{
"MLE":{
"content":{
"0":{
"by-branch":{
"AVERAGED": [
[157.6950573770327, 361.0800700658933, 1, 0, 0.3039757479398082, 0.006341352840305593, 0, -0.1104417533114398, 1, 0.3039757479398082, 0.001645220962649769],
[157.8641938722289, 361.0800700658933, 1, 0, 0.3042025990888537, 0.006334558682821854, 0, -0.1103234254587443, 1, 0.3042025990888537, 0.001645899825211456],
[157.8260110381781, 361.1182528999441, 0, 1, 0.3041290211794246, 0, 0.00276917600251315, 0.04822829775401336, 0.6958709788205754, 1, 0.001645228492599611],
[157.6950573770327, 361.2492065610894, 1, 0, 0.303876674886681, 0.006341352840305593, 0, -0.1104417533114398, 1, 0.303876674886681, 0.001644763769439155],
[157.8641938722289, 361.0800700658933, 0, 1, 0.3042025990888537, 0, 0.002769468832266236, 0.0482333977117301, 0.6957974009111463, 1, 0.001645466730429417],
[157.8641938722289, 361.0800700658933, 0, 1, 0.3042025990888537, 0, 0.002769468832266236, 0.0482333977117301, 0.6957974009111463, 1, 0.001645714409784544],
[157.8641938722289, 361.0800700658933, 1, 0, 0.3042025990888537, 0.006334558682821854, 0, -0.1103234254587443, 1, 0.3042025990888537, 0.001650896644650691],
[157.8641938722289, 361.0800700658933, 1, 0, 0.3042025990888537, 0.006334558682821854, 0, -0.1103234254587443, 1, 0.3042025990888537, 0.00164498498972145],
[157.8641938722289, 361.0800700658933, 1, 0, 0.3042025990888537, 0.006334558682821854, 0, -0.1103234254587443, 1, 0.3042025990888537, 0.001644743421710813],
[157.8641938722289, 361.0800700658933, 0, 0, 0.3042025990888537, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0008205350222351011],
[157.6950573770327, 361.2492065610894, 1, 0, 0.303876674886681, 0.006341352840305593, 0, -0.1104417533114398, 1, 0.303876674886681, 0.001644763769372155],
[157.8641938722289, 361.0800700658933, 1, 0, 0.3042025990888537, 0.006334558682821854, 0, -0.1103234254587443, 1, 0.3042025990888537, 0.001645080853450734],
[157.8641938722289, 361.0942823915785, 0, 1, 0.3041942681209434, 0, 0.002769359828621097, 0.04823149929131579, 0.6958057318790566, 1, 0.00164500114559362],
[157.8641938722289, 361.0800700658933, 0, 0, 0.3042025990888537, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005967442600223048],
[157.7442351456088, 361.2000287925134, 1, 0, 0.3039714399163643, 0.006339375883225978, 0, -0.1104073223924242, 1, 0.3039714399163642, 0.001644951190636139],
[158.4861368547937, 360.4581270833284, 0.5, 1.5, 0.305401076508847, 0.003154850070313115, 0.004161371008991676, 0.01752968806684151, 0.694598923491153, 0.5175323354849313, 0.00331504815026541],
[160.2024668626212, 358.741797075501, 0, 0, 0.3087084259239897, 0, 0, 0, 1, 1, 0.001053600455431188],
[159.3883180100222, 359.4020068727835, 0.5, 1.5, 0.3072307064439336, 0.003136992762346362, 0.004173599399323751, 0.01805366415733792, 0.6927692935560663, 0.5200707059058288, 0.002252163089896896],
[158.3641938722289, 360.5800700658933, 0, 1, 0.3051660936965513, 0, 0.002773309128863549, 0.04830028077282512, 0.6948339063034487, 1, 0.001645340659128687],
[158.033330367425, 360.9109335706971, 1, 0, 0.3045285232910265, 0.006327779068345998, 0, -0.1102053508887992, 1, 0.3045285232910264, 0.001645250647819864],
[157.8641938722289, 361.0179269967819, 0, 1, 0.3042390314159252, 0, 0.002769945549016778, 0.04824170026720821, 0.6957609685840748, 1, 0.001646687997614642],
[158.2024668626212, 360.741797075501, 0, 1, 0.3048544474931992, 0, 0.002772065804702709, 0.04827862689175028, 0.6951455525068008, 1, 0.001658670735463124],
[158.033330367425, 360.9109335706971, 1, 0, 0.3045285232910265, 0.006327779068345998, 0, -0.1102053508887992, 1, 0.3045285232910264, 0.001648363257428823],
[157.8641938722289, 361.0800700658933, 0, 1, 0.3042025990888537, 0, 0.002769468832266236, 0.0482333977117301, 0.6957974009111463, 1, 0.00164495155226131],
[157.8641938722289, 361.0800700658933, 1, 0, 0.3042025990888537, 0.006334558682821854, 0, -0.1103234254587443, 1, 0.3042025990888537, 0.001645139955491932],
[158.2349253211027, 360.7093386170195, 0, 1, 0.3049169945926414, 0, 0.002772315249264291, 0.04828297124782522, 0.6950830054073587, 1, 0.001645467523156246],
[157.8641938722289, 361.0800700658933, 1, 0, 0.3042025990888537, 0.006334558682821854, 0, -0.1103234254587443, 1, 0.3042025990888537, 0.001644645568605897],
[157.8641938722289, 361.0800700658933, 1, 0, 0.3042025990888537, 0.006334558682821854, 0, -0.1103234254587443, 1, 0.3042025990888537, 0.001644745659347726],
[157.5657888259065, 361.1711557829687, 1, 0, 0.3037489241193534, 0.006346555349682501, 0, -0.1105323608318971, 1, 0.3037489241193534, 0.001644394261132697],
[157.837413778488, 361.2760318700152, 0, 1, 0.3040518697821618, 0, 0.002767966628795883, 0.04820723515789115, 0.6959481302178383, 1, 0.001645327475195289],
[157.8641938722289, 361.0418872318425, 0, 1, 0.304224983327123, 0, 0.002769761723957119, 0.04823849874816289, 0.695775016672877, 1, 0.00164515334936041],
[157.9422446503496, 360.8328375773914, 0, 1, 0.3044522569821758, 0, 0.002771366394239327, 0.04826644587615226, 0.6955477430178242, 1, 0.00164734342070871],
[157.6950573770327, 361.2492065610894, 1, 0, 0.303876674886681, 0.006341352840305593, 0, -0.1104417533114398, 1, 0.303876674886681, 0.001644981265114744],
[157.8260110381781, 361.1182528999441, 0, 1, 0.3041290211794246, 0, 0.00276917600251315, 0.04822829775401336, 0.6958709788205754, 1, 0.001645668528819137],
[157.8641938722289, 361.0800700658933, 0, 1, 0.3042025990888537, 0, 0.002769468832266236, 0.0482333977117301, 0.6957974009111463, 1, 0.001645135648211076]
],
"NAMES": [
["Node397"],
["Node405"],
["Node422"],
["Node426"],
["Node267"],
["Node275"],
["Node297"],
["Node300"],
["Node329"],
["Node318"],
["Node344"],
["Node368"],
["Node166"],
["Node138"],
["Node143"],
["Node150"],
["Node156"],
["Node155"],
["Node148"],
["Node161"],
["Node193"],
["Node221"],
["Node220"],
["Node234"],
["Node228"],
["Node231"],
["Node239"],
["Node242"],
["Node52"],
["Node49"],
["Node46"],
["Node42"],
["Node82"],
["Node15"],
["Node106"]
],
"RESOLVED": [
[157.6950573770327, 361.0800700658933, 1, 0, 0.3039757479398082, 0.006341352840305593, 0, -0.1104417533114398, 1, 0.3039757479398082, 0.001645220962649769],
[157.8641938722289, 361.0800700658933, 1, 0, 0.3042025990888537, 0.006334558682821854, 0, -0.1103234254587443, 1, 0.3042025990888537, 0.001645899825211456],
[157.8260110381781, 361.1182528999441, 0, 1, 0.3041290211794246, 0, 0.00276917600251315, 0.04822829775401336, 0.6958709788205754, 1, 0.001645228492599611],
[157.6950573770327, 361.2492065610894, 1, 0, 0.303876674886681, 0.006341352840305593, 0, -0.1104417533114398, 1, 0.303876674886681, 0.001644763769439155],
[157.8641938722289, 361.0800700658933, 0, 1, 0.3042025990888537, 0, 0.002769468832266236, 0.0482333977117301, 0.6957974009111463, 1, 0.001645466730429417],
[157.8641938722289, 361.0800700658933, 0, 1, 0.3042025990888537, 0, 0.002769468832266236, 0.0482333977117301, 0.6957974009111463, 1, 0.001645714409784544],
[157.8641938722289, 361.0800700658933, 1, 0, 0.3042025990888537, 0.006334558682821854, 0, -0.1103234254587443, 1, 0.3042025990888537, 0.001650896644650691],
[157.8641938722289, 361.0800700658933, 1, 0, 0.3042025990888537, 0.006334558682821854, 0, -0.1103234254587443, 1, 0.3042025990888537, 0.00164498498972145],
[157.8641938722289, 361.0800700658933, 1, 0, 0.3042025990888537, 0.006334558682821854, 0, -0.1103234254587443, 1, 0.3042025990888537, 0.001644743421710813],
[157.8641938722289, 361.0800700658933, 0, 0, 0.3042025990888537, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0008205350222351011],
[157.6950573770327, 361.2492065610894, 1, 0, 0.303876674886681, 0.006341352840305593, 0, -0.1104417533114398, 1, 0.303876674886681, 0.001644763769372155],
[157.8641938722289, 361.0800700658933, 1, 0, 0.3042025990888537, 0.006334558682821854, 0, -0.1103234254587443, 1, 0.3042025990888537, 0.001645080853450734],
[157.8641938722289, 361.0942823915785, 0, 1, 0.3041942681209434, 0, 0.002769359828621097, 0.04823149929131579, 0.6958057318790566, 1, 0.00164500114559362],
[157.8641938722289, 361.0800700658933, 0, 0, 0.3042025990888537, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005967442600223048],
[157.7442351456088, 361.2000287925134, 1, 0, 0.3039714399163643, 0.006339375883225978, 0, -0.1104073223924242, 1, 0.3039714399163642, 0.001644951190636139],
[158.4861368547937, 360.4581270833284, 0.5, 1.5, 0.305401076508847, 0.003154850070313115, 0.004161371008991676, 0.01752968806684151, 0.694598923491153, 0.5175323354849313, 0.00331504815026541],
[160.2024668626212, 358.741797075501, 0, 0, 0.3087084259239897, 0, 0, 0, 1, 1, 0.001053600455431188],
[159.3883180100222, 359.4020068727835, 0.5, 1.5, 0.3072307064439336, 0.003136992762346362, 0.004173599399323751, 0.01805366415733792, 0.6927692935560663, 0.5200707059058288, 0.002252163089896896],
[158.3641938722289, 360.5800700658933, 0, 1, 0.3051660936965513, 0, 0.002773309128863549, 0.04830028077282512, 0.6948339063034487, 1, 0.001645340659128687],
[158.033330367425, 360.9109335706971, 1, 0, 0.3045285232910265, 0.006327779068345998, 0, -0.1102053508887992, 1, 0.3045285232910264, 0.001645250647819864],
[157.8641938722289, 361.0179269967819, 0, 1, 0.3042390314159252, 0, 0.002769945549016778, 0.04824170026720821, 0.6957609685840748, 1, 0.001646687997614642],
[158.2024668626212, 360.741797075501, 0, 1, 0.3048544474931992, 0, 0.002772065804702709, 0.04827862689175028, 0.6951455525068008, 1, 0.001658670735463124],
[158.033330367425, 360.9109335706971, 1, 0, 0.3045285232910265, 0.006327779068345998, 0, -0.1102053508887992, 1, 0.3045285232910264, 0.001648363257428823],
[157.8641938722289, 361.0800700658933, 0, 1, 0.3042025990888537, 0, 0.002769468832266236, 0.0482333977117301, 0.6957974009111463, 1, 0.00164495155226131],
[157.8641938722289, 361.0800700658933, 1, 0, 0.3042025990888537, 0.006334558682821854, 0, -0.1103234254587443, 1, 0.3042025990888537, 0.001645139955491932],
[158.2349253211027, 360.7093386170195, 0, 1, 0.3049169945926414, 0, 0.002772315249264291, 0.04828297124782522, 0.6950830054073587, 1, 0.001645467523156246],
[157.8641938722289, 361.0800700658933, 1, 0, 0.3042025990888537, 0.006334558682821854, 0, -0.1103234254587443, 1, 0.3042025990888537, 0.001644645568605897],
[157.8641938722289, 361.0800700658933, 1, 0, 0.3042025990888537, 0.006334558682821854, 0, -0.1103234254587443, 1, 0.3042025990888537, 0.001644745659347726],
[157.5657888259065, 361.1711557829687, 1, 0, 0.3037489241193534, 0.006346555349682501, 0, -0.1105323608318971, 1, 0.3037489241193534, 0.001644394261132697],
[157.837413778488, 361.2760318700152, 0, 1, 0.3040518697821618, 0, 0.002767966628795883, 0.04820723515789115, 0.6959481302178383, 1, 0.001645327475195289],
[157.8641938722289, 361.0418872318425, 0, 1, 0.304224983327123, 0, 0.002769761723957119, 0.04823849874816289, 0.695775016672877, 1, 0.00164515334936041],
[157.9422446503496, 360.8328375773914, 0, 1, 0.3044522569821758, 0, 0.002771366394239327, 0.04826644587615226, 0.6955477430178242, 1, 0.00164734342070871],
[157.6950573770327, 361.2492065610894, 1, 0, 0.303876674886681, 0.006341352840305593, 0, -0.1104417533114398, 1, 0.303876674886681, 0.001644981265114744],
[157.8260110381781, 361.1182528999441, 0, 1, 0.3041290211794246, 0, 0.00276917600251315, 0.04822829775401336, 0.6958709788205754, 1, 0.001645668528819137],
[157.8641938722289, 361.0800700658933, 0, 1, 0.3042025990888537, 0, 0.002769468832266236, 0.0482333977117301, 0.6957974009111463, 1, 0.001645135648211076]
]
},
"by-site":{
"AVERAGED": [
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.6389215289877637, 2.022715050249945, 0, 0, 0.2400483724831999, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9187893491836843, 2.081210650816316, 1, 0, 0.3062631163945614, 1.088388759500172, 0, -18.95550774586284, 1, 0.3062631163945615, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -17.41611862526761, 1, 0.3333333333333333, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9187893491834869, 2.081210650816514, 1, 0, 0.3062631163944956, 1.088388759500405, 0, -18.95550774586691, 1, 0.3062631163944955, 0.05741807468796078],
[0.9187887085062003, 2.0812112914938, 1, 0, 0.3062629028354001, 1.0883895184409, 0, -18.9555209636646, 1, 0.3062629028354, 0.05741807468796078],
[0.6389215289877637, 2.022715050249945, 0, 0, 0.2400483724831999, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.7414628977475198, 2.044459819713028, 0, 0, 0.2661462549195857, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9236343318984312, 2.075271646442569, 0, 1, 0.3079904266986681, 0, 0.4818646280424061, 8.392211523306994, 0.6920095733013318, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.7414628977475198, 1.334902770354048, 0, 0, 0.357096492750934, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -17.41611862526761, 1, 0.3333333333333333, 0.05741807468796078],
[0.5853613415061268, 2.414638658493872, 0, 0, 0.195120447168709, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[1.224282870493891, 1.629420575622951, 0, 0, 0.429015450838042, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[1.326824239253647, 1.25853710225248, 0, 0, 0.5132064976575743, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.6389215289877637, 1.437444139113804, 0, 0, 0.3077114685545408, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -17.41611862526761, 1, 0.3333333333333333, 0.05741807468796078],
[0.9236343318984312, 2.076365668101569, 0, 0, 0.3078781106328104, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9989059283709883, 2.00109407162901, 0, 1, 0.3329686427903296, 0, 0.4997266316350336, 8.703298296761151, 0.6670313572096704, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.5853613415061268, 2.414638658493872, 0, 0, 0.195120447168709, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.661636579237709, 0, 0, 0.3757086928398012, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9236343318984312, 2.076365668101569, 0, 0, 0.3078781106328104, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.6389215289877637, 2.022715050249945, 0, 0, 0.2400483724831999, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.6381541395505606, 2.028330378561856, 0, 1, 0.2393241495368984, 0, 0.4930163303618361, 8.586430893775859, 0.7606758504631016, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -17.41611862526761, 1, 0.3333333333333333, 0.05741807468796078],
[1.326824239253647, 1.25853710225248, 0, 0, 0.5132064976575743, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.923634331898431, 0, 0, 0.3420400386907005, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.6389215289877637, 2.022715050249945, 0, 0, 0.2400483724831999, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.7414628977475198, 1.334902770354048, 0, 0, 0.357096492750934, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.5853613415061268, 2.414638658493872, 0, 0, 0.195120447168709, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.7414628977475198, 2.044459819713028, 0, 0, 0.2661462549195857, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.5853613415061268, 2.414638658493872, 0, 0, 0.195120447168709, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9989056357483248, 2.001094364251674, 0, 1, 0.3329685452494417, 0, 0.4997265585593503, 8.703297024066382, 0.6670314547505583, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.5853613415061268, 2.268342104610714, 0, 0, 0.205123395811381, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[1.326824239253647, 1.25853710225248, 0, 0, 0.5132064976575743, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.7414628977475198, 1.920173681490188, 0, 0, 0.278574056101932, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.7414628977475198, 1.920173681490188, 0, 0, 0.278574056101932, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.7414628977475198, 2.044459819713028, 0, 0, 0.2661462549195857, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[1.224282870493891, 1.629420575622951, 0, 0, 0.429015450838042, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.7414628977475198, 1.334902770354048, 0, 0, 0.357096492750934, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.7414628977475198, 1.920173681490188, 0, 0, 0.278574056101932, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.6389215289877637, 1.437444139113804, 0, 0, 0.3077114685545408, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.5853613415061268, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2264137442254471, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -17.41611862526761, 1, 0.3333333333333333, 0.05741807468796078],
[0.9236343318984312, 2.076365668101569, 0, 0, 0.3078781106328104, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9681386912484519, 2.031861308751547, 1, 0, 0.3227128970828174, 1.032909859960727, 0, -17.98928065028457, 1, 0.3227128970828174, 0.05741807468796078],
[0.7414628977475198, 2.044459819713028, 0, 0, 0.2661462549195857, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.952058983268949, 0, 0, 0.3387466191114699, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.587600643964753, 2.407545477199788, 0, 1, 0.1961842995948018, 0, 0.4153607935843015, 7.233972853349486, 0.8038157004051982, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[1.047941016731051, 1.028424651370518, 0, 0, 0.504699645553853, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.5853613415061268, 2.414638658493872, 0, 0, 0.195120447168709, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.635322786812543, 2.358639116989329, 1.5, 1.5, 0.2122013596785519, 2.361004565137039, 0.6359599436791612, -30.04358176119025, 0.9372335261875712, 0.3135243877561174, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.1403122064622371, 3.106739397767491, 0, 1, 0.04321218864506535, 0, 0.3218808763678737, 6.067565667321836, 0.9567878113549346, 1, 0.05304942608226418],
[0.9964574004524868, 2.059620499844316, 0.5, 1.5, 0.3260575917766075, 0.5017775970883976, 0.7282895077580472, 4.018699965783109, 0.6739424082233925, 0.5458016303980542, 0.05636447423252959],
[0.6389215289877637, 2.022715050249945, 0, 0, 0.2400483724831999, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[1.923634331898431, 1.076365668101568, 0, 0, 0.6412114439661439, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 8.708059312633806, 0.6666666666666667, 1, 0.05741807468796078],
[0.7414628977475198, 1.920173681490188, 0, 0, 0.278574056101932, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -17.41611862526761, 1, 0.3333333333333333, 0.05741807468796078],
[0.7414628977475198, 1.920173681490188, 0, 0, 0.278574056101932, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -17.41611862526761, 1, 0.3333333333333333, 0.05741807468796078],
[0.7316578953892844, 2.268342104610714, 0, 0, 0.2438859651297616, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.6389215289877637, 1.437444139113804, 0, 0, 0.3077114685545408, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9236343318984312, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3159199226185989, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.5853613415061268, 2.414638658493872, 0, 0, 0.195120447168709, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.6389215289877637, 2.022715050249945, 0, 0, 0.2400483724831999, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -17.41611862526761, 1, 0.3333333333333333, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.5853613415061268, 2.414638658493872, 0, 0, 0.195120447168709, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.7414628977475198, 1.920173681490188, 0, 0, 0.278574056101932, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.2691613971674457, 2.730838602832554, 0, 1, 0.08972046572248193, 0, 0.3661878805150744, 6.377571566185854, 0.9102795342775181, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 8.708059312633806, 0.6666666666666667, 1, 0.05741807468796078],
