background",
"epi_isl_421238_Jiangxi_20200129_null_1":"background",
"epi_isl_421585_New_Jersey_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_421692_Minnesota_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_421722_New_York_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_422746_Netherlands_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_423274_England_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_424870_Missouri_20200306_null_1":"background",
"epi_isl_424936_New_York_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_426017_Scotland_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_426068_Idaho_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_426088_Washington_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_426516_Arizona_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_427290_Ohio_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_427655_New_South_Wales_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_428480_Karnataka_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_429139_Varmland_20200306_null_1":"background",
"epi_isl_429598_Washington_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_429853_Zhejiang_20200128_null_4":"background",
"epi_isl_430578_Victoria_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_432283_Wales_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_432559_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_432895_Scotland_20200406_null_2":"background",
"epi_isl_434257_Washington_20200331_null_4":"background",
"epi_isl_434602_Virginia_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_434604_Virginia_20200408_null_6":"background",
"epi_isl_435446_Louisiana_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_435476_New_York_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_435699_Singapore_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_436054_New_York_20200309_null_3":"background",
"epi_isl_436336_Comunitat_Valenciana_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_436631_Wisconsin_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_436982_Unknown_20200330_null_2":"background",
"epi_isl_437217_Bavaria_20200411_null_6":"background",
"epi_isl_437221_Bavaria_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_437334_Ankara_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_437843_Washington_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_438320_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_438363_England_20200329_null_5":"background",
"epi_isl_438450_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_438754_Scotland_20200330_null_2":"background",
"epi_isl_438824_Scotland_20200402_null_3":"background",
"epi_isl_438853_Scotland_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_438986_Scotland_20200420_null_1":"background",
"epi_isl_438996_Scotland_20200422_null_1":"background",
"epi_isl_439062_Scotland_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_439184_Scotland_20200422_null_4":"background",
"epi_isl_439195_Scotland_20200422_null_5":"background",
"epi_isl_439341_Scotland_20200430_null_2":"background",
"epi_isl_439493_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_439748_England_20200409_null_3":"background",
"epi_isl_440094_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_440119_England_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_440540_England_20200310_null_1":"background",
"epi_isl_440914_England_20200419_null_1":"background",
"epi_isl_441006_England_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_441031_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_441522_England_20200420_null_6":"background",
"epi_isl_442425_England_20200411_null_4":"background",
"epi_isl_442445_England_20200325_null_3":"background",
"epi_isl_442498_England_20200325_null_2":"background",
"epi_isl_442569_England_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_442749_England_20200406_null_2":"background",
"epi_isl_442854_England_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_442868_England_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_442890_England_20200407_null_8":"background",
"epi_isl_442971_England_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_443264_Bourgogne_20200402_null_3":"background",
"epi_isl_443303_Ile_de_France_20200409_null_2":"background",
"epi_isl_443479_England_20200414_null_3":"background",
"epi_isl_443481_England_20200414_null_2":"background",
"epi_isl_443510_England_20200416_null_2":"background",
"epi_isl_443791_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_444408_England_20200420_null_20":"background",
"epi_isl_444565_Illinois_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_444632_New_York_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_445159_Louisiana_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_445235_Vastra_Gotaland_20200420_null_3":"background",
"epi_isl_445240_Uppsala_20200422_null_1":"background",
"epi_isl_445267_Antofagasta_20200312_null_4":"background",
"epi_isl_445427_Wales_20200402_null_13":"background",
"epi_isl_446190_Wales_20200404_null_3":"background",
"epi_isl_446291_Wales_20200408_null_2":"background",
"epi_isl_446367_Wales_20200409_null_11":"background",
"epi_isl_446632_Wales_20200408_null_2":"background",
"epi_isl_446764_Wales_20200416_null_1":"background",
"epi_isl_446971_Wales_20200420_null_44":"background",
"epi_isl_447241_Kinshasa_20200424_null_1":"background",
"epi_isl_447534_Gujarat_20200505_null_1":"background",
"epi_isl_447537_Gujarat_20200505_null_1":"background",
"epi_isl_447580_Telangana_20200413_null_2":"background",
"epi_isl_447621_Taipei_20200413_null_1":"background",
"epi_isl_447794_Valle_del_Cauca_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_447835_Athen_20200331_null_25801":"background"
}
},
"timers":{
"Model fitting":{
"order":1,
"timer":3
},
"Primary SLAC analysis":{
"order":2,
"timer":1
},
"Total time":{
"order":0,
"timer":4
}
}
}