[0.9187880024288684, 2.000407176523435, 1, 1, 0.3147401753241524, 1.088390354854921, 0.4998982265890132, -10.24924871591525, 0.9009386220369218, 0.5304189726852266, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.6389215289877637, 2.147001188472785, 0, 0, 0.2293392867588802, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.6389215289877637, 2.147001188472785, 0, 0, 0.2293392867588802, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9236343318984312, 2.076365668101569, 0, 0, 0.3078781106328104, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.5853613415061268, 2.414638658493872, 0, 0, 0.195120447168709, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.7414628977475198, 2.044459819713028, 0, 0, 0.2661462549195857, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.661636579237709, 0, 0, 0.3757086928398012, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.5853613415061268, 2.414638658493872, 0, 0, 0.195120447168709, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.5999888242020773, 2.400011175797922, 1, 1, 0.1999962747340258, 1.66669771112803, 0.4166647264330067, -21.77072274694584, 0.9600014900925121, 0.3599940395605636, 0.05741807468796078],
[0.9511096119049052, 2.059493847419034, 0, 0, 0.3159199226185989, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05575940395249766],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 8.708059312633806, 0.6666666666666667, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.5853613415061268, 2.414638658493872, 0, 1, 0.195120447168709, 0, 0.4141406402495638, 7.212722518130677, 0.804879552831291, 1, 0.05741807468796078],
[1.915088320066229, 1.078974268812129, 1, 0, 0.639628686180426, 0.5221691289754288, 0, -9.094159492688727, 1, 0.639628686180426, 0.05741807468796078],
[0.6389215289877637, 2.145218992768787, 0, 1, 0.2294860923846831, 0, 0.4661528745414108, 8.118573760522697, 0.7705139076153169, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.923634331898431, 0, 0, 0.3420400386907005, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.5853613415061268, 2.414638658493872, 0, 0, 0.195120447168709, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9236343318984312, 2.076365668101569, 0, 0, 0.3078781106328104, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[1.326824239253647, 1.25853710225248, 0, 0, 0.5132064976575743, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9236343318984312, 2.076365668101569, 0, 0, 0.3078781106328104, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.6389215289877637, 2.022715050249945, 0, 0, 0.2400483724831999, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.5853613415061268, 2.414638658493872, 0, 0, 0.195120447168709, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.5853613415061268, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2264137442254471, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.7414628977475198, 1.920173681490188, 0, 0, 0.278574056101932, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.5853613415061268, 2.414638658493872, 0, 0, 0.195120447168709, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.5853613415061268, 2.414638658493872, 0, 0, 0.195120447168709, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.7414628977475198, 1.334902770354048, 0, 0, 0.357096492750934, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.7414628977475198, 1.920173681490188, 0, 0, 0.278574056101932, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9236343318984312, 2.076365668101569, 0, 0, 0.3078781106328104, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0, 1.722156942024472, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9236343318984312, 2.076365668101569, 0, 0, 0.3078781106328104, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.7414628977475198, 2.044459819713028, 0, 0, 0.2661462549195857, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.5853613415061268, 2.414638658493872, 0, 0, 0.195120447168709, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9236343318984312, 2.076365668101569, 0, 0, 0.3078781106328104, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.5853613415061268, 2.414638658493872, 0, 0, 0.195120447168709, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.7414628977475198, 1.920173681490188, 0, 0, 0.278574056101932, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.6389215289877637, 2.022715050249945, 0, 0, 0.2400483724831999, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9236343318984312, 2.076365668101569, 0, 0, 0.3078781106328104, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.661636579237709, 0, 0, 0.3757086928398012, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078]
],
"RESOLVED": [
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.6389215289877637, 2.022715050249945, 0, 0, 0.2400483724831999, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9187893491836843, 2.081210650816316, 1, 0, 0.3062631163945614, 1.088388759500172, 0, -18.95550774586284, 1, 0.3062631163945615, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -17.41611862526761, 1, 0.3333333333333333, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9187893491834869, 2.081210650816514, 1, 0, 0.3062631163944956, 1.088388759500405, 0, -18.95550774586691, 1, 0.3062631163944955, 0.05741807468796078],
[0.9187887085062003, 2.0812112914938, 1, 0, 0.3062629028354001, 1.0883895184409, 0, -18.9555209636646, 1, 0.3062629028354, 0.05741807468796078],
[0.6389215289877637, 2.022715050249945, 0, 0, 0.2400483724831999, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.7414628977475198, 2.044459819713028, 0, 0, 0.2661462549195857, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9236343318984312, 2.075271646442569, 0, 1, 0.3079904266986681, 0, 0.4818646280424061, 8.392211523306994, 0.6920095733013318, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.7414628977475198, 1.334902770354048, 0, 0, 0.357096492750934, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -17.41611862526761, 1, 0.3333333333333333, 0.05741807468796078],
[0.5853613415061268, 2.414638658493872, 0, 0, 0.195120447168709, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[1.224282870493891, 1.629420575622951, 0, 0, 0.429015450838042, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[1.326824239253647, 1.25853710225248, 0, 0, 0.5132064976575743, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.6389215289877637, 1.437444139113804, 0, 0, 0.3077114685545408, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -17.41611862526761, 1, 0.3333333333333333, 0.05741807468796078],
[0.9236343318984312, 2.076365668101569, 0, 0, 0.3078781106328104, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9989059283709883, 2.00109407162901, 0, 1, 0.3329686427903296, 0, 0.4997266316350336, 8.703298296761151, 0.6670313572096704, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.5853613415061268, 2.414638658493872, 0, 0, 0.195120447168709, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.661636579237709, 0, 0, 0.3757086928398012, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9236343318984312, 2.076365668101569, 0, 0, 0.3078781106328104, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.6389215289877637, 2.022715050249945, 0, 0, 0.2400483724831999, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.6381541395505606, 2.028330378561856, 0, 1, 0.2393241495368984, 0, 0.4930163303618361, 8.586430893775859, 0.7606758504631016, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -17.41611862526761, 1, 0.3333333333333333, 0.05741807468796078],
[1.326824239253647, 1.25853710225248, 0, 0, 0.5132064976575743, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.923634331898431, 0, 0, 0.3420400386907005, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.6389215289877637, 2.022715050249945, 0, 0, 0.2400483724831999, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.7414628977475198, 1.334902770354048, 0, 0, 0.357096492750934, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.5853613415061268, 2.414638658493872, 0, 0, 0.195120447168709, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.7414628977475198, 2.044459819713028, 0, 0, 0.2661462549195857, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.5853613415061268, 2.414638658493872, 0, 0, 0.195120447168709, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9989056357483248, 2.001094364251674, 0, 1, 0.3329685452494417, 0, 0.4997265585593503, 8.703297024066382, 0.6670314547505583, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.5853613415061268, 2.268342104610714, 0, 0, 0.205123395811381, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[1.326824239253647, 1.25853710225248, 0, 0, 0.5132064976575743, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.7414628977475198, 1.920173681490188, 0, 0, 0.278574056101932, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.7414628977475198, 1.920173681490188, 0, 0, 0.278574056101932, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.7414628977475198, 2.044459819713028, 0, 0, 0.2661462549195857, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[1.224282870493891, 1.629420575622951, 0, 0, 0.429015450838042, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.7414628977475198, 1.334902770354048, 0, 0, 0.357096492750934, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.7414628977475198, 1.920173681490188, 0, 0, 0.278574056101932, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.6389215289877637, 1.437444139113804, 0, 0, 0.3077114685545408, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.5853613415061268, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2264137442254471, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -17.41611862526761, 1, 0.3333333333333333, 0.05741807468796078],
[0.9236343318984312, 2.076365668101569, 0, 0, 0.3078781106328104, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9681386912484519, 2.031861308751547, 1, 0, 0.3227128970828174, 1.032909859960727, 0, -17.98928065028457, 1, 0.3227128970828174, 0.05741807468796078],
[0.7414628977475198, 2.044459819713028, 0, 0, 0.2661462549195857, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.952058983268949, 0, 0, 0.3387466191114699, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.587600643964753, 2.407545477199788, 0, 1, 0.1961842995948018, 0, 0.4153607935843015, 7.233972853349486, 0.8038157004051982, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[1.047941016731051, 1.028424651370518, 0, 0, 0.504699645553853, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.5853613415061268, 2.414638658493872, 0, 0, 0.195120447168709, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.635322786812543, 2.358639116989329, 1.5, 1.5, 0.2122013596785519, 2.361004565137039, 0.6359599436791612, -30.04358176119025, 0.9372335261875712, 0.3135243877561174, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.1403122064622371, 3.106739397767491, 0, 1, 0.04321218864506535, 0, 0.3218808763678737, 6.067565667321836, 0.9567878113549346, 1, 0.05304942608226418],
[0.9964574004524868, 2.059620499844316, 0.5, 1.5, 0.3260575917766075, 0.5017775970883976, 0.7282895077580472, 4.018699965783109, 0.6739424082233925, 0.5458016303980542, 0.05636447423252959],
[0.6389215289877637, 2.022715050249945, 0, 0, 0.2400483724831999, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[1.923634331898431, 1.076365668101568, 0, 0, 0.6412114439661439, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 8.708059312633806, 0.6666666666666667, 1, 0.05741807468796078],
[0.7414628977475198, 1.920173681490188, 0, 0, 0.278574056101932, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -17.41611862526761, 1, 0.3333333333333333, 0.05741807468796078],
[0.7414628977475198, 1.920173681490188, 0, 0, 0.278574056101932, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -17.41611862526761, 1, 0.3333333333333333, 0.05741807468796078],
[0.7316578953892844, 2.268342104610714, 0, 0, 0.2438859651297616, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.6389215289877637, 1.437444139113804, 0, 0, 0.3077114685545408, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9236343318984312, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3159199226185989, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.5853613415061268, 2.414638658493872, 0, 0, 0.195120447168709, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.6389215289877637, 2.022715050249945, 0, 0, 0.2400483724831999, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -17.41611862526761, 1, 0.3333333333333333, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.5853613415061268, 2.414638658493872, 0, 0, 0.195120447168709, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.7414628977475198, 1.920173681490188, 0, 0, 0.278574056101932, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.2691613971674457, 2.730838602832554, 0, 1, 0.08972046572248193, 0, 0.3661878805150744, 6.377571566185854, 0.9102795342775181, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 8.708059312633806, 0.6666666666666667, 1, 0.05741807468796078],
[0.9187880024288684, 2.000407176523435, 1, 1, 0.3147401753241524, 1.088390354854921, 0.4998982265890132, -10.24924871591525, 0.9009386220369218, 0.5304189726852266, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.6389215289877637, 2.147001188472785, 0, 0, 0.2293392867588802, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.6389215289877637, 2.147001188472785, 0, 0, 0.2293392867588802, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9236343318984312, 2.076365668101569, 0, 0, 0.3078781106328104, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.5853613415061268, 2.414638658493872, 0, 0, 0.195120447168709, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.7414628977475198, 2.044459819713028, 0, 0, 0.2661462549195857, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.661636579237709, 0, 0, 0.3757086928398012, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.5853613415061268, 2.414638658493872, 0, 0, 0.195120447168709, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.5999888242020773, 2.400011175797922, 1, 1, 0.1999962747340258, 1.66669771112803, 0.4166647264330067, -21.77072274694584, 0.9600014900925121, 0.3599940395605636, 0.05741807468796078],
[0.9511096119049052, 2.059493847419034, 0, 0, 0.3159199226185989, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05575940395249766],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 8.708059312633806, 0.6666666666666667, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.5853613415061268, 2.414638658493872, 0, 1, 0.195120447168709, 0, 0.4141406402495638, 7.212722518130677, 0.804879552831291, 1, 0.05741807468796078],
[1.915088320066229, 1.078974268812129, 1, 0, 0.639628686180426, 0.5221691289754288, 0, -9.094159492688727, 1, 0.639628686180426, 0.05741807468796078],
[0.6389215289877637, 2.145218992768787, 0, 1, 0.2294860923846831, 0, 0.4661528745414108, 8.118573760522697, 0.7705139076153169, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.923634331898431, 0, 0, 0.3420400386907005, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.5853613415061268, 2.414638658493872, 0, 0, 0.195120447168709, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9236343318984312, 2.076365668101569, 0, 0, 0.3078781106328104, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[1.326824239253647, 1.25853710225248, 0, 0, 0.5132064976575743, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9236343318984312, 2.076365668101569, 0, 0, 0.3078781106328104, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.6389215289877637, 2.022715050249945, 0, 0, 0.2400483724831999, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.5853613415061268, 2.414638658493872, 0, 0, 0.195120447168709, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.5853613415061268, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2264137442254471, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.7414628977475198, 1.920173681490188, 0, 0, 0.278574056101932, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.5853613415061268, 2.414638658493872, 0, 0, 0.195120447168709, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.5853613415061268, 2.414638658493872, 0, 0, 0.195120447168709, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.7414628977475198, 1.334902770354048, 0, 0, 0.357096492750934, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.7414628977475198, 1.920173681490188, 0, 0, 0.278574056101932, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9236343318984312, 2.076365668101569, 0, 0, 0.3078781106328104, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0, 1.722156942024472, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9236343318984312, 2.076365668101569, 0, 0, 0.3078781106328104, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.7414628977475198, 2.044459819713028, 0, 0, 0.2661462549195857, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.5853613415061268, 2.414638658493872, 0, 0, 0.195120447168709, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9236343318984312, 2.076365668101569, 0, 0, 0.3078781106328104, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.5853613415061268, 2.414638658493872, 0, 0, 0.195120447168709, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.7414628977475198, 1.920173681490188, 0, 0, 0.278574056101932, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.6389215289877637, 2.022715050249945, 0, 0, 0.2400483724831999, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9236343318984312, 2.076365668101569, 0, 0, 0.3078781106328104, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.661636579237709, 0, 0, 0.3757086928398012, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05741807468796078]
]
}
}
},
"headers": [
["ES", "Expected synonymous sites"],
["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
]
},
"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
},
"branch attributes":{
"0":{
"Node106":{
"Global MG94xREV":0.001645135648211076,
"Nucleotide GTR":0.00185372289655214,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "V", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GTT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node138":{
"Global MG94xREV":0.0005967442600223048,
"Nucleotide GTR":0.0006724056459370336,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node143":{
"Global MG94xREV":0.001644951190636139,
"Nucleotide GTR":0.00185351505154527,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATT", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node148":{
"Global MG94xREV":0.001645340659128687,
"Nucleotide GTR":0.001853953900866242,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "V", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "GTG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node15":{
"Global MG94xREV":0.001645668528819137,
"Nucleotide GTR":0.001854323341254292,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "D", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GAC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node150":{
"Global MG94xREV":0.00331504815026541,
"Nucleotide GTR":0.003735364111769199,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "-", "M", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "---", "ATG", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node155":{
"Global MG94xREV":0.002252163089896896,
"Nucleotide GTR":0.002537715531878035,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "L", "V", "V", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CTG", "GTT", "GTG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node156":{
"Global MG94xREV":0.001053600455431188,
"Nucleotide GTR":0.001187186777074791,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "L", "V", "-", "-", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CTG", "GTT", "---", "---", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node161":{
"Global MG94xREV":0.001645250647819864,
"Nucleotide GTR":0.001853852476996244,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAC", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node166":{
"Global MG94xREV":0.00164500114559362,
"Nucleotide GTR":0.00185357134030698,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "C", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TGC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node193":{
"Global MG94xREV":0.001646687997614642,
"Nucleotide GTR":0.001855472068807917,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "E", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "GAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node220":{
"Global MG94xREV":0.001648363257428823,
"Nucleotide GTR":0.001857359735322586,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGC", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node221":{
"Global MG94xREV":0.001658670735463124,
"Nucleotide GTR":0.001868974101626466,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "N", "-", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AAC", "---", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node228":{
"Global MG94xREV":0.001645139955491932,
"Nucleotide GTR":0.001853727749954443,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTT", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node231":{
"Global MG94xREV":0.001645467523156246,
"Nucleotide GTR":0.001854096850022375,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "T", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ACA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node234":{
"Global MG94xREV":0.00164495155226131,
"Nucleotide GTR":0.001853515459021007,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "V", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GTA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node239":{
"Global MG94xREV":0.001644645568605897,
"Nucleotide GTR":0.001853170679605018,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTT", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node242":{
"Global MG94xREV":0.001644745659347726,
"Nucleotide GTR":0.001853283460882396,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTT", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node267":{
"Global MG94xREV":0.001645466730429417,
"Nucleotide GTR":0.00185409595678547,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "N", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "AAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node275":{
"Global MG94xREV":0.001645714409784544,
"Nucleotide GTR":0.001854375039481234,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "V", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GTC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node283":{
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node297":{
"Global MG94xREV":0.001650896644650691,
"Nucleotide GTR":0.001860214331479516,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTA", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node300":{
"Global MG94xREV":0.00164498498972145,
"Nucleotide GTR":0.001853553136026871,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGT", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node318":{
"Global MG94xREV":0.0008205350222351011,
"Nucleotide GTR":0.0009245709068392695,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node329":{
"Global MG94xREV":0.001644743421710813,
"Nucleotide GTR":0.00185328093953482,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTT", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node344":{
"Global MG94xREV":0.001644763769372155,
"Nucleotide GTR":0.00185330386708232,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGT", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node368":{
"Global MG94xREV":0.001645080853450734,
"Nucleotide GTR":0.001853661154347497,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGT", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node397":{
"Global MG94xREV":0.001645220962649769,
"Nucleotide GTR":0.001853819028034418,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAT", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node405":{
"Global MG94xREV":0.001645899825211456,
"Nucleotide GTR":0.001854583963786421,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTT", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node42":{
"Global MG94xREV":0.00164734342070871,
"Nucleotide GTR":0.001856210593195083,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "E", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAA", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node422":{
"Global MG94xREV":0.001645228492599611,
"Nucleotide GTR":0.001853827512708888,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "F", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "TTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node426":{
"Global MG94xREV":0.001644763769439155,
"Nucleotide GTR":0.001853303867157814,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTT", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node46":{
"Global MG94xREV":0.00164515334936041,
"Nucleotide GTR":0.001853742842035572,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "Y", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "TAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node49":{
"Global MG94xREV":0.001645327475195289,
"Nucleotide GTR":0.001853939045337926,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "D", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAT", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node52":{
"Global MG94xREV":0.001644394261132697,
"Nucleotide GTR":0.001852887508780987,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "TTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node82":{
"Global MG94xREV":0.001644981265114744,
"Nucleotide GTR":0.001853548939176151,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAT", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406595_Guangdong_20200116_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001891723734721246,
"Nucleotide GTR":0.001854120850299846,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAA", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406595_Guangdong_20200116_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406799_Wuhan_20191231_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001893712394070758,
"Nucleotide GTR":0.001856069979919779,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "F", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "TTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTA", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406799_Wuhan_20191231_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_408483_Shanghai_20200120_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003795256887293868,
"Nucleotide GTR":0.003719816375837015,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "V", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "GTA", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_408483_Shanghai_20200120_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413747_China_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002143905497621779,
"Nucleotide GTR":0.002101289850760767,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413747_China_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413752_China_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002091889899554296,
"Nucleotide GTR":0.002050308196755168,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413752_China_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414934_Shandong_20200121_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001891346648076924,
"Nucleotide GTR":0.001853751259224376,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "G", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GGG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414934_Shandong_20200121_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416650_USA_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001890867610042267,
"Nucleotide GTR":0.001853281743305192,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAT", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416650_USA_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416726_Washington_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001891524655066621,
"Nucleotide GTR":0.001853925727866408,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAG", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416726_Washington_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417067_Washington_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001891634744818814,
"Nucleotide GTR":0.00185403362930106,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "R", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "AGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0]
],
"original name":"epi_isl_417067_Washington_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417094_Washington_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00189165132917987,
"Nucleotide GTR":0.0018540498840052,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "V", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GTT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417094_Washington_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417347_Washington_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00189165132917987,
"Nucleotide GTR":0.0018540498840052,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "F", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "TTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417347_Washington_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003833505728306723,
"Nucleotide GTR":0.00375730492256299,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "Q", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGA", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "CAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418989_Vorst_20200304_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001891058060727095,
"Nucleotide GTR":0.001853468408291848,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "F", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "TTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418989_Vorst_20200304_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419419_Wales_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001891560776708824,
"Nucleotide GTR":0.001853961131497883,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419419_Wales_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1]
]
},
"epi_isl_419442_Wales_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001891651318105658,
"Nucleotide GTR":0.001854049873151115,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "F", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTT", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419442_Wales_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419847_Victoria_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001893653616937617,
"Nucleotide GTR":0.001856012371133635,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "E", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAA", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "TTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419847_Victoria_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419868_Victoria_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00189165021088512,
"Nucleotide GTR":0.00185404878793944,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "D", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAT", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419868_Victoria_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420310_Norway_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001891058060727095,
"Nucleotide GTR":0.001853468408291848,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "C", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "TGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420310_Norway_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420942_Wales_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "L", "V", "-", "-", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CTG", "GTT", "---", "---", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420942_Wales_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421203_Li_ge_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001893406969108628,
"Nucleotide GTR":0.001855770626065884,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "C", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "TGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421203_Li_ge_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421248_Jiangxi_20200123_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTT", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421248_Jiangxi_20200123_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421335_Wisconsin_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001891513834930514,
"Nucleotide GTR":0.00185391512280839,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "V", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GTT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421335_Wisconsin_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421504_Ile_de_France_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001893407394261692,
"Nucleotide GTR":0.001855771042767937,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "D", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GAC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421504_Ile_de_France_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421584_New_Jersey_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001890986638767789,
"Nucleotide GTR":0.001853398406028044,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "A", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GCC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421584_New_Jersey_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422000_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001891917500555585,
"Nucleotide GTR":0.001854310764538867,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATC", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422000_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422072_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001892006490275818,
"Nucleotide GTR":0.001854397985359075,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTC", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422072_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422346_Wales_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001891457124000211,
"Nucleotide GTR":0.001853859539153976,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "A", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "GCA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422346_Wales_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422347_Wales_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001891651318105658,
"Nucleotide GTR":0.001854049873151115,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "I", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "ATT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422347_Wales_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422359_Wales_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001891231952727666,
"Nucleotide GTR":0.001853638843740767,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "I", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAT", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "ATT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422359_Wales_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422885_Noord_Brabant_20200324_null_3":{
"Global MG94xREV":0.00189823051403528,
"Nucleotide GTR":0.00186049829060628,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "I", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "ATT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422885_Noord_Brabant_20200324_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422888_Noord_Brabant_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001892587857541596,
"Nucleotide GTR":0.001854967796452194,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAC", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCG", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422888_Noord_Brabant_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422904_Zuid_Holland_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003785517175935305,
"Nucleotide GTR":0.003710270266342083,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTT", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAC", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTT", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422904_Zuid_Holland_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422919_Zuid_Holland_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001894854537649214,
"Nucleotide GTR":0.001857189420451173,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAC", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGC", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422919_Zuid_Holland_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423012_Washington_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003791169518275395,
"Nucleotide GTR":0.003715810253811409,
"amino-acid": [
["L", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "S", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["TTG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TCA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423012_Washington_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423295_England_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "V", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GTT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423295_England_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423459_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001891670903075671,
"Nucleotide GTR":0.001854069068819378,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTC", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423459_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423762_England_20200324_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001891847183101073,
"Nucleotide GTR":0.001854241844824983,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "C", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "TGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423762_England_20200324_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423844_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001891560776683227,
"Nucleotide GTR":0.001853961131472794,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCA", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423844_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424146_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00189022849955527,
"Nucleotide GTR":0.001852655336786188,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "V", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "C", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GTT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "TGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424146_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424148_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001891703073646339,
"Nucleotide GTR":0.001854100599917046,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "S", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "AGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424148_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424352_Anhui_20200310_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001892006490275818,
"Nucleotide GTR":0.001854397985359075,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAC", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424352_Anhui_20200310_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424451_Reykjavik_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001891560776708824,
"Nucleotide GTR":0.001853961131497883,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "D", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GAT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424451_Reykjavik_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424907_Virginia_20200306_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001891346648076924,
"Nucleotide GTR":0.001853751259224376,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGG", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424907_Virginia_20200306_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425241_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001891094934534328,
"Nucleotide GTR":0.001853504549137135,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "Y", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "TAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425241_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425518_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001893000413758923,
"Nucleotide GTR":0.001855372152051495,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "Y", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "TAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425518_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425559_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001891149574108597,
"Nucleotide GTR":0.001853558102609051,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAT", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425559_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425772_Scotland_20200313_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001891560776710368,
"Nucleotide GTR":0.001853961131499393,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "I", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "ATT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425772_Scotland_20200313_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425778_Scotland_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001892787006714228,
"Nucleotide GTR":0.001855162987021789,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "F", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTT", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425778_Scotland_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426011_Scotland_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001891553401155176,
"Nucleotide GTR":0.001853953902552369,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "C", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "TGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426011_Scotland_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426074_Idaho_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00189226792989303,
"Nucleotide GTR":0.001854654228190135,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAC", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426074_Idaho_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426467_Virginia_20200331_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001893000422930689,
"Nucleotide GTR":0.001855372161040949,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "N", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAT", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426467_Virginia_20200331_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426521_Arizona_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001893127516033886,
"Nucleotide GTR":0.001855496727841188,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "R", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CGC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426521_Arizona_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426628_Louisiana_20200406_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001892047818101804,
"Nucleotide GTR":0.001854438491688012,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTT", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426628_Louisiana_20200406_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426742_Victoria_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001891553029437029,
"Nucleotide GTR":0.001853953538223079,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "V", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GTT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426742_Victoria_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426749_Victoria_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00189142323373634,
"Nucleotide GTR":0.001853826322546439,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAT", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426749_Victoria_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426758_Victoria_20200327_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001891723734721246,
"Nucleotide GTR":0.001854120850299846,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTA", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426758_Victoria_20200327_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426828_Victoria_20200325_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001891723734747592,
"Nucleotide GTR":0.001854120850325668,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "K", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "AAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426828_Victoria_20200325_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426930_Victoria_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "T", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ACA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426930_Victoria_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427053_Victoria_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001891338147939645,
"Nucleotide GTR":0.001853742928049228,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "F", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "TTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427053_Victoria_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427098_Victoria_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001892735616171993,
"Nucleotide GTR":0.001855112617999019,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "E", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "N", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAG", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "AAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427098_Victoria_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427104_Victoria_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001890869026725205,
"Nucleotide GTR":0.001853283131827908,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "L", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "TTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGT", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427104_Victoria_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427154_Victoria_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0018911062132168,
"Nucleotide GTR":0.001853515603626726,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "V", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GTT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427154_Victoria_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427243_Washington_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.005697232966384381,
"Nucleotide GTR":0.005583985778740301,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "P", "N", "D", "D", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CCG", "AAT", "GAT", "GAC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427243_Washington_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427264_Washington_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001926414098220257,
"Nucleotide GTR":0.00188812165342318,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "-", "-", "-", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTT", "---", "---", "---", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427264_Washington_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427303_Rio_de_Janeiro_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001891149575037098,
"Nucleotide GTR":0.001853558103519095,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGT", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427303_Rio_de_Janeiro_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428343_Wisconsin_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001891788182231838,
"Nucleotide GTR":0.001854184016750074,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTG", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428343_Wisconsin_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428390_Connecticut_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001891553401997327,
"Nucleotide GTR":0.00185395390337778,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "L", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CTT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428390_Connecticut_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428453_Guangdong_20200122_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001891524655092298,
"Nucleotide GTR":0.001853925727891573,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "G", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GGG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428453_Guangdong_20200122_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428748_Connecticut_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001891723734721246,
"Nucleotide GTR":0.001854120850299846,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "K", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "AAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428748_Connecticut_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429215_Switzerland_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "V", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "GTG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429215_Switzerland_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429550_Unknown_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001891337644615847,
"Nucleotide GTR":0.001853742434730291,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "M", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "ATG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429550_Unknown_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429725_Luxembourg_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001891839089195172,
"Nucleotide GTR":0.001854233911806322,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "E", "S", "S", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "GAG", "TCA", "TCT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429725_Luxembourg_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429986_Virginia_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001893258971609338,
"Nucleotide GTR":0.0018556255703983,
"amino-acid": [
["M", "E", "R", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGA", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429986_Virginia_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430083_St_Petersburg_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "V", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GTC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430083_St_Petersburg_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430153_Washington_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001891530948931688,
"Nucleotide GTR":0.001853931896624688,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "M", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "ATG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430153_Washington_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430156_Washington_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001206023471846001,
"Nucleotide GTR":0.001182050647279202,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "I", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATA", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430156_Washington_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430330_New_York_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001891560776708824,
"Nucleotide GTR":0.001853961131497883,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "K", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "AAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430330_New_York_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430386_New_York_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001891346648050305,
"Nucleotide GTR":0.001853751259198284,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "G", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GGT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430386_New_York_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430572_Victoria_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001891545748873286,
"Nucleotide GTR":0.001853946402379305,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "H", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CAT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430572_Victoria_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430632_Northern_Territory_20200101_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001891149575038152,
"Nucleotide GTR":0.001853558103520129,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "L", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TTG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430632_Northern_Territory_20200101_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430937_Washington_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001891560776710368,
"Nucleotide GTR":0.001853961131499393,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "K", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "AAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430937_Washington_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432031_Wales_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001892195324262989,
"Nucleotide GTR":0.001854583065784104,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "I", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "ATC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432031_Wales_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432046_Wales_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001891560777866792,
"Nucleotide GTR":0.001853961132632834,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAA", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432046_Wales_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432326_Wales_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001914082069540301,
"Nucleotide GTR":0.001876034755594321,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "L", "V", "-", "-", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "T", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CTG", "GTT", "---", "---", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "ACC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432326_Wales_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432510_England_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00189105806070157,
"Nucleotide GTR":0.00185346840826683,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "S", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "TCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432510_England_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432565_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001897757443517699,
"Nucleotide GTR":0.001860034623584394,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "H", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAC", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432565_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432586_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00189312739758205,
"Nucleotide GTR":0.001855496611743887,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "W", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TGG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432586_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432713_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001891241081185043,
"Nucleotide GTR":0.001853647790746528,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "F", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "TTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432713_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433234_Scotland_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001891279976376288,
"Nucleotide GTR":0.00185368591279561,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "Y", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "TAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433234_Scotland_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433235_Scotland_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001891117491899269,
"Nucleotide GTR":0.001853526658116313,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "S", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "TCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433235_Scotland_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433250_Scotland_20200404_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001891117491899269,
"Nucleotide GTR":0.001853526658116313,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTT", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433250_Scotland_20200404_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433268_Scotland_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAT", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433268_Scotland_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433312_Scotland_20200325_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001891149575038152,
"Nucleotide GTR":0.001853558103520129,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAT", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433312_Scotland_20200325_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433328_Scotland_20200326_null_8":{
"Global MG94xREV":0.001891149574135036,
"Nucleotide GTR":0.001853558102634963,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCT", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433328_Scotland_20200326_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433560_Scotland_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "Y", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "TAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433560_Scotland_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433639_Scotland_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001890556892206935,
"Nucleotide GTR":0.001852977201787595,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTT", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433639_Scotland_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433716_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00189142323373634,
"Nucleotide GTR":0.001853826322546439,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGT", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433716_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434013_England_20200414_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001891634744818814,
"Nucleotide GTR":0.00185403362930106,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAA", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434013_England_20200414_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434088_Washington_20200403_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00189129603004819,
"Nucleotide GTR":0.001853701647359411,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTA", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434088_Washington_20200403_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434334_Washington_20200331_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001891149574108597,
"Nucleotide GTR":0.001853558102609051,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "I", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ATA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434334_Washington_20200331_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434363_Ghent_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001924732830969143,
"Nucleotide GTR":0.001886473805691505,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "-", "-", "H", "V", "-", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATT", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "---", "---", "CAT", "GTG", "---", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434363_Ghent_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434508_Luxembourg_20200409_null_27":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "C", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TGC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434508_Luxembourg_20200409_null_27",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434556_Manila_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001891560776683227,
"Nucleotide GTR":0.001853961131472794,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "T", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "ACT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434556_Manila_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434588_Maryland_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001897349097673147,
"Nucleotide GTR":0.001859634394665857,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGT", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTA", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434588_Maryland_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434838_Texas_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00189359001028259,
"Nucleotide GTR":0.001855950028824798,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "D", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "E", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAT", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAA", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434838_Texas_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434939_Texas_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00189142323373634,
"Nucleotide GTR":0.001853826322546439,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGT", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434939_Texas_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435011_Texas_20200402_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001893364791896918,
"Nucleotide GTR":0.001855729287234952,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "Y", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "E", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "TAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAA", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435011_Texas_20200402_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435503_New_York_20200420_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATT", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435503_New_York_20200420_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435510_New_York_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001891149574135036,
"Nucleotide GTR":0.001853558102634963,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "F", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "TTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435510_New_York_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435527_New_York_20200420_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001891194274408845,
"Nucleotide GTR":0.001853601914375634,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAT", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435527_New_York_20200420_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436548_Florida_20200417_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001892935929456712,
"Nucleotide GTR":0.001855308949540973,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "K", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "E", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "AAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAA", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436548_Florida_20200417_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436614_Wisconsin_20200421_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001898183070371362,
"Nucleotide GTR":0.001860451790007447,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "A", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GCC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436614_Wisconsin_20200421_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436639_Wisconsin_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001891560776683227,
"Nucleotide GTR":0.001853961131472794,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "N", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "AAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436639_Wisconsin_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436671_California_20200418_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001891350383044756,
"Nucleotide GTR":0.001853754919950098,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACG", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436671_California_20200418_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436674_California_20200331_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001891723734721246,
"Nucleotide GTR":0.001854120850299846,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTA", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436674_California_20200331_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436899_Wisconsin_20200503_null_3":{
"Global MG94xREV":0.00189142323373634,
"Nucleotide GTR":0.001853826322546439,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGT", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436899_Wisconsin_20200503_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436936_Utah_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001891939811968702,
"Nucleotide GTR":0.001854332632455149,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "CTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436936_Utah_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436953_LA_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001891058061596218,
"Nucleotide GTR":0.001853468409143693,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAT", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436953_LA_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437120_Michigan_20200318_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001891946490648885,
"Nucleotide GTR":0.001854339178379353,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "S", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "AGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437120_Michigan_20200318_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437286_Bavaria_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001891058060728086,
"Nucleotide GTR":0.00185346840829282,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "S", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "TCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437286_Bavaria_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437440_Gujarat_20200426_null_8":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "N", "-", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AAC", "---", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437440_Gujarat_20200426_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437522_Oregon_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001891457124000211,
"Nucleotide GTR":0.001853859539153976,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "G", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GGA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437522_Oregon_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437595_California_20200322_null_75":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTA", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437595_California_20200322_null_75",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437642_Unknown_20200308_null_23":{
"Global MG94xREV":0.001891917500555585,
"Nucleotide GTR":0.001854310764538867,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCC", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437642_Unknown_20200308_null_23",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437761_Makkah_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00189371927933801,
"Nucleotide GTR":0.001856076728324596,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "L", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTA", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437761_Makkah_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437843_Washington_20200405_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001891814426246309,
"Nucleotide GTR":0.001854209739097125,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTC", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437843_Washington_20200405_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437865_Connecticut_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001891225246753654,
"Nucleotide GTR":0.001853632271065272,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "I", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAT", "CGC", "AAG", "ATT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437865_Connecticut_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437958_Bad_Gastein_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00189178818353298,
"Nucleotide GTR":0.001854184018025355,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCG", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437958_Bad_Gastein_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438185_Washington_20200417_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001891553182044248,
"Nucleotide GTR":0.001853953687796836,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "D", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GAC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438185_Washington_20200417_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438301_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001892470305706034,
"Nucleotide GTR":0.001854852581262308,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAC", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438301_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438404_England_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001891058060728086,
"Nucleotide GTR":0.00185346840829282,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGT", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438404_England_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438588_England_20200422_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001891603930380787,
"Nucleotide GTR":0.001854003427379401,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "N", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "AAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438588_England_20200422_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438918_Scotland_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001891635473527608,
"Nucleotide GTR":0.001854034343524889,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTC", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438918_Scotland_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438971_Kanto_20200424_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001892342148259727,
"Nucleotide GTR":0.001854726971275524,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "T", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTT", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ACA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438971_Kanto_20200424_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439042_Scotland_20200425_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001892195324262989,
"Nucleotide GTR":0.001854583065784104,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "D", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GAC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439042_Scotland_20200425_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439188_Scotland_20200422_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001891723734721246,
"Nucleotide GTR":0.001854120850299846,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "D", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GAC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439188_Scotland_20200422_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439254_Scotland_20200426_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001891723734721246,
"Nucleotide GTR":0.001854120850299846,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "N", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "AAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439254_Scotland_20200426_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439260_Scotland_20200426_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001893569287197674,
"Nucleotide GTR":0.001855929717664598,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "L", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTA", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439260_Scotland_20200426_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439265_Scotland_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001891149575038152,
"Nucleotide GTR":0.001853558103520129,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "I", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ATT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439265_Scotland_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439279_Scotland_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00189142323373634,
"Nucleotide GTR":0.001853826322546439,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTT", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439279_Scotland_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439350_Scotland_20200501_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00189039963528769,
"Nucleotide GTR":0.001852823070754889,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "L", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTT", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CTT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439350_Scotland_20200501_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439434_England_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001891985149206452,
"Nucleotide GTR":0.00185437706849846,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAC", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439434_England_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439564_England_20200327_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "D", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAT", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439564_England_20200327_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439774_England_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGT", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439774_England_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439778_England_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001891058060727095,
"Nucleotide GTR":0.001853468408291848,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAT", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439778_England_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439819_England_20200413_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001891553401155176,
"Nucleotide GTR":0.001853953902552369,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "C", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "TGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439819_England_20200413_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439825_England_20200415_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001891457125062823,
"Nucleotide GTR":0.001853859540195467,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAG", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439825_England_20200415_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439839_England_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTT", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439839_England_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440121_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00189178818353298,
"Nucleotide GTR":0.001854184018025355,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "E", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "GAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440121_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440132_England_20200322_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001891932346207507,
"Nucleotide GTR":0.001854325315095201,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTC", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440132_England_20200322_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440266_England_20200317_null_16":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTT", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440266_England_20200317_null_16",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440400_England_20200316_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001891625647978511,
"Nucleotide GTR":0.0018540247132839,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "T", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "ACT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440400_England_20200316_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440671_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001891457125089176,
"Nucleotide GTR":0.001853859540221296,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGG", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440671_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0]
]
},
"epi_isl_440786_England_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001891058060728086,
"Nucleotide GTR":0.00185346840829282,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "V", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GTC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440786_England_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440909_England_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001892195324264431,
"Nucleotide GTR":0.001854583065785517,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAA", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440909_England_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440936_England_20200425_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001891794977063433,
"Nucleotide GTR":0.001854190676516882,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "R", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CGT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440936_England_20200425_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440988_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001891457125089176,
"Nucleotide GTR":0.001853859540221296,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAG", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440988_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441119_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001892195324262989,
"Nucleotide GTR":0.001854583065784104,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "K", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "AAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441119_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441246_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001892048900967849,
"Nucleotide GTR":0.001854439553029304,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "V", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "GTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441246_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441414_Northern_Ireland_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001892195324264431,
"Nucleotide GTR":0.001854583065785517,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "D", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GAC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441414_Northern_Ireland_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441534_England_20200426_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0019118823112799,
"Nucleotide GTR":0.001873878723198383,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "G", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "GGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441534_England_20200426_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441558_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001892195324262989,
"Nucleotide GTR":0.001854583065784104,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "I", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "ATC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441558_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441658_England_20200404_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001890875826626837,
"Nucleotide GTR":0.001853289796563972,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "F", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "TTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441658_England_20200404_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441860_England_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001891058060727095,
"Nucleotide GTR":0.001853468408291848,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "V", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GTT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441860_England_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441879_England_20200430_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001891560776708824,
"Nucleotide GTR":0.001853961131497883,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "N", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "AAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441879_England_20200430_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441881_England_20200430_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001891346648076924,
"Nucleotide GTR":0.001853751259224376,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCG", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441881_England_20200430_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442091_England_20200405_null_8":{
"Global MG94xREV":0.00189080924805791,
"Nucleotide GTR":0.001853224541415681,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTT", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTG", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442091_England_20200405_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442117_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001891058060728086,
"Nucleotide GTR":0.00185346840829282,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "F", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "TTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442117_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442274_England_20200406_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001902942015811764,
"Nucleotide GTR":0.001865116139142864,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "N", "-", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTT", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AAC", "---", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442274_England_20200406_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442289_England_20200406_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001891625647978511,
"Nucleotide GTR":0.0018540247132839,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTA", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442289_England_20200406_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442649_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001890606718295194,
"Nucleotide GTR":0.00185302603745394,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTC", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442649_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442747_England_20200407_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001891058060727095,
"Nucleotide GTR":0.001853468408291848,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "S", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "TCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442747_England_20200407_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442958_England_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00189199499254764,
"Nucleotide GTR":0.001854386716177875,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "L", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "TTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442958_England_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442984_England_20200407_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "V", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GTA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442984_England_20200407_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443037_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001891058060727095,
"Nucleotide GTR":0.001853468408291848,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "F", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "TTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443037_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443107_England_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001893643933392887,
"Nucleotide GTR":0.00185600288007431,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "I", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "ATA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443107_England_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443220_Singapore_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001893000583452771,
"Nucleotide GTR":0.001855372318372241,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "Y", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "TAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443220_Singapore_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443281_Bretagne_20200403_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001891162666519252,
"Nucleotide GTR":0.0018535709347743,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "L", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TTA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443281_Bretagne_20200403_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443345_England_20200416_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001891960821986033,
"Nucleotide GTR":0.001854353224844243,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTT", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443345_England_20200416_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443347_England_20200415_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001891847183781692,
"Nucleotide GTR":0.001854241845492072,
"amino-acid": [
["M", "D", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443347_England_20200415_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443470_England_20200415_null_7":{
"Global MG94xREV":0.00189105806070157,
"Nucleotide GTR":0.00185346840826683,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "C", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "TGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443470_England_20200415_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443568_England_20200414_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001922915724526054,
"Nucleotide GTR":0.001884692818921866,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "-", "-", "-", "V", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "C", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "---", "---", "---", "GTG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "TGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443568_England_20200414_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443675_England_20200416_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001891058060700578,
"Nucleotide GTR":0.001853468408265856,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAT", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443675_England_20200416_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443888_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001891457124025195,
"Nucleotide GTR":0.001853859539178464,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "G", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GGA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443888_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443946_England_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001891058060727095,
"Nucleotide GTR":0.001853468408291848,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "L", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CTT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443946_England_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444012_England_20200326_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001914319455484685,
"Nucleotide GTR":0.001876267422881291,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "-", "-", "K", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "---", "---", "AAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444012_England_20200326_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444015_England_20200325_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001891088962423336,
"Nucleotide GTR":0.00185349869573724,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTC", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTT", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444015_England_20200325_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444026_California_20200501_null_10":{
"Global MG94xREV":0.001892195325396859,
"Nucleotide GTR":0.001854583066895435,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "T", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "ACT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444026_California_20200501_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444097_England_20200406_null_7":{
"Global MG94xREV":0.00189162322075773,
"Nucleotide GTR":0.001854022334310392,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "D", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GAT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444097_England_20200406_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444168_England_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001891560777866792,
"Nucleotide GTR":0.001853961132632834,
"amino-acid": [
["M", "K", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "AAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444168_England_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444193_England_20200414_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001892195324262989,
"Nucleotide GTR":0.001854583065784104,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "T", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "ACC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444193_England_20200414_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444216_England_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001892195324264431,
"Nucleotide GTR":0.001854583065785517,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "H", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CAC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444216_England_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444222_England_20200415_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTT", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444222_England_20200415_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444278_Taoyuan_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001894658961887323,
"Nucleotide GTR":0.00185699773226157,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTA", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTA", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444278_Taoyuan_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444282_England_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001891149575038152,
"Nucleotide GTR":0.001853558103520129,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTT", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444282_England_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444439_England_20200416_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001891308083432845,
"Nucleotide GTR":0.00185371346115198,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "TTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444439_England_20200416_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444828_Unknown_20200311_null_202":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAC", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444828_Unknown_20200311_null_202",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444924_Unknown_20200328_null_25":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAT", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444924_Unknown_20200328_null_25",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445010_Florida_20200417_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001891774697031102,
"Nucleotide GTR":0.001854170799602453,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "H", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CAT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445010_Florida_20200417_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445026_Florida_20200430_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001891149575037098,
"Nucleotide GTR":0.001853558103519095,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGT", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445026_Florida_20200430_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445027_Florida_20200430_null_11":{
"Global MG94xREV":0.001891346648050305,
"Nucleotide GTR":0.001853751259198284,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "G", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "GGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445027_Florida_20200430_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445055_Luxembourg_20200422_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001891636915911795,
"Nucleotide GTR":0.001854035757237974,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "I", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATT", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445055_Luxembourg_20200422_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445062_Luxembourg_20200429_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001896611416694833,
"Nucleotide GTR":0.001858911376998077,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "E", "A", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "GAG", "GCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445062_Luxembourg_20200429_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445075_Luxembourg_20200508_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGT", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445075_Luxembourg_20200508_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445132_Louisiana_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001891917499276996,
"Nucleotide GTR":0.001854310763285694,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAC", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445132_Louisiana_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445234_Vastra_Gotaland_20200420_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00189426523038721,
"Nucleotide GTR":0.001856611827189715,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "Q", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAA", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445234_Vastra_Gotaland_20200420_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445425_Wales_20200402_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "F", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "TTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445425_Wales_20200402_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445641_Wales_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001891960525224567,
"Nucleotide GTR":0.001854352933981674,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "L", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "TTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445641_Wales_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445704_Wales_20200412_null_73":{
"Global MG94xREV":0.001891141564417409,
"Nucleotide GTR":0.001853550252131118,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "I", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "ATT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445704_Wales_20200412_null_73",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445736_Wales_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001926638697052402,
"Nucleotide GTR":0.001888341787774721,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "-", "V", "-", "-", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGG", "---", "GTT", "---", "---", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445736_Wales_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445816_Wales_20200329_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "D", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GAC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445816_Wales_20200329_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445870_Wales_20200408_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001891614602697337,
"Nucleotide GTR":0.001854013887556157,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "D", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAT", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445870_Wales_20200408_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445900_Wales_20200331_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001891058060727095,
"Nucleotide GTR":0.001853468408291848,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "Y", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "TAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445900_Wales_20200331_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445941_Wales_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009477176747122243,
"Nucleotide GTR":0.0009288793435477777,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAA", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445941_Wales_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446101_Wales_20200407_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001891651318105658,
"Nucleotide GTR":0.001854049873151115,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "C", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "TGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446101_Wales_20200407_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446147_Wales_20200406_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "-", "M", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "---", "ATG", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446147_Wales_20200406_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446382_Wales_20200410_null_19":{
"Global MG94xREV":0.001903069616523424,
"Nucleotide GTR":0.001865241203461539,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "-", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTG", "---", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446382_Wales_20200410_null_19",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446451_Wales_20200411_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001891149575037098,
"Nucleotide GTR":0.001853558103519095,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446451_Wales_20200411_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446504_Wales_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001891749252947216,
"Nucleotide GTR":0.00185414586128531,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "L", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CTA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446504_Wales_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446729_Wales_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001891346648076924,
"Nucleotide GTR":0.001853751259224376,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "G", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GGA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446729_Wales_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446758_Wales_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00189052914564645,
"Nucleotide GTR":0.001852950006761507,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "V", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTT", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GTA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446758_Wales_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446803_Wales_20200416_null_8":{
"Global MG94xREV":0.001891767092303577,
"Nucleotide GTR":0.00185416334603849,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAG", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446803_Wales_20200416_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446912_Wales_20200417_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001891457125089176,
"Nucleotide GTR":0.001853859540221296,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "G", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GGT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446912_Wales_20200417_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446938_Wales_20200418_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001892195324264431,
"Nucleotide GTR":0.001854583065785517,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "I", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "ATA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446938_Wales_20200418_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446942_Wales_20200418_null_18":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "N", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "AAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446942_Wales_20200418_null_18",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446979_Wales_20200416_null_14":{
"Global MG94xREV":0.001892206891016578,
"Nucleotide GTR":0.001854594402618656,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "Y", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "TAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446979_Wales_20200416_null_14",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447010_Bangkok_20200329_null_12":{
"Global MG94xREV":0.001891058061596218,
"Nucleotide GTR":0.001853468409143693,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "C", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "TGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447010_Bangkok_20200329_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447061_Michigan_20200327_null_8":{
"Global MG94xREV":0.001891058060727095,
"Nucleotide GTR":0.001853468408291848,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGT", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447061_Michigan_20200327_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447129_Li_ge_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "-", "-", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "C", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "---", "---", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TGC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447129_Li_ge_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447162_Li_ge_20200419_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001891561293620097,
"Nucleotide GTR":0.001853961638134209,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAG", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447162_Li_ge_20200419_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447212_Michigan_20200323_null_227":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "E", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAA", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447212_Michigan_20200323_null_227",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447247_Kinshasa_20200425_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00189165021088512,
"Nucleotide GTR":0.00185404878793944,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "N", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAT", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447247_Kinshasa_20200425_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447251_Israel_20200309_null_4":{
"Global MG94xREV":0.00189105806070157,
"Nucleotide GTR":0.00185346840826683,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAT", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447251_Israel_20200309_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447276_South_Coast_District_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001891710136220631,
"Nucleotide GTR":0.001854107522104476,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "D", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GAT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447276_South_Coast_District_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447427_Tel_Aviv_District_20200403_null_15":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "TTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447427_Tel_Aviv_District_20200403_null_15",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447483_Comunitat_Valenciana_20200329_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001891058060727095,
"Nucleotide GTR":0.001853468408291848,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAT", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447483_Comunitat_Valenciana_20200329_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447522_Comunitat_Valenciana_20200401_null_15":{
"Global MG94xREV":0.001891058060727095,
"Nucleotide GTR":0.001853468408291848,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "Y", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "TAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447522_Comunitat_Valenciana_20200401_null_15",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447572_Telangana_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001891057238884007,
"Nucleotide GTR":0.00185346760278501,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "Y", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "TAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447572_Telangana_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447587_Tamil_Nadu_20200420_null_20":{
"Global MG94xREV":0.00189052419754347,
"Nucleotide GTR":0.001852945157014826,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "C", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "TGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447587_Tamil_Nadu_20200420_null_20",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447598_Kinshasa_20200422_null_15":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTT", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447598_Kinshasa_20200422_null_15",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447700_France_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001891917500527997,
"Nucleotide GTR":0.001854310764511831,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGC", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447700_France_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447710_France_20200301_null_313":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTT", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447710_France_20200301_null_313",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447750_Choco_20200330_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001891650211405737,
"Nucleotide GTR":0.001854048788449708,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "C", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "TGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447750_Choco_20200330_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447752_Huila_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "-", "-", "H", "-", "-", "M", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "---", "---", "CAT", "---", "---", "ATG", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447752_Huila_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447753_Huila_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001891241081185043,
"Nucleotide GTR":0.001853647790746528,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "F", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "TTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447753_Huila_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447797_Cordoba_20200404_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGT", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447797_Cordoba_20200404_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447806_Huila_20200404_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001891346646936724,
"Nucleotide GTR":0.001853751258106839,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "V", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "GTC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447806_Huila_20200404_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447835_Athen_20200331_null_24927":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447835_Athen_20200331_null_24927",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
}
},
"attributes":{
"Global MG94xREV":{
"attribute type":"branch length",
"display order":1
},
"Nucleotide GTR":{
"attribute type":"branch length",
"display order":0
},
"amino-acid":{
"attribute type":"node label",
"display order":1
},
"codon":{
"attribute type":"node label",
"display order":0
},
"nonsynonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":1
},
"original name":{
"attribute type":"node label",
"display order":-1
},
"synonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":0
}
}
},
"data partitions":{
"0":{
"coverage": [
[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179]
],
"name":"slac.filter.default"
}
},
"fits":{
"Global MG94xREV":{
"AIC-c":6061.601888830804,
"Equilibrium frequencies": [
[0.01557531481264384],
[0.0153511946390263],
[0.0108780725979856],
[0.02433513593694893],
[0.006267867972634538],
[0.006177676815978215],
[0.004377588746107255],
[0.009793023189816268],
[0.009958646290630565],
[0.009815346873411722],
[0.006955292951073941],
[0.01555955780962799],
[0.0127648288684022],
[0.01258115003451679],
[0.008915180001281215],
[0.0199439850469211],
[0.0214545711971827],
[0.02114585177292431],
[0.01498424820615155],
[0.03352098579275947],
[0.008633817119655537],
[0.008509581262138967],
[0.006030009059534472],
[0.01348962225091038],
[0.01371776355341772],
[0.01352037251598324],
[0.009580726271737484],
[0.02143286635544278],
[0.01758320349035056],
[0.01733019090817078],
[0.01228041720979633],
[0.02747229525000423],
[0.03517708697353467],
[0.03467090812997974],
[0.0245682935136005],
[0.05496127710188689],
[0.0141560757817242],
[0.01395237767352495],
[0.009886851207089164],
[0.02211769281236976],
[0.02249175512136664],
[0.0221681111935616],
[0.0157086356204963],
[0.03514149954097242],
[0.0288295614379206],
[0.02841471997933645],
[0.02013507053065801],
[0.04504379558510702],
[0.01231808273575412],
[0.0195269635299324],
[0.005029453282249106],
[0.004957082228669888],
[0.003512658240979451],
[0.007858103080697242],
[0.007876016017635486],
[0.005581055809489139],
[0.01248527720073932],
[0.01024273496663152],
[0.01009534767034544],
[0.007153705456951206],
[0.0160034227736298]
],
"Log Likelihood":-2729.777940355862,
"Rate Distributions":{
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *background*": [
[0.7990506574144932, 1]
],
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *test*": [
[0.6290858193988841, 1]
]
},
"display order":1,
"estimated parameters":299
},
"Nucleotide GTR":{
"AIC-c":6543.813940306544,
"Equilibrium frequencies": [
[0.2503065924862407],
[0.2144427494615937],
[0.2699808566642737],
[0.2652698013878919]
],
"Log Likelihood":-2769.021902171441,
"Rate Distributions":{
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide C":0.07549181680367374,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide G":1,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide T":0.2938504214642642,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide G":0.04149799373553952,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide T":1.37238884798686,
"Substitution rate from nucleotide G to nucleotide T":0.4997126694427377
},
"display order":0,
"estimated parameters":501
}
},
"input":{
"file name":"/data/shares/veg/SARS-CoV-2/SARS-CoV-2/data/fasta/2020-05-18/sequences.leader.compressed.fas",
"number of sequences":248,
"number of sites":180,
"partition count":1,
"trees":{
"0":"(epi_isl_447806_Huila_20200404_null_4,epi_isl_440988_England_20200331_null_1,epi_isl_425559_England_20200323_null_1,epi_isl_419442_Wales_20200318_null_1,epi_isl_438301_England_20200330_null_1,epi_isl_434556_Manila_20200326_null_1,epi_isl_429550_Unknown_20200325_null_2,epi_isl_442958_England_20200410_null_1,epi_isl_437286_Bavaria_20200402_null_1,epi_isl_442117_England_20200405_null_1,epi_isl_426828_Victoria_20200325_null_5,epi_isl_432586_England_20200405_null_1,epi_isl_443470_England_20200415_null_7,(epi_isl_437865_Connecticut_20200402_null_1,epi_isl_444924_Unknown_20200328_null_25)Node397,epi_isl_427053_Victoria_20200331_null_1,epi_isl_422000_England_20200402_null_1,epi_isl_444168_England_20200410_null_1,(epi_isl_442649_England_20200407_null_1,epi_isl_444222_England_20200415_null_4)Node405,epi_isl_434013_England_20200414_null_3,(epi_isl_406799_Wuhan_20191231_null_1,epi_isl_445425_Wales_20200402_null_4)Node422,epi_isl_447522_Comunitat_Valenciana_20200401_null_15,epi_isl_441558_England_20200405_null_1,epi_isl_406595_Guangdong_20200116_null_1,epi_isl_428390_Connecticut_20200326_null_2,(epi_isl_421248_Jiangxi_20200123_null_2,epi_isl_439260_Scotland_20200426_null_1)Node426,epi_isl_433312_Scotland_20200325_null_3,epi_isl_437522_Oregon_20200407_null_1,epi_isl_441860_England_20200420_null_1,epi_isl_426521_Arizona_20200320_null_1,epi_isl_436899_Wisconsin_20200503_null_3,epi_isl_441414_Northern_Ireland_20200318_null_2,epi_isl_424907_Virginia_20200306_null_4,epi_isl_419868_Victoria_20200318_null_1,epi_isl_436674_California_20200331_null_3,epi_isl_438404_England_20200330_null_2,epi_isl_445026_Florida_20200430_null_3,epi_isl_428748_Connecticut_20200407_null_1,epi_isl_436614_Wisconsin_20200421_null_5,epi_isl_443888_England_20200329_null_1,epi_isl_430572_Victoria_20200407_null_1,epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1,epi_isl_436671_California_20200418_null_2,epi_isl_418989_Vorst_20200304_null_2,epi_isl_427303_Rio_de_Janeiro_20200325_null_1,epi_isl_417067_Washington_20200303_null_1,epi_isl_447247_Kinshasa_20200425_null_2,epi_isl_440786_England_20200401_null_2,epi_isl_444282_England_20200416_null_1,epi_isl_426742_Victoria_20200327_null_1,epi_isl_439279_Scotland_20200413_null_1,epi_isl_445132_Louisiana_20200402_null_2,epi_isl_426074_Idaho_20200329_null_1,epi_isl_408483_Shanghai_20200120_null_1,epi_isl_438185_Washington_20200417_null_5,epi_isl_444193_England_20200414_null_7,epi_isl_433328_Scotland_20200326_null_8,epi_isl_433235_Scotland_20200402_null_2,epi_isl_440400_England_20200316_null_4,epi_isl_423012_Washington_20200319_null_1,epi_isl_447835_Athen_20200331_null_24927,epi_isl_446938_Wales_20200418_null_2,epi_isl_430386_New_York_20200408_null_1,(epi_isl_427098_Victoria_20200404_null_1,epi_isl_446942_Wales_20200418_null_18)Node267,epi_isl_446979_Wales_20200416_null_14,epi_isl_446912_Wales_20200417_null_4,(epi_isl_430083_St_Petersburg_20200410_null_1,epi_isl_421504_Ile_de_France_20200314_null_1,epi_isl_421584_New_Jersey_20200318_null_1)Node275,epi_isl_432713_England_20200325_null_1,epi_isl_422346_Wales_20200326_null_1,epi_isl_422072_Wales_20200328_null_1,epi_isl_417347_Washington_20200312_null_1,epi_isl_433716_England_20200101_null_1,epi_isl_443675_England_20200416_null_4,epi_isl_423459_England_20200330_null_1,(epi_isl_437595_California_20200322_null_75,epi_isl_444278_Taoyuan_20200320_null_1)Node297,(epi_isl_434588_Maryland_20200314_null_1,epi_isl_445075_Luxembourg_20200508_null_7)Node300,epi_isl_432031_Wales_20200327_null_1,epi_isl_447753_Huila_20200330_null_2,epi_isl_416650_USA_20200310_null_1,epi_isl_421203_Li_ge_20200330_null_1,(epi_isl_440266_England_20200317_null_16,epi_isl_444015_England_20200325_null_3)Node329,epi_isl_426628_Louisiana_20200406_null_5,epi_isl_445010_Florida_20200417_null_2,epi_isl_437120_Michigan_20200318_null_3,epi_isl_445234_Vastra_Gotaland_20200420_null_2,epi_isl_440132_England_20200322_null_5,epi_isl_424148_England_20200320_null_1,epi_isl_421335_Wisconsin_20200319_null_1,(epi_isl_413747_China_20200201_null_1,epi_isl_445941_Wales_20200401_null_1)Node318,epi_isl_433639_Scotland_20200403_null_1,epi_isl_445900_Wales_20200331_null_5,epi_isl_445027_Florida_20200430_null_11,epi_isl_416726_Washington_20200313_null_1,epi_isl_447750_Choco_20200330_null_4,(epi_isl_429986_Virginia_20200402_null_2,epi_isl_447797_Cordoba_20200404_null_7)Node344,epi_isl_435510_New_York_20200414_null_1,epi_isl_420310_Norway_20200316_null_2,epi_isl_432046_Wales_20200405_null_1,epi_isl_433250_Scotland_20200404_null_2,epi_isl_442289_England_20200406_null_4,epi_isl_440671_England_20200404_null_1,epi_isl_442747_England_20200407_null_2,epi_isl_426758_Victoria_20200327_null_5,epi_isl_443220_Singapore_20200321_null_1,epi_isl_443946_England_20200326_null_2,(epi_isl_427104_Victoria_20200404_null_1,epi_isl_439774_England_20200409_null_1)Node368,epi_isl_430153_Washington_20200331_null_2,epi_isl_445641_Wales_20200407_null_1,epi_isl_439825_England_20200415_null_3,epi_isl_424451_Reykjavik_20200320_null_1,epi_isl_417094_Washington_20200228_null_1,epi_isl_437843_Washington_20200405_null_3,epi_isl_432510_England_20200327_null_2,epi_isl_439265_Scotland_20200410_null_1,epi_isl_428343_Wisconsin_20200328_null_1,epi_isl_446504_Wales_20200411_null_1,epi_isl_444439_England_20200416_null_6,epi_isl_441658_England_20200404_null_3,epi_isl_445870_Wales_20200408_null_7,epi_isl_433234_Scotland_20200402_null_2,epi_isl_447572_Telangana_20200401_null_1,epi_isl_440936_England_20200425_null_1,epi_isl_447276_South_Coast_District_20200325_null_2,(epi_isl_434508_Luxembourg_20200409_null_27,epi_isl_447129_Li_ge_20200323_null_1)Node166,(epi_isl_430156_Washington_20200304_null_1,epi_isl_444012_England_20200326_null_4)Node138,epi_isl_445055_Luxembourg_20200422_null_2,(epi_isl_434363_Ghent_20200330_null_1,epi_isl_435503_New_York_20200420_null_2)Node143,epi_isl_446382_Wales_20200410_null_19,(epi_isl_429215_Switzerland_20200323_null_1,(epi_isl_445736_Wales_20200413_null_1,epi_isl_446147_Wales_20200406_null_3,epi_isl_447752_Huila_20200330_null_1)Node150,((epi_isl_420942_Wales_20200321_null_1,epi_isl_432326_Wales_20200301_null_1)Node156,epi_isl_443568_England_20200414_null_4)Node155)Node148,(epi_isl_413752_China_20200201_null_1,epi_isl_422888_Noord_Brabant_20200317_null_1,epi_isl_444828_Unknown_20200311_null_202)Node161,epi_isl_423844_England_20200323_null_1,epi_isl_434088_Washington_20200403_null_2,epi_isl_443345_England_20200416_null_3,epi_isl_447061_Michigan_20200327_null_8,epi_isl_443281_Bretagne_20200403_null_3,(epi_isl_445062_Luxembourg_20200429_null_1,epi_isl_427264_Washington_20200329_null_1,epi_isl_429725_Luxembourg_20200330_null_1)Node193,epi_isl_437761_Makkah_20200402_null_1,epi_isl_438918_Scotland_20200413_null_1,epi_isl_434334_Washington_20200331_null_4,epi_isl_432565_England_20200402_null_1,epi_isl_447162_Li_ge_20200419_null_7,epi_isl_447700_France_20200301_null_1,epi_isl_443037_England_20200408_null_1,epi_isl_426749_Victoria_20200325_null_1,epi_isl_439819_England_20200413_null_7,epi_isl_447251_Israel_20200309_null_4,epi_isl_430632_Northern_Territory_20200101_null_2,epi_isl_443107_England_20200411_null_1,((epi_isl_437440_Gujarat_20200426_null_8,epi_isl_442274_England_20200406_null_3)Node221,epi_isl_422919_Zuid_Holland_20200319_null_1)Node220,epi_isl_435527_New_York_20200420_null_4,(epi_isl_442984_England_20200407_null_7,epi_isl_446758_Wales_20200420_null_1)Node234,(epi_isl_439350_Scotland_20200501_null_1,epi_isl_447710_France_20200301_null_313)Node228,(epi_isl_426930_Victoria_20200328_null_1,epi_isl_438971_Kanto_20200424_null_1)Node231,epi_isl_425778_Scotland_20200313_null_1,(epi_isl_422904_Zuid_Holland_20200309_null_1,epi_isl_439839_England_20200414_null_1)Node239,(epi_isl_442091_England_20200405_null_8,epi_isl_447598_Kinshasa_20200422_null_15)Node242,epi_isl_414934_Shandong_20200121_null_1,epi_isl_425241_England_20200401_null_1,epi_isl_438588_England_20200422_null_1,epi_isl_439042_Scotland_20200425_null_1,epi_isl_441881_England_20200430_null_3,epi_isl_422347_Wales_20200325_null_1,epi_isl_440121_England_20200323_null_1,epi_isl_440909_England_20200420_null_1,epi_isl_446729_Wales_20200414_null_1,epi_isl_426011_Scotland_20200331_null_1,epi_isl_439188_Scotland_20200422_null_2,epi_isl_444216_England_20200415_null_1,epi_isl_447483_Comunitat_Valenciana_20200329_null_6,epi_isl_424352_Anhui_20200310_null_2,(epi_isl_419847_Victoria_20200317_null_1,epi_isl_447427_Tel_Aviv_District_20200403_null_15)Node52,(epi_isl_434838_Texas_20200321_null_1,epi_isl_439564_England_20200327_null_4)Node49,(epi_isl_433560_Scotland_20200401_null_1,epi_isl_435011_Texas_20200402_null_6)Node46,(epi_isl_436548_Florida_20200417_null_1,epi_isl_447212_Michigan_20200323_null_227)Node42,epi_isl_439434_England_20200401_null_2,epi_isl_430937_Washington_20200401_null_2,epi_isl_436936_Utah_20200415_null_1,epi_isl_441246_England_20200401_null_1,epi_isl_437642_Unknown_20200308_null_23,epi_isl_446451_Wales_20200411_null_3,epi_isl_425518_England_20200320_null_1,epi_isl_437958_Bad_Gastein_20200323_null_2,epi_isl_423762_England_20200324_null_3,(epi_isl_422359_Wales_20200324_null_1,epi_isl_433268_Scotland_20200408_null_2)Node82,epi_isl_445704_Wales_20200412_null_73,epi_isl_441119_England_20200403_null_1,epi_isl_419419_Wales_20200318_null_1,epi_isl_447010_Bangkok_20200329_null_12,epi_isl_430330_New_York_20200330_null_1,epi_isl_441534_England_20200426_null_1,(epi_isl_427243_Washington_20200331_null_1,epi_isl_445816_Wales_20200329_null_3)Node15,epi_isl_446803_Wales_20200416_null_8,epi_isl_436639_Wisconsin_20200409_null_1,epi_isl_427154_Victoria_20200328_null_2,epi_isl_444097_England_20200406_null_7,epi_isl_439778_England_20200409_null_1,epi_isl_425772_Scotland_20200313_null_2,epi_isl_422885_Noord_Brabant_20200324_null_3,epi_isl_434939_Texas_20200328_null_1,epi_isl_428453_Guangdong_20200122_null_1,epi_isl_446101_Wales_20200407_null_2,epi_isl_444026_California_20200501_null_10,epi_isl_443347_England_20200415_null_4,(epi_isl_423295_England_20200326_null_2,epi_isl_424146_England_20200321_null_1)Node106,epi_isl_447587_Tamil_Nadu_20200420_null_20,epi_isl_436953_LA_20200406_null_1,epi_isl_441879_England_20200430_null_1,epi_isl_426467_Virginia_20200331_null_3,epi_isl_439254_Scotland_20200426_null_6)"
}
},
"tested":{
"0":{
"Node106":"test",
"Node138":"test",
"Node143":"test",
"Node148":"test",
"Node15":"test",
"Node150":"test",
"Node155":"test",
"Node156":"test",
"Node161":"test",
"Node166":"test",
"Node193":"test",
"Node220":"test",
"Node221":"test",
"Node228":"test",
"Node231":"test",
"Node234":"test",
"Node239":"test",
"Node242":"test",
"Node267":"test",
"Node275":"test",
"Node297":"test",
"Node300":"test",
"Node318":"test",
"Node329":"test",
"Node344":"test",
"Node368":"test",
"Node397":"test",
"Node405":"test",
"Node42":"test",
"Node422":"test",
"Node426":"test",
"Node46":"test",
"Node49":"test",
"Node52":"test",
"Node82":"test",
"epi_isl_406595_Guangdong_20200116_null_1":"background",
"epi_isl_406799_Wuhan_20191231_null_1":"background",
"epi_isl_408483_Shanghai_20200120_null_1":"background",
"epi_isl_413747_China_20200201_null_1":"background",
"epi_isl_413752_China_20200201_null_1":"background",
"epi_isl_414934_Shandong_20200121_null_1":"background",
"epi_isl_416650_USA_20200310_null_1":"background",
"epi_isl_416726_Washington_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_417067_Washington_20200303_null_1":"background",
"epi_isl_417094_Washington_20200228_null_1":"background",
"epi_isl_417347_Washington_20200312_null_1":"background",
"epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_418989_Vorst_20200304_null_2":"background",
"epi_isl_419419_Wales_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_419442_Wales_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_419847_Victoria_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_419868_Victoria_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_420310_Norway_20200316_null_2":"background",
"epi_isl_420942_Wales_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_421203_Li_ge_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_421248_Jiangxi_20200123_null_2":"background",
"epi_isl_421335_Wisconsin_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_421504_Ile_de_France_20200314_null_1":"background",
"epi_isl_421584_New_Jersey_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_422000_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_422072_Wales_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_422346_Wales_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_422347_Wales_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_422359_Wales_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_422885_Noord_Brabant_20200324_null_3":"background",
"epi_isl_422888_Noord_Brabant_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_422904_Zuid_Holland_20200309_null_1":"background",
"epi_isl_422919_Zuid_Holland_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_423012_Washington_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_423295_England_20200326_null_2":"background",
"epi_isl_423459_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_423762_England_20200324_null_3":"background",
"epi_isl_423844_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_424146_England_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_424148_England_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_424352_Anhui_20200310_null_2":"background",
"epi_isl_424451_Reykjavik_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_424907_Virginia_20200306_null_4":"background",
"epi_isl_425241_England_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_425518_England_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_425559_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_425772_Scotland_20200313_null_2":"background",
"epi_isl_425778_Scotland_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_426011_Scotland_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_426074_Idaho_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_426467_Virginia_20200331_null_3":"background",
"epi_isl_426521_Arizona_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_426628_Louisiana_20200406_null_5":"background",
"epi_isl_426742_Victoria_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_426749_Victoria_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_426758_Victoria_20200327_null_5":"background",
"epi_isl_426828_Victoria_20200325_null_5":"background",
"epi_isl_426930_Victoria_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_427053_Victoria_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_427098_Victoria_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_427104_Victoria_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_427154_Victoria_20200328_null_2":"background",
"epi_isl_427243_Washington_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_427264_Washington_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_427303_Rio_de_Janeiro_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_428343_Wisconsin_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_428390_Connecticut_20200326_null_2":"background",
"epi_isl_428453_Guangdong_20200122_null_1":"background",
"epi_isl_428748_Connecticut_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_429215_Switzerland_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_429550_Unknown_20200325_null_2":"background",
"epi_isl_429725_Luxembourg_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_429986_Virginia_20200402_null_2":"background",
"epi_isl_430083_St_Petersburg_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_430153_Washington_20200331_null_2":"background",
"epi_isl_430156_Washington_20200304_null_1":"background",
"epi_isl_430330_New_York_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_430386_New_York_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_430572_Victoria_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_430632_Northern_Territory_20200101_null_2":"background",
"epi_isl_430937_Washington_20200401_null_2":"background",
"epi_isl_432031_Wales_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_432046_Wales_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_432326_Wales_20200301_null_1":"background",
"epi_isl_432510_England_20200327_null_2":"background",
"epi_isl_432565_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_432586_England_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_432713_England_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_433234_Scotland_20200402_null_2":"background",
"epi_isl_433235_Scotland_20200402_null_2":"background",
"epi_isl_433250_Scotland_20200404_null_2":"background",
"epi_isl_433268_Scotland_20200408_null_2":"background",
"epi_isl_433312_Scotland_20200325_null_3":"background",
"epi_isl_433328_Scotland_20200326_null_8":"background",
"epi_isl_433560_Scotland_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_433639_Scotland_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_433716_England_20200101_null_1":"background",
"epi_isl_434013_England_20200414_null_3":"background",
"epi_isl_434088_Washington_20200403_null_2":"background",
"epi_isl_434334_Washington_20200331_null_4":"background",
"epi_isl_434363_Ghent_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_434508_Luxembourg_20200409_null_27":"background",
"epi_isl_434556_Manila_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_434588_Maryland_20200314_null_1":"background",
"epi_isl_434838_Texas_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_434939_Texas_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_435011_Texas_20200402_null_6":"background",
"epi_isl_435503_New_York_20200420_null_2":"background",
"epi_isl_435510_New_York_20200414_null_1":"background",
"epi_isl_435527_New_York_20200420_null_4":"background",
"epi_isl_436548_Florida_20200417_null_1":"background",
"epi_isl_436614_Wisconsin_20200421_null_5":"background",
"epi_isl_436639_Wisconsin_20200409_null_1":"background",
"epi_isl_436671_California_20200418_null_2":"background",
"epi_isl_436674_California_20200331_null_3":"background",
"epi_isl_436899_Wisconsin_20200503_null_3":"background",
"epi_isl_436936_Utah_20200415_null_1":"background",
"epi_isl_436953_LA_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_437120_Michigan_20200318_null_3":"background",
"epi_isl_437286_Bavaria_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_437440_Gujarat_20200426_null_8":"background",
"epi_isl_437522_Oregon_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_437595_California_20200322_null_75":"background",
"epi_isl_437642_Unknown_20200308_null_23":"background",
"epi_isl_437761_Makkah_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_437843_Washington_20200405_null_3":"background",
"epi_isl_437865_Connecticut_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_437958_Bad_Gastein_20200323_null_2":"background",
"epi_isl_438185_Washington_20200417_null_5":"background",
"epi_isl_438301_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_438404_England_20200330_null_2":"background",
"epi_isl_438588_England_20200422_null_1":"background",
"epi_isl_438918_Scotland_20200413_null_1":"background",
"epi_isl_438971_Kanto_20200424_null_1":"background",
"epi_isl_439042_Scotland_20200425_null_1":"background",
"epi_isl_439188_Scotland_20200422_null_2":"background",
"epi_isl_439254_Scotland_20200426_null_6":"background",
"epi_isl_439260_Scotland_20200426_null_1":"background",
"epi_isl_439265_Scotland_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_439279_Scotland_20200413_null_1":"background",
"epi_isl_439350_Scotland_20200501_null_1":"background",
"epi_isl_439434_England_20200401_null_2":"background",
"epi_isl_439564_England_20200327_null_4":"background",
"epi_isl_439774_England_20200409_null_1":"background",
"epi_isl_439778_England_20200409_null_1":"background",
"epi_isl_439819_England_20200413_null_7":"background",
"epi_isl_439825_England_20200415_null_3":"background",
"epi_isl_439839_England_20200414_null_1":"background",
"epi_isl_440121_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_440132_England_20200322_null_5":"background",
"epi_isl_440266_England_20200317_null_16":"background",
"epi_isl_440400_England_20200316_null_4":"background",
"epi_isl_440671_England_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_440786_England_20200401_null_2":"background",
"epi_isl_440909_England_20200420_null_1":"background",
"epi_isl_440936_England_20200425_null_1":"background",
"epi_isl_440988_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_441119_England_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_441246_England_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_441414_Northern_Ireland_20200318_null_2":"background",
"epi_isl_441534_England_20200426_null_1":"background",
"epi_isl_441558_England_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_441658_England_20200404_null_3":"background",
"epi_isl_441860_England_20200420_null_1":"background",
"epi_isl_441879_England_20200430_null_1":"background",
"epi_isl_441881_England_20200430_null_3":"background",
"epi_isl_442091_England_20200405_null_8":"background",
"epi_isl_442117_England_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_442274_England_20200406_null_3":"background",
"epi_isl_442289_England_20200406_null_4":"background",
"epi_isl_442649_England_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_442747_England_20200407_null_2":"background",
"epi_isl_442958_England_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_442984_England_20200407_null_7":"background",
"epi_isl_443037_England_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_443107_England_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_443220_Singapore_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_443281_Bretagne_20200403_null_3":"background",
"epi_isl_443345_England_20200416_null_3":"background",
"epi_isl_443347_England_20200415_null_4":"background",
"epi_isl_443470_England_20200415_null_7":"background",
"epi_isl_443568_England_20200414_null_4":"background",
"epi_isl_443675_England_20200416_null_4":"background",
"epi_isl_443888_England_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_443946_England_20200326_null_2":"background",
"epi_isl_444012_England_20200326_null_4":"background",
"epi_isl_444015_England_20200325_null_3":"background",
"epi_isl_444026_California_20200501_null_10":"background",
"epi_isl_444097_England_20200406_null_7":"background",
"epi_isl_444168_England_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_444193_England_20200414_null_7":"background",
"epi_isl_444216_England_20200415_null_1":"background",
"epi_isl_444222_England_20200415_null_4":"background",
"epi_isl_444278_Taoyuan_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_444282_England_20200416_null_1":"background",
"epi_isl_444439_England_20200416_null_6":"background",
"epi_isl_444828_Unknown_20200311_null_202":"background",
"epi_isl_444924_Unknown_20200328_null_25":"background",
"epi_isl_445010_Florida_20200417_null_2":"background",
"epi_isl_445026_Florida_20200430_null_3":"background",
"epi_isl_445027_Florida_20200430_null_11":"background",
"epi_isl_445055_Luxembourg_20200422_null_2":"background",
"epi_isl_445062_Luxembourg_20200429_null_1":"background",
"epi_isl_445075_Luxembourg_20200508_null_7":"background",
"epi_isl_445132_Louisiana_20200402_null_2":"background",
"epi_isl_445234_Vastra_Gotaland_20200420_null_2":"background",
"epi_isl_445425_Wales_20200402_null_4":"background",
"epi_isl_445641_Wales_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_445704_Wales_20200412_null_73":"background",
"epi_isl_445736_Wales_20200413_null_1":"background",
"epi_isl_445816_Wales_20200329_null_3":"background",
"epi_isl_445870_Wales_20200408_null_7":"background",
"epi_isl_445900_Wales_20200331_null_5":"background",
"epi_isl_445941_Wales_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_446101_Wales_20200407_null_2":"background",
"epi_isl_446147_Wales_20200406_null_3":"background",
"epi_isl_446382_Wales_20200410_null_19":"background",
"epi_isl_446451_Wales_20200411_null_3":"background",
"epi_isl_446504_Wales_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_446729_Wales_20200414_null_1":"background",
"epi_isl_446758_Wales_20200420_null_1":"background",
"epi_isl_446803_Wales_20200416_null_8":"background",
"epi_isl_446912_Wales_20200417_null_4":"background",
"epi_isl_446938_Wales_20200418_null_2":"background",
"epi_isl_446942_Wales_20200418_null_18":"background",
"epi_isl_446979_Wales_20200416_null_14":"background",
"epi_isl_447010_Bangkok_20200329_null_12":"background",
"epi_isl_447061_Michigan_20200327_null_8":"background",
"epi_isl_447129_Li_ge_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_447162_Li_ge_20200419_null_7":"background",
"epi_isl_447212_Michigan_20200323_null_227":"background",
"epi_isl_447247_Kinshasa_20200425_null_2":"background",
"epi_isl_447251_Israel_20200309_null_4":"background",
"epi_isl_447276_South_Coast_District_20200325_null_2":"background",
"epi_isl_447427_Tel_Aviv_District_20200403_null_15":"background",
"epi_isl_447483_Comunitat_Valenciana_20200329_null_6":"background",
"epi_isl_447522_Comunitat_Valenciana_20200401_null_15":"background",
"epi_isl_447572_Telangana_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_447587_Tamil_Nadu_20200420_null_20":"background",
"epi_isl_447598_Kinshasa_20200422_null_15":"background",
"epi_isl_447700_France_20200301_null_1":"background",
"epi_isl_447710_France_20200301_null_313":"background",
"epi_isl_447750_Choco_20200330_null_4":"background",
"epi_isl_447752_Huila_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_447753_Huila_20200330_null_2":"background",
"epi_isl_447797_Cordoba_20200404_null_7":"background",
"epi_isl_447806_Huila_20200404_null_4":"background",
"epi_isl_447835_Athen_20200331_null_24927":"background"
}
},
"timers":{
"Model fitting":{
"order":1,
"timer":5
},
"Primary SLAC analysis":{
"order":2,
"timer":2
},
"Total time":{
"order":0,
"timer":7
}
}
